RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581761.5

MKS1-211, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 3

Gene MKS1, Length 812 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-211ENST00000581761 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.11■■□□□ 1.29
MKS1-211ENST00000581761 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.1■■□□□ 1.29
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MKS1-211ENST00000581761 ARHGEF11O15085 1522 aa23.06■■□□□ 1.28
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MKS1-211ENST00000581761 CLIP1P30622 1438 aa23.04■■□□□ 1.28
MKS1-211ENST00000581761 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.01■■□□□ 1.27
MKS1-211ENST00000581761 NUP160Q12769 1436 aa22.98■■□□□ 1.27
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MKS1-211ENST00000581761 CEP170Q5SW79 1584 aa22.96■■□□□ 1.27
MKS1-211ENST00000581761 CUL7Q14999 1698 aa22.94■■□□□ 1.26
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MKS1-211ENST00000581761 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
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MKS1-211ENST00000581761 HRCP23327 699 aa22.43■■□□□ 1.18
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MKS1-211ENST00000581761 MAP3K1Q13233 1512 aa22.39■■□□□ 1.17
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MKS1-211ENST00000581761 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.05■■□□□ 1.12
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MKS1-211ENST00000581761 NCOA2Q15596 1464 aa21.97■■□□□ 1.11
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MKS1-211ENST00000581761 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.94■■□□□ 1.1
MKS1-211ENST00000581761 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.91■■□□□ 1.1
MKS1-211ENST00000581761 ITGAEP38570 1179 aa21.91■■□□□ 1.1
MKS1-211ENST00000581761 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.89■■□□□ 1.1
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MKS1-211ENST00000581761 GLI2P10070 1586 aa21.89■■□□□ 1.09
MKS1-211ENST00000581761 TSPOAP1O95153 1857 aa21.89■■□□□ 1.09
MKS1-211ENST00000581761 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
MKS1-211ENST00000581761 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
MKS1-211ENST00000581761 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
MKS1-211ENST00000581761 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.8■■□□□ 1.08
MKS1-211ENST00000581761 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.79■■□□□ 1.08
MKS1-211ENST00000581761 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.79■■□□□ 1.08
MKS1-211ENST00000581761 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
MKS1-211ENST00000581761 KDM6BO15054 1643 aa21.77■■□□□ 1.08
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