RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578365.1

MIR4449-201, Transcript of microRNA 4449, humanhuman

BASIC

Gene MIR4449, Length 66 nt, Biotype miRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIR4449-201ENST00000578365 KIF27Q86VH2 1401 aa44.75■■■■■ 4.76
MIR4449-201ENST00000578365 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa44.69■■■■■ 4.74
MIR4449-201ENST00000578365 CUL7Q14999 1698 aa44.67■■■■■ 4.74
MIR4449-201ENST00000578365 KIF13AQ9H1H9 1805 aa44.64■■■■■ 4.74
MIR4449-201ENST00000578365 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP44.52■■■■■ 4.72
MIR4449-201ENST00000578365 MAPKBP1O60336 1514 aa44.5■■■■■ 4.71
MIR4449-201ENST00000578365 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP44.5■■■■■ 4.714e-23■□□□□ 8.9
MIR4449-201ENST00000578365 ABCC10Q5T3U5 1492 aa44.48■■■■■ 4.71
MIR4449-201ENST00000578365 ADCY10Q96PN6 1610 aa44.48■■■■■ 4.71
MIR4449-201ENST00000578365 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.44■■■■■ 4.71
MIR4449-201ENST00000578365 FAM69CQ0P6D2 419 aa44.38■■■■■ 4.7
MIR4449-201ENST00000578365 DIP2BQ9P265 1576 aa44.33■■■■■ 4.69
MIR4449-201ENST00000578365 PTPRGP23470 1445 aa44.27■■■■■ 4.68
MIR4449-201ENST00000578365 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa44.23■■■■■ 4.67
MIR4449-201ENST00000578365 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.19■■■■■ 4.67
MIR4449-201ENST00000578365 IQGAP2Q13576 1575 aa44.19■■■■■ 4.66
MIR4449-201ENST00000578365 ABCC2Q92887 1545 aa44.08■■■■■ 4.65
MIR4449-201ENST00000578365 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.03■■■■■ 4.64
MIR4449-201ENST00000578365 DISP1Q96F81 1524 aa44.02■■■■■ 4.64
MIR4449-201ENST00000578365 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa44.01■■■■■ 4.64
MIR4449-201ENST00000578365 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.99■■■■■ 4.63
MIR4449-201ENST00000578365 UGGT2Q9NYU1 1516 aa43.95■■■■■ 4.63
MIR4449-201ENST00000578365 KDM6BO15054 1643 aa43.95■■■■■ 4.63
MIR4449-201ENST00000578365 UACAQ9BZF9 1416 aa43.93■■■■■ 4.62
MIR4449-201ENST00000578365 PLB1Q6P1J6 1458 aa43.93■■■■■ 4.62
MIR4449-201ENST00000578365 TSPOAP1O95153 1857 aa43.93■■■■■ 4.62
MIR4449-201ENST00000578365 ASXL2Q76L83 1435 aa43.91■■■■■ 4.62
MIR4449-201ENST00000578365 GLI2P10070 1586 aa43.86■■■■■ 4.61
MIR4449-201ENST00000578365 KDM5BQ9UGL1 1544 aa43.81■■■■■ 4.6
MIR4449-201ENST00000578365 KIAA0556O60303 1618 aa43.79■■■■■ 4.6
MIR4449-201ENST00000578365 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP43.71■■■■■ 4.59
MIR4449-201ENST00000578365 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP43.66■■■■■ 4.58
MIR4449-201ENST00000578365 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.64■■■■■ 4.58
MIR4449-201ENST00000578365 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP43.63■■■■■ 4.58
MIR4449-201ENST00000578365 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa43.61■■■■■ 4.57
MIR4449-201ENST00000578365 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa43.58■■■■■ 4.57
MIR4449-201ENST00000578365 GOLGA3Q08378 1498 aa43.57■■■■■ 4.57
MIR4449-201ENST00000578365 PRXQ9BXM0 1461 aa43.57■■■■■ 4.57
MIR4449-201ENST00000578365 TEX14Q8IWB6 1497 aa43.49■■■■■ 4.55
MIR4449-201ENST00000578365 WDR7Q9Y4E6 1490 aa43.48■■■■■ 4.55
MIR4449-201ENST00000578365 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP43.45■■■■■ 4.55
MIR4449-201ENST00000578365 ABCA8O94911 1581 aa43.42■■■■■ 4.54
MIR4449-201ENST00000578365 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa43.24■■■■■ 4.51
MIR4449-201ENST00000578365 CFAP43Q8NDM7 1665 aa43.22■■■■■ 4.51
MIR4449-201ENST00000578365 CD109Q6YHK3 1445 aa43.22■■■■■ 4.51
MIR4449-201ENST00000578365 ADGRL1O94910 1474 aa43.2■■■■■ 4.51
MIR4449-201ENST00000578365 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.16■■■■■ 4.5
MIR4449-201ENST00000578365 KCNH8Q96L42 1107 aa43.16■■■■■ 4.5
MIR4449-201ENST00000578365 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.15■■■■■ 4.5
MIR4449-201ENST00000578365 SAMD9Q5K651 1589 aa43.06■■■■■ 4.48
MIR4449-201ENST00000578365 ATP10BO94823 1461 aa43.06■■■■■ 4.48
MIR4449-201ENST00000578365 P3H3Q8IVL6 736 aa43.04■■■■■ 4.48
MIR4449-201ENST00000578365 EEA1Q15075 1411 aa42.99■■■■■ 4.47
MIR4449-201ENST00000578365 ARAP3Q8WWN8 1544 aa42.92■■■■■ 4.46
MIR4449-201ENST00000578365 ARID3CA6NKF2 412 aa42.91■■■■■ 4.46
MIR4449-201ENST00000578365 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.89■■■■■ 4.46
MIR4449-201ENST00000578365 ABCA9Q8IUA7 1624 aa42.89■■■■■ 4.46
MIR4449-201ENST00000578365 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42.85■■■■■ 4.45
MIR4449-201ENST00000578365 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP42.77■■■■■ 4.44
MIR4449-201ENST00000578365 NEO1Q92859 1461 aa42.7■■■■■ 4.43
MIR4449-201ENST00000578365 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.7■■■■■ 4.43
MIR4449-201ENST00000578365 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.68■■■■■ 4.42
MIR4449-201ENST00000578365 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP42.68■■■■■ 4.42
MIR4449-201ENST00000578365 KIF21BO75037 1637 aa42.68■■■■■ 4.42
MIR4449-201ENST00000578365 HECW2Q9P2P5 1572 aa42.65■■■■■ 4.42
MIR4449-201ENST00000578365 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.62■■■■■ 4.41
MIR4449-201ENST00000578365 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.61■■■■■ 4.41
MIR4449-201ENST00000578365 RAPGEF3O95398 923 aa42.56■■■■■ 4.4
MIR4449-201ENST00000578365 PLEKHD1A6NEE1 506 aa42.54■■■■■ 4.4
MIR4449-201ENST00000578365 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa42.49■■■■■ 4.39
MIR4449-201ENST00000578365 ADAMTSL3P82987 1691 aa42.42■■■■■ 4.38
MIR4449-201ENST00000578365 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP42.39■■■■■ 4.38
MIR4449-201ENST00000578365 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP42.39■■■■■ 4.38
MIR4449-201ENST00000578365 AKNAQ7Z591 1439 aa42.36■■■■■ 4.37
MIR4449-201ENST00000578365 FANCAO15360 1455 aa42.36■■■■■ 4.37
MIR4449-201ENST00000578365 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP42.36■■■■■ 4.37
MIR4449-201ENST00000578365 CFAP74Q9C0B2 1584 aa42.35■■■■■ 4.37
MIR4449-201ENST00000578365 PTPRMP28827 1452 aa42.34■■■■■ 4.37
MIR4449-201ENST00000578365 RICTORQ6R327 1708 aa42.32■■■■■ 4.36
MIR4449-201ENST00000578365 TTC37Q6PGP7 1564 aa42.31■■■■■ 4.36
MIR4449-201ENST00000578365 BCORL1Q5H9F3 1711 aa42.29■■■■■ 4.36
MIR4449-201ENST00000578365 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa42.29■■■■■ 4.36
MIR4449-201ENST00000578365 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.28■■■■■ 4.36
MIR4449-201ENST00000578365 FMN1Q68DA7 1419 aa42.24■■■■■ 4.35
MIR4449-201ENST00000578365 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.24■■■■■ 4.35
MIR4449-201ENST00000578365 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP42.22■■■■■ 4.35
MIR4449-201ENST00000578365 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa42.21■■■■■ 4.35
MIR4449-201ENST00000578365 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.18■■■■■ 4.34
MIR4449-201ENST00000578365 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.17■■■■■ 4.34
MIR4449-201ENST00000578365 MADDQ8WXG6 1647 aa42.17■■■■■ 4.34
MIR4449-201ENST00000578365 PLCH2O75038 1416 aa42.16■■■■■ 4.34
MIR4449-201ENST00000578365 HECW1Q76N89 1606 aa42.15■■■■■ 4.34
MIR4449-201ENST00000578365 MAGI2Q86UL8 1455 aa42.13■■■■■ 4.34
MIR4449-201ENST00000578365 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.08■■■■■ 4.33
MIR4449-201ENST00000578365 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa42.08■■■■■ 4.33
MIR4449-201ENST00000578365 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP42.07■■■■■ 4.33
MIR4449-201ENST00000578365 YEATS2Q9ULM3 1422 aa42.05■■■■■ 4.32
MIR4449-201ENST00000578365 POGZQ7Z3K3 1410 aa42.04■■■■■ 4.32
MIR4449-201ENST00000578365 SCAPERQ9BY12 1400 aa42.04■■■■■ 4.32
MIR4449-201ENST00000578365 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.03■■■■■ 4.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms