RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576635.6

SPNS2-208, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 3

Gene SPNS2, Length 901 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-208ENST00000576635 JPH4Q96JJ6 628 aa27.5■■□□□ 1.99
SPNS2-208ENST00000576635 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.36■■□□□ 1.97
SPNS2-208ENST00000576635 CUL7Q14999 1698 aa27.36■■□□□ 1.97
SPNS2-208ENST00000576635 MAPKBP1O60336 1514 aa27.33■■□□□ 1.97
SPNS2-208ENST00000576635 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.32■■□□□ 1.96
SPNS2-208ENST00000576635 IGF1RP08069 1367 aa27.32■■□□□ 1.96
SPNS2-208ENST00000576635 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.32■■□□□ 1.96
SPNS2-208ENST00000576635 KIF27Q86VH2 1401 aa27.31■■□□□ 1.96
SPNS2-208ENST00000576635 DIP2BQ9P265 1576 aa27.3■■□□□ 1.96
SPNS2-208ENST00000576635 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.27■■□□□ 1.96
SPNS2-208ENST00000576635 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.26■■□□□ 1.95
SPNS2-208ENST00000576635 TSPOAP1O95153 1857 aa27.17■■□□□ 1.94
SPNS2-208ENST00000576635 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.13■■□□□ 1.93
SPNS2-208ENST00000576635 KDM6BO15054 1643 aa27.12■■□□□ 1.93
SPNS2-208ENST00000576635 PTPRGP23470 1445 aa27.09■■□□□ 1.93
SPNS2-208ENST00000576635 IQGAP2Q13576 1575 aa27.08■■□□□ 1.93
SPNS2-208ENST00000576635 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
SPNS2-208ENST00000576635 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.04■■□□□ 1.92
SPNS2-208ENST00000576635 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.03■■□□□ 1.92
SPNS2-208ENST00000576635 ABCC2Q92887 1545 aa27.02■■□□□ 1.92
SPNS2-208ENST00000576635 DISP1Q96F81 1524 aa26.95■■□□□ 1.91
SPNS2-208ENST00000576635 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
SPNS2-208ENST00000576635 ASXL2Q76L83 1435 aa26.94■■□□□ 1.9
SPNS2-208ENST00000576635 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.93■■□□□ 1.9
SPNS2-208ENST00000576635 GLI2P10070 1586 aa26.92■■□□□ 1.9
SPNS2-208ENST00000576635 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.91■■□□□ 1.9
SPNS2-208ENST00000576635 UACAQ9BZF9 1416 aa26.9■■□□□ 1.9
SPNS2-208ENST00000576635 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.88■■□□□ 1.89
SPNS2-208ENST00000576635 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.87■■□□□ 1.89
SPNS2-208ENST00000576635 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.87■■□□□ 1.89
SPNS2-208ENST00000576635 KIAA0556O60303 1618 aa26.84■■□□□ 1.89
SPNS2-208ENST00000576635 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
SPNS2-208ENST00000576635 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.82■■□□□ 1.88
SPNS2-208ENST00000576635 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.8■■□□□ 1.88
SPNS2-208ENST00000576635 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
SPNS2-208ENST00000576635 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.79■■□□□ 1.88
SPNS2-208ENST00000576635 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
SPNS2-208ENST00000576635 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.67■■□□□ 1.86
SPNS2-208ENST00000576635 ADGRL1O94910 1474 aa26.66■■□□□ 1.86
SPNS2-208ENST00000576635 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.65■■□□□ 1.86
SPNS2-208ENST00000576635 ABCA8O94911 1581 aa26.6■■□□□ 1.85
SPNS2-208ENST00000576635 GOLGA3Q08378 1498 aa26.6■■□□□ 1.85
SPNS2-208ENST00000576635 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.56■■□□□ 1.84
SPNS2-208ENST00000576635 PRXQ9BXM0 1461 aa26.55■■□□□ 1.84
SPNS2-208ENST00000576635 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.49■■□□□ 1.83
SPNS2-208ENST00000576635 CD109Q6YHK3 1445 aa26.48■■□□□ 1.83
SPNS2-208ENST00000576635 KCNH8Q96L42 1107 aa26.46■■□□□ 1.83
SPNS2-208ENST00000576635 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.39■■□□□ 1.82
SPNS2-208ENST00000576635 KIF21BO75037 1637 aa26.36■■□□□ 1.81
SPNS2-208ENST00000576635 ARID3CA6NKF2 412 aa26.35■■□□□ 1.81
SPNS2-208ENST00000576635 P3H3Q8IVL6 736 aa26.35■■□□□ 1.81
SPNS2-208ENST00000576635 ATP10BO94823 1461 aa26.35■■□□□ 1.81
SPNS2-208ENST00000576635 SAMD9Q5K651 1589 aa26.34■■□□□ 1.81
SPNS2-208ENST00000576635 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.31■■□□□ 1.8
SPNS2-208ENST00000576635 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.29■■□□□ 1.8
SPNS2-208ENST00000576635 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.29■■□□□ 1.8
SPNS2-208ENST00000576635 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
SPNS2-208ENST00000576635 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
SPNS2-208ENST00000576635 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.23■■□□□ 1.79
SPNS2-208ENST00000576635 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
SPNS2-208ENST00000576635 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.16■■□□□ 1.78
SPNS2-208ENST00000576635 NEO1Q92859 1461 aa26.14■■□□□ 1.78
SPNS2-208ENST00000576635 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.13■■□□□ 1.77
SPNS2-208ENST00000576635 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.13■■□□□ 1.77
SPNS2-208ENST00000576635 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
SPNS2-208ENST00000576635 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
SPNS2-208ENST00000576635 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.12■■□□□ 1.77
SPNS2-208ENST00000576635 RAPGEF3O95398 923 aa26.11■■□□□ 1.77
SPNS2-208ENST00000576635 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
SPNS2-208ENST00000576635 EEA1Q15075 1411 aa26.1■■□□□ 1.77
SPNS2-208ENST00000576635 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.05■■□□□ 1.76
SPNS2-208ENST00000576635 PTPRMP28827 1452 aa26.04■■□□□ 1.76
SPNS2-208ENST00000576635 RICTORQ6R327 1708 aa26.02■■□□□ 1.76
SPNS2-208ENST00000576635 MADDQ8WXG6 1647 aa26.02■■□□□ 1.76
SPNS2-208ENST00000576635 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.99■■□□□ 1.75
SPNS2-208ENST00000576635 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.99■■□□□ 1.75
SPNS2-208ENST00000576635 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.98■■□□□ 1.75
SPNS2-208ENST00000576635 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.98■■□□□ 1.75
SPNS2-208ENST00000576635 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.98■■□□□ 1.75
SPNS2-208ENST00000576635 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.96■■□□□ 1.75
SPNS2-208ENST00000576635 FANCAO15360 1455 aa25.95■■□□□ 1.74
SPNS2-208ENST00000576635 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
SPNS2-208ENST00000576635 AKNAQ7Z591 1439 aa25.94■■□□□ 1.74
SPNS2-208ENST00000576635 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
SPNS2-208ENST00000576635 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
SPNS2-208ENST00000576635 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
SPNS2-208ENST00000576635 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.88■■□□□ 1.73
SPNS2-208ENST00000576635 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.88■■□□□ 1.73
SPNS2-208ENST00000576635 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
SPNS2-208ENST00000576635 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.85■■□□□ 1.73
SPNS2-208ENST00000576635 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.83■■□□□ 1.73
SPNS2-208ENST00000576635 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.81■■□□□ 1.72
SPNS2-208ENST00000576635 HECW1Q76N89 1606 aa25.81■■□□□ 1.72
SPNS2-208ENST00000576635 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.78■■□□□ 1.72
SPNS2-208ENST00000576635 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.77■■□□□ 1.72
SPNS2-208ENST00000576635 PLCH2O75038 1416 aa25.76■■□□□ 1.71
SPNS2-208ENST00000576635 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.76■■□□□ 1.71
SPNS2-208ENST00000576635 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.76■■□□□ 1.71
SPNS2-208ENST00000576635 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.76■■□□□ 1.71
SPNS2-208ENST00000576635 FBXO41Q8TF61 875 aa25.75■■□□□ 1.71
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