RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576380.5

P4HB-222, Transcript of prolyl 4-hydroxylase subunit beta, human

TSL 3

Gene P4HB, Length 943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
P4HB-222	ENST00000576380	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		34.4	■■■■□ 3.1
P4HB-222	ENST00000576380	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	34.38	■■■■□ 3.09
P4HB-222	ENST00000576380	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		34.35	■■■■□ 3.09
P4HB-222	ENST00000576380	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	34.23	■■■■□ 3.07
P4HB-222	ENST00000576380	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		34.2	■■■■□ 3.07
P4HB-222	ENST00000576380	IQGAP2	Q13576	1575 aa		34.04	■■■■□ 3.04
P4HB-222	ENST00000576380	PRX	Q9BXM0	1461 aa		34.01	■■■■□ 3.04
P4HB-222	ENST00000576380	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		34	■■■■□ 3.03
P4HB-222	ENST00000576380	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		33.98	■■■■□ 3.03
P4HB-222	ENST00000576380	PTPRG	P23470	1445 aa		33.95	■■■■□ 3.02
P4HB-222	ENST00000576380	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		33.92	■■■■□ 3.02
P4HB-222	ENST00000576380	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		33.91	■■■■□ 3.02
P4HB-222	ENST00000576380	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	33.9	■■■■□ 3.02
P4HB-222	ENST00000576380	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		33.89	■■■■□ 3.02
P4HB-222	ENST00000576380	DISP1	Q96F81	1524 aa		33.88	■■■■□ 3.01
P4HB-222	ENST00000576380	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	33.87	■■■■□ 3.01
P4HB-222	ENST00000576380	EEA1	Q15075	1411 aa		33.86	■■■■□ 3.01
P4HB-222	ENST00000576380	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		33.83	■■■■□ 3.01
P4HB-222	ENST00000576380	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		33.82	■■■■□ 3
P4HB-222	ENST00000576380	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	33.79	■■■■□ 3
P4HB-222	ENST00000576380	KIAA0556	O60303	1618 aa		33.71	■■■□□ 2.99
P4HB-222	ENST00000576380	UACA	Q9BZF9	1416 aa		33.68	■■■□□ 2.98
P4HB-222	ENST00000576380	MAPKBP1	O60336	1514 aa		33.68	■■■□□ 2.98
P4HB-222	ENST00000576380	GOLGA3	Q08378	1498 aa		33.66	■■■□□ 2.98
P4HB-222	ENST00000576380	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		33.65	■■■□□ 2.98
P4HB-222	ENST00000576380	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		33.64	■■■□□ 2.98
P4HB-222	ENST00000576380	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		33.63	■■■□□ 2.97
P4HB-222	ENST00000576380	ABCC2	Q92887	1545 aa		33.62	■■■□□ 2.97
P4HB-222	ENST00000576380	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		33.62	■■■□□ 2.97
P4HB-222	ENST00000576380	P3H3	Q8IVL6	736 aa		33.52	■■■□□ 2.96
P4HB-222	ENST00000576380	KIF21B	O75037	1637 aa		33.5	■■■□□ 2.95
P4HB-222	ENST00000576380	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		33.49	■■■□□ 2.95
P4HB-222	ENST00000576380	DIP2B	Q9P265	1576 aa		33.49	■■■□□ 2.95
P4HB-222	ENST00000576380	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		33.48	■■■□□ 2.95
P4HB-222	ENST00000576380	ASXL2	Q76L83	1435 aa		33.46	■■■□□ 2.95
P4HB-222	ENST00000576380	ABCA8	O94911	1581 aa		33.41	■■■□□ 2.94
P4HB-222	ENST00000576380	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	33.4	■■■□□ 2.94
P4HB-222	ENST00000576380	SAMD9	Q5K651	1589 aa		33.39	■■■□□ 2.94
P4HB-222	ENST00000576380	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	33.38	■■■□□ 2.93
P4HB-222	ENST00000576380	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		33.36	■■■□□ 2.93
P4HB-222	ENST00000576380	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	33.35	■■■□□ 2.93
P4HB-222	ENST00000576380	GLI2	P10070	1586 aa		33.29	■■■□□ 2.92
P4HB-222	ENST00000576380	TSPOAP1	O95153	1857 aa		33.29	■■■□□ 2.92
P4HB-222	ENST00000576380	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	33.26	■■■□□ 2.91
P4HB-222	ENST00000576380	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		33.2	■■■□□ 2.91
P4HB-222	ENST00000576380	ATP10B	O94823	1461 aa		33.2	■■■□□ 2.91
P4HB-222	ENST00000576380	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		33.2	■■■□□ 2.91
P4HB-222	ENST00000576380	ARID3C	A6NKF2	412 aa		33.19	■■■□□ 2.9
P4HB-222	ENST00000576380	KCNH8	Q96L42	1107 aa		33.17	■■■□□ 2.9
P4HB-222	ENST00000576380	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		33.17	■■■□□ 2.9
P4HB-222	ENST00000576380	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		33.14	■■■□□ 2.9
P4HB-222	ENST00000576380	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	33.1	■■■□□ 2.89
P4HB-222	ENST00000576380	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		33.1	■■■□□ 2.89
P4HB-222	ENST00000576380	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	33.05	■■■□□ 2.88
P4HB-222	ENST00000576380	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
P4HB-222	ENST00000576380	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
P4HB-222	ENST00000576380	KDM6B	O15054	1643 aa		33.04	■■■□□ 2.88
P4HB-222	ENST00000576380	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		33.02	■■■□□ 2.88
P4HB-222	ENST00000576380	CD109	Q6YHK3	1445 aa		33	■■■□□ 2.87
P4HB-222	ENST00000576380	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		32.97	■■■□□ 2.87
P4HB-222	ENST00000576380	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		32.95	■■■□□ 2.87
P4HB-222	ENST00000576380	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		32.94	■■■□□ 2.86
P4HB-222	ENST00000576380	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		32.92	■■■□□ 2.86
P4HB-222	ENST00000576380	FMN1	Q68DA7	1419 aa		32.92	■■■□□ 2.86
P4HB-222	ENST00000576380	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	32.91	■■■□□ 2.86
P4HB-222	ENST00000576380	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
P4HB-222	ENST00000576380	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		32.83	■■■□□ 2.85
P4HB-222	ENST00000576380	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	32.77	■■■□□ 2.84
P4HB-222	ENST00000576380	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
P4HB-222	ENST00000576380	HECW1	Q76N89	1606 aa		32.73	■■■□□ 2.83
P4HB-222	ENST00000576380	CLIP1	P30622	1438 aa		32.71	■■■□□ 2.83
P4HB-222	ENST00000576380	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	32.7	■■■□□ 2.83
P4HB-222	ENST00000576380	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		32.7	■■■□□ 2.82
P4HB-222	ENST00000576380	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		32.67	■■■□□ 2.82
P4HB-222	ENST00000576380	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	32.64	■■■□□ 2.82	1e-22	■■□□□ 13.7
P4HB-222	ENST00000576380	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		32.64	■■■□□ 2.82
P4HB-222	ENST00000576380	NEO1	Q92859	1461 aa		32.61	■■■□□ 2.81
P4HB-222	ENST00000576380	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		32.6	■■■□□ 2.81
P4HB-222	ENST00000576380	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		32.59	■■■□□ 2.81
P4HB-222	ENST00000576380	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		32.58	■■■□□ 2.81
P4HB-222	ENST00000576380	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
P4HB-222	ENST00000576380	RAPGEF3	O95398	923 aa		32.54	■■■□□ 2.8
P4HB-222	ENST00000576380	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		32.53	■■■□□ 2.8
P4HB-222	ENST00000576380	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	32.52	■■■□□ 2.8
P4HB-222	ENST00000576380	PLCH2	O75038	1416 aa		32.5	■■■□□ 2.79
P4HB-222	ENST00000576380	FANCA	O15360	1455 aa		32.49	■■■□□ 2.79
P4HB-222	ENST00000576380	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		32.49	■■■□□ 2.79
P4HB-222	ENST00000576380	AKNA	Q7Z591	1439 aa		32.49	■■■□□ 2.79
P4HB-222	ENST00000576380	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		32.48	■■■□□ 2.79
P4HB-222	ENST00000576380	CEP162	Q5TB80	1403 aa		32.47	■■■□□ 2.79
P4HB-222	ENST00000576380	KIF14	Q15058	1648 aa		32.43	■■■□□ 2.78
P4HB-222	ENST00000576380	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		32.41	■■■□□ 2.78
P4HB-222	ENST00000576380	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		32.41	■■■□□ 2.78
P4HB-222	ENST00000576380	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78
P4HB-222	ENST00000576380	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		32.37	■■■□□ 2.77
P4HB-222	ENST00000576380	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		32.35	■■■□□ 2.77
P4HB-222	ENST00000576380	ADGRL1	O94910	1474 aa		32.35	■■■□□ 2.77
P4HB-222	ENST00000576380	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		32.32	■■■□□ 2.76
P4HB-222	ENST00000576380	RICTOR	Q6R327	1708 aa		32.31	■■■□□ 2.76
P4HB-222	ENST00000576380	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		32.25	■■■□□ 2.75

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