RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574406.1

NLRP1-211, Transcript of NLR family pyrin domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene NLRP1, Length 1,750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1-211ENST00000574406 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.42■■□□□ 1.66
NLRP1-211ENST00000574406 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
NLRP1-211ENST00000574406 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.39■■□□□ 1.65
NLRP1-211ENST00000574406 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
NLRP1-211ENST00000574406 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.31■■□□□ 1.64
NLRP1-211ENST00000574406 APLP2Q06481 763 aa25.31■■□□□ 1.64
NLRP1-211ENST00000574406 SYNJ2O15056 1496 aa25.27■■□□□ 1.64
NLRP1-211ENST00000574406 GRIN2AQ12879 1464 aa25.27■■□□□ 1.64
NLRP1-211ENST00000574406 SAMD9Q5K651 1589 aa25.21■■□□□ 1.63
NLRP1-211ENST00000574406 IQGAP2Q13576 1575 aa25.2■■□□□ 1.62
NLRP1-211ENST00000574406 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
NLRP1-211ENST00000574406 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.18■■□□□ 1.62
NLRP1-211ENST00000574406 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
NLRP1-211ENST00000574406 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.17■■□□□ 1.62
NLRP1-211ENST00000574406 P3H3Q8IVL6 736 aa25.16■■□□□ 1.62
NLRP1-211ENST00000574406 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.12■■□□□ 1.61
NLRP1-211ENST00000574406 NUP160Q12769 1436 aa25.1■■□□□ 1.61
NLRP1-211ENST00000574406 CEP170Q5SW79 1584 aa25.09■■□□□ 1.61
NLRP1-211ENST00000574406 FMN1Q68DA7 1419 aa25.09■■□□□ 1.61
NLRP1-211ENST00000574406 HRCP23327 699 aa25.08■■□□□ 1.61
NLRP1-211ENST00000574406 FBLN2P98095 1184 aa25.08■■□□□ 1.61
NLRP1-211ENST00000574406 MAP3K1Q13233 1512 aa25.07■■□□□ 1.6
NLRP1-211ENST00000574406 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.05■■□□□ 1.6
NLRP1-211ENST00000574406 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
NLRP1-211ENST00000574406 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.04■■□□□ 1.6
NLRP1-211ENST00000574406 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
NLRP1-211ENST00000574406 TIAM1Q13009 1591 aa24.99■■□□□ 1.59
NLRP1-211ENST00000574406 DISP1Q96F81 1524 aa24.98■■□□□ 1.59
NLRP1-211ENST00000574406 KIAA0556O60303 1618 aa24.94■■□□□ 1.58
NLRP1-211ENST00000574406 CHD1O14646 1710 aa24.92■■□□□ 1.58
NLRP1-211ENST00000574406 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.92■■□□□ 1.58
NLRP1-211ENST00000574406 JPH4Q96JJ6 628 aa24.91■■□□□ 1.58
NLRP1-211ENST00000574406 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.89■■□□□ 1.58
NLRP1-211ENST00000574406 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
NLRP1-211ENST00000574406 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.85■■□□□ 1.57
NLRP1-211ENST00000574406 HECW1Q76N89 1606 aa24.8■■□□□ 1.56
NLRP1-211ENST00000574406 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.78■■□□□ 1.56
NLRP1-211ENST00000574406 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.77■■□□□ 1.56
NLRP1-211ENST00000574406 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
NLRP1-211ENST00000574406 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
NLRP1-211ENST00000574406 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
NLRP1-211ENST00000574406 SHROOM2Q13796 1616 aa24.73■■□□□ 1.55
NLRP1-211ENST00000574406 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
NLRP1-211ENST00000574406 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.7■■□□□ 1.54
NLRP1-211ENST00000574406 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.69■■□□□ 1.54
NLRP1-211ENST00000574406 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
NLRP1-211ENST00000574406 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.68■■□□□ 1.54
NLRP1-211ENST00000574406 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.68■■□□□ 1.54
NLRP1-211ENST00000574406 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
NLRP1-211ENST00000574406 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.66■■□□□ 1.54
NLRP1-211ENST00000574406 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.65■■□□□ 1.54
NLRP1-211ENST00000574406 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.64■■□□□ 1.53
NLRP1-211ENST00000574406 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
NLRP1-211ENST00000574406 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
NLRP1-211ENST00000574406 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.62■■□□□ 1.53
NLRP1-211ENST00000574406 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
NLRP1-211ENST00000574406 ABCA8O94911 1581 aa24.6■■□□□ 1.53
NLRP1-211ENST00000574406 PTPRGP23470 1445 aa24.59■■□□□ 1.53
NLRP1-211ENST00000574406 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
NLRP1-211ENST00000574406 NCOA2Q15596 1464 aa24.56■■□□□ 1.52
NLRP1-211ENST00000574406 ARHGEF11O15085 1522 aa24.56■■□□□ 1.52
NLRP1-211ENST00000574406 ARID3CA6NKF2 412 aa24.53■■□□□ 1.52
NLRP1-211ENST00000574406 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.52■■□□□ 1.52
NLRP1-211ENST00000574406 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
NLRP1-211ENST00000574406 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.51■■□□□ 1.51
NLRP1-211ENST00000574406 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.49■■□□□ 1.51
NLRP1-211ENST00000574406 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.48■■□□□ 1.51
NLRP1-211ENST00000574406 UACAQ9BZF9 1416 aa24.45■■□□□ 1.51
NLRP1-211ENST00000574406 ATP10BO94823 1461 aa24.45■■□□□ 1.5
NLRP1-211ENST00000574406 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
NLRP1-211ENST00000574406 OSCARQ8IYS5 282 aa24.44■■□□□ 1.5
NLRP1-211ENST00000574406 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
NLRP1-211ENST00000574406 ITGAEP38570 1179 aa24.41■■□□□ 1.5
NLRP1-211ENST00000574406 ABCC2Q92887 1545 aa24.37■■□□□ 1.49
NLRP1-211ENST00000574406 MIA2Q96PC5 1412 aa24.36■■□□□ 1.49
NLRP1-211ENST00000574406 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.35■■□□□ 1.49
NLRP1-211ENST00000574406 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.35■■□□□ 1.49
NLRP1-211ENST00000574406 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.34■■□□□ 1.49
NLRP1-211ENST00000574406 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
NLRP1-211ENST00000574406 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.32■■□□□ 1.48
NLRP1-211ENST00000574406 KIF14Q15058 1648 aa24.27■■□□□ 1.48
NLRP1-211ENST00000574406 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.27■■□□□ 1.48
NLRP1-211ENST00000574406 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.24■■□□□ 1.47
NLRP1-211ENST00000574406 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.23■■□□□ 1.47
NLRP1-211ENST00000574406 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
NLRP1-211ENST00000574406 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.23■■□□□ 1.47
NLRP1-211ENST00000574406 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.23■■□□□ 1.47
NLRP1-211ENST00000574406 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
NLRP1-211ENST00000574406 PTPRKQ15262 1439 aa24.21■■□□□ 1.47
NLRP1-211ENST00000574406 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.21■■□□□ 1.47
NLRP1-211ENST00000574406 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
NLRP1-211ENST00000574406 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
NLRP1-211ENST00000574406 HFM1A2PYH4 1435 aa24.13■■□□□ 1.45
NLRP1-211ENST00000574406 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.12■■□□□ 1.45
NLRP1-211ENST00000574406 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
NLRP1-211ENST00000574406 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.1■■□□□ 1.45
NLRP1-211ENST00000574406 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
NLRP1-211ENST00000574406 DAPK1P53355 1430 aa24.08■■□□□ 1.44
NLRP1-211ENST00000574406 AKNAQ7Z591 1439 aa24.08■■□□□ 1.44
NLRP1-211ENST00000574406 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.06■■□□□ 1.44
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