RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568485.1

E2F4-210, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 2

Gene E2F4, Length 707 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-210ENST00000568485 KIF27Q86VH2 1401 aa38.81■■■■□ 3.8
E2F4-210ENST00000568485 CUL7Q14999 1698 aa38.74■■■■□ 3.79
E2F4-210ENST00000568485 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.73■■■■□ 3.79
E2F4-210ENST00000568485 KIF13AQ9H1H9 1805 aa38.68■■■■□ 3.78
E2F4-210ENST00000568485 ADCY10Q96PN6 1610 aa38.59■■■■□ 3.77
E2F4-210ENST00000568485 MAPKBP1O60336 1514 aa38.57■■■■□ 3.76
E2F4-210ENST00000568485 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.55■■■■□ 3.76
E2F4-210ENST00000568485 ABCC10Q5T3U5 1492 aa38.54■■■■□ 3.76
E2F4-210ENST00000568485 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP38.5■■■■□ 3.75
E2F4-210ENST00000568485 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38.49■■■■□ 3.75
E2F4-210ENST00000568485 FAM69CQ0P6D2 419 aa38.45■■■■□ 3.75
E2F4-210ENST00000568485 DIP2BQ9P265 1576 aa38.44■■■■□ 3.74
E2F4-210ENST00000568485 PTPRGP23470 1445 aa38.36■■■■□ 3.73
E2F4-210ENST00000568485 IQGAP2Q13576 1575 aa38.33■■■■□ 3.73
E2F4-210ENST00000568485 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa38.3■■■■□ 3.72
E2F4-210ENST00000568485 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.3■■■■□ 3.72
E2F4-210ENST00000568485 ABCC2Q92887 1545 aa38.2■■■■□ 3.71
E2F4-210ENST00000568485 DISP1Q96F81 1524 aa38.2■■■■□ 3.71
E2F4-210ENST00000568485 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP38.19■■■■□ 3.7
E2F4-210ENST00000568485 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.19■■■■□ 3.7
E2F4-210ENST00000568485 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa38.14■■■■□ 3.7
E2F4-210ENST00000568485 UGGT2Q9NYU1 1516 aa38.12■■■■□ 3.69
E2F4-210ENST00000568485 KDM6BO15054 1643 aa38.09■■■■□ 3.69
E2F4-210ENST00000568485 UACAQ9BZF9 1416 aa38.09■■■■□ 3.69
E2F4-210ENST00000568485 ASXL2Q76L83 1435 aa38.07■■■■□ 3.69
E2F4-210ENST00000568485 TSPOAP1O95153 1857 aa38.07■■■■□ 3.68
E2F4-210ENST00000568485 PLB1Q6P1J6 1458 aa38.04■■■■□ 3.68
E2F4-210ENST00000568485 KIAA0556O60303 1618 aa38.01■■■■□ 3.67
E2F4-210ENST00000568485 GLI2P10070 1586 aa38■■■■□ 3.67
E2F4-210ENST00000568485 KDM5BQ9UGL1 1544 aa37.97■■■■□ 3.67
E2F4-210ENST00000568485 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP37.92■■■■□ 3.66
E2F4-210ENST00000568485 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP37.86■■■■□ 3.65
E2F4-210ENST00000568485 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP37.86■■■■□ 3.65
E2F4-210ENST00000568485 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.85■■■■□ 3.65
E2F4-210ENST00000568485 PRXQ9BXM0 1461 aa37.82■■■■□ 3.64
E2F4-210ENST00000568485 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa37.79■■■■□ 3.64
E2F4-210ENST00000568485 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa37.78■■■■□ 3.64
E2F4-210ENST00000568485 GOLGA3Q08378 1498 aa37.75■■■■□ 3.63
E2F4-210ENST00000568485 WDR7Q9Y4E6 1490 aa37.7■■■■□ 3.63
E2F4-210ENST00000568485 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP37.69■■■■□ 3.62
E2F4-210ENST00000568485 ABCA8O94911 1581 aa37.68■■■■□ 3.62
E2F4-210ENST00000568485 TEX14Q8IWB6 1497 aa37.64■■■■□ 3.62
E2F4-210ENST00000568485 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa37.46■■■■□ 3.59
E2F4-210ENST00000568485 ADGRL1O94910 1474 aa37.46■■■■□ 3.59
E2F4-210ENST00000568485 CFAP43Q8NDM7 1665 aa37.45■■■■□ 3.59
E2F4-210ENST00000568485 CD109Q6YHK3 1445 aa37.44■■■■□ 3.58
E2F4-210ENST00000568485 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.43■■■■□ 3.58
E2F4-210ENST00000568485 KCNH8Q96L42 1107 aa37.41■■■■□ 3.58
E2F4-210ENST00000568485 SAMD9Q5K651 1589 aa37.38■■■■□ 3.57
E2F4-210ENST00000568485 P3H3Q8IVL6 736 aa37.37■■■■□ 3.57
E2F4-210ENST00000568485 ATP10BO94823 1461 aa37.35■■■■□ 3.57
E2F4-210ENST00000568485 EEA1Q15075 1411 aa37.28■■■■□ 3.56
E2F4-210ENST00000568485 ARID3CA6NKF2 412 aa37.28■■■■□ 3.56
E2F4-210ENST00000568485 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.28■■■■□ 3.56
E2F4-210ENST00000568485 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa37.21■■■■□ 3.55
E2F4-210ENST00000568485 ABCA9Q8IUA7 1624 aa37.18■■■■□ 3.54
E2F4-210ENST00000568485 ARAP3Q8WWN8 1544 aa37.17■■■■□ 3.54
E2F4-210ENST00000568485 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.12■■■■□ 3.53
E2F4-210ENST00000568485 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.1■■■■□ 3.53
E2F4-210ENST00000568485 PHLDB1Q86UU1 1377 aa37.05■■■■□ 3.52
E2F4-210ENST00000568485 KIF21BO75037 1637 aa37.03■■■■□ 3.52
E2F4-210ENST00000568485 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.03■■■■□ 3.52
E2F4-210ENST00000568485 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP37■■■■□ 3.51
E2F4-210ENST00000568485 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP37■■■■□ 3.51
E2F4-210ENST00000568485 NEO1Q92859 1461 aa37■■■■□ 3.51
E2F4-210ENST00000568485 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.97■■■■□ 3.51
E2F4-210ENST00000568485 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.96■■■■□ 3.51
E2F4-210ENST00000568485 RAPGEF3O95398 923 aa36.9■■■■□ 3.5
E2F4-210ENST00000568485 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.89■■■■□ 3.5
E2F4-210ENST00000568485 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.85■■■■□ 3.49
E2F4-210ENST00000568485 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.79■■■■□ 3.488e-9■■■■■ 57.3
E2F4-210ENST00000568485 ADAMTSL3P82987 1691 aa36.77■■■■□ 3.48
E2F4-210ENST00000568485 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.73■■■■□ 3.47
E2F4-210ENST00000568485 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.73■■■■□ 3.47
E2F4-210ENST00000568485 FANCAO15360 1455 aa36.72■■■■□ 3.47
E2F4-210ENST00000568485 AKNAQ7Z591 1439 aa36.72■■■■□ 3.47
E2F4-210ENST00000568485 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.71■■■■□ 3.47
E2F4-210ENST00000568485 PTPRMP28827 1452 aa36.69■■■■□ 3.46
E2F4-210ENST00000568485 RICTORQ6R327 1708 aa36.69■■■■□ 3.46
E2F4-210ENST00000568485 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP36.69■■■■□ 3.46
E2F4-210ENST00000568485 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.69■■■■□ 3.46
E2F4-210ENST00000568485 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.68■■■■□ 3.46
E2F4-210ENST00000568485 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.66■■■■□ 3.46
E2F4-210ENST00000568485 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.65■■■■□ 3.46
E2F4-210ENST00000568485 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.64■■■■□ 3.46
E2F4-210ENST00000568485 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
E2F4-210ENST00000568485 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.63■■■■□ 3.45
E2F4-210ENST00000568485 FMN1Q68DA7 1419 aa36.61■■■■□ 3.45
E2F4-210ENST00000568485 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.59■■■■□ 3.45
E2F4-210ENST00000568485 MADDQ8WXG6 1647 aa36.59■■■■□ 3.45
E2F4-210ENST00000568485 HECW1Q76N89 1606 aa36.58■■■■□ 3.45
E2F4-210ENST00000568485 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
E2F4-210ENST00000568485 PLCH2O75038 1416 aa36.55■■■■□ 3.44
E2F4-210ENST00000568485 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.5■■■■□ 3.43
E2F4-210ENST00000568485 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.49■■■■□ 3.43
E2F4-210ENST00000568485 MAGI2Q86UL8 1455 aa36.48■■■■□ 3.43
E2F4-210ENST00000568485 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.47■■■■□ 3.43
E2F4-210ENST00000568485 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.46■■■■□ 3.43
E2F4-210ENST00000568485 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.45■■■■□ 3.43
E2F4-210ENST00000568485 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa36.44■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms