RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567987.5

INO80E-211, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene INO80E, Length 1,926 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-211ENST00000567987 GRIN2AQ12879 1464 aa29.69■■■□□ 2.34
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INO80E-211ENST00000567987 FBLN2P98095 1184 aa29.65■■■□□ 2.34
INO80E-211ENST00000567987 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.64■■■□□ 2.34
INO80E-211ENST00000567987 IQGAP2Q13576 1575 aa29.55■■■□□ 2.32
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INO80E-211ENST00000567987 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.54■■■□□ 2.32
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INO80E-211ENST00000567987 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.47■■■□□ 2.31
INO80E-211ENST00000567987 CHD1O14646 1710 aa29.45■■■□□ 2.3
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INO80E-211ENST00000567987 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.22■■■□□ 2.27
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INO80E-211ENST00000567987 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
INO80E-211ENST00000567987 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.15■■■□□ 2.26
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INO80E-211ENST00000567987 MAP3K1Q13233 1512 aa29.12■■■□□ 2.25
INO80E-211ENST00000567987 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
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INO80E-211ENST00000567987 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.96■■■□□ 2.23
INO80E-211ENST00000567987 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.94■■■□□ 2.22
INO80E-211ENST00000567987 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.93■■■□□ 2.22
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INO80E-211ENST00000567987 OSCARQ8IYS5 282 aa28.92■■■□□ 2.22
INO80E-211ENST00000567987 ARID3CA6NKF2 412 aa28.9■■■□□ 2.22
INO80E-211ENST00000567987 PTPRGP23470 1445 aa28.9■■■□□ 2.22
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INO80E-211ENST00000567987 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.35■■■□□ 2.13
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INO80E-211ENST00000567987 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
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INO80E-211ENST00000567987 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.29■■■□□ 2.12
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INO80E-211ENST00000567987 KCNH8Q96L42 1107 aa28.28■■■□□ 2.12
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INO80E-211ENST00000567987 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
INO80E-211ENST00000567987 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.23■■■□□ 2.11
INO80E-211ENST00000567987 PTPRKQ15262 1439 aa28.23■■■□□ 2.11
INO80E-211ENST00000567987 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.22■■■□□ 2.11
INO80E-211ENST00000567987 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.22■■■□□ 2.11
INO80E-211ENST00000567987 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.21■■■□□ 2.11
INO80E-211ENST00000567987 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.11
INO80E-211ENST00000567987 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.11
INO80E-211ENST00000567987 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.2■■■□□ 2.1
INO80E-211ENST00000567987 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.19■■■□□ 2.1
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