RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564566.1

USP10-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

TSL 4

Gene USP10, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-211ENST00000564566 JPH4Q96JJ6 628 aa30.14■■■□□ 2.42
USP10-211ENST00000564566 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.97■■■□□ 2.39
USP10-211ENST00000564566 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.97■■■□□ 2.39
USP10-211ENST00000564566 CUL7Q14999 1698 aa29.95■■■□□ 2.39
USP10-211ENST00000564566 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.95■■■□□ 2.39
USP10-211ENST00000564566 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.94■■■□□ 2.38
USP10-211ENST00000564566 MAPKBP1O60336 1514 aa29.94■■■□□ 2.38
USP10-211ENST00000564566 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.91■■■□□ 2.38
USP10-211ENST00000564566 DIP2BQ9P265 1576 aa29.91■■■□□ 2.38
USP10-211ENST00000564566 KIF27Q86VH2 1401 aa29.91■■■□□ 2.38
USP10-211ENST00000564566 IGF1RP08069 1367 aa29.89■■■□□ 2.37
USP10-211ENST00000564566 TSPOAP1O95153 1857 aa29.79■■■□□ 2.36
USP10-211ENST00000564566 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
USP10-211ENST00000564566 KDM6BO15054 1643 aa29.77■■■□□ 2.36
USP10-211ENST00000564566 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.72■■■□□ 2.35
USP10-211ENST00000564566 PTPRGP23470 1445 aa29.71■■■□□ 2.35
USP10-211ENST00000564566 IQGAP2Q13576 1575 aa29.66■■■□□ 2.34
USP10-211ENST00000564566 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.66■■■□□ 2.34
USP10-211ENST00000564566 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.63■■■□□ 2.33
USP10-211ENST00000564566 ABCC2Q92887 1545 aa29.61■■■□□ 2.33
USP10-211ENST00000564566 ASXL2Q76L83 1435 aa29.54■■■□□ 2.32
USP10-211ENST00000564566 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.5■■■□□ 2.31
USP10-211ENST00000564566 DISP1Q96F81 1524 aa29.5■■■□□ 2.31
USP10-211ENST00000564566 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
USP10-211ENST00000564566 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.48■■■□□ 2.31
USP10-211ENST00000564566 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.48■■■□□ 2.31
USP10-211ENST00000564566 UACAQ9BZF9 1416 aa29.47■■■□□ 2.31
USP10-211ENST00000564566 GLI2P10070 1586 aa29.47■■■□□ 2.31
USP10-211ENST00000564566 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.44■■■□□ 2.3
USP10-211ENST00000564566 KIAA0556O60303 1618 aa29.41■■■□□ 2.3
USP10-211ENST00000564566 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.4■■■□□ 2.3
USP10-211ENST00000564566 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
USP10-211ENST00000564566 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.36■■■□□ 2.29
USP10-211ENST00000564566 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
USP10-211ENST00000564566 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.35■■■□□ 2.29
USP10-211ENST00000564566 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.31■■■□□ 2.28
USP10-211ENST00000564566 ADGRL1O94910 1474 aa29.27■■■□□ 2.28
USP10-211ENST00000564566 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.27■■■□□ 2.28
USP10-211ENST00000564566 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
USP10-211ENST00000564566 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.21■■■□□ 2.27
USP10-211ENST00000564566 GOLGA3Q08378 1498 aa29.16■■■□□ 2.26
USP10-211ENST00000564566 ABCA8O94911 1581 aa29.12■■■□□ 2.25
USP10-211ENST00000564566 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.09■■■□□ 2.25
USP10-211ENST00000564566 KCNH8Q96L42 1107 aa29.06■■■□□ 2.24
USP10-211ENST00000564566 CD109Q6YHK3 1445 aa29.05■■■□□ 2.24
USP10-211ENST00000564566 PRXQ9BXM0 1461 aa29.04■■■□□ 2.24
USP10-211ENST00000564566 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.02■■■□□ 2.24
USP10-211ENST00000564566 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.97■■■□□ 2.23
USP10-211ENST00000564566 ARID3CA6NKF2 412 aa28.97■■■□□ 2.23
USP10-211ENST00000564566 P3H3Q8IVL6 736 aa28.93■■■□□ 2.22
USP10-211ENST00000564566 KIF21BO75037 1637 aa28.91■■■□□ 2.22
USP10-211ENST00000564566 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
USP10-211ENST00000564566 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
USP10-211ENST00000564566 ATP10BO94823 1461 aa28.85■■■□□ 2.21
USP10-211ENST00000564566 SAMD9Q5K651 1589 aa28.81■■■□□ 2.2
USP10-211ENST00000564566 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.8■■■□□ 2.2
USP10-211ENST00000564566 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.8■■■□□ 2.2
USP10-211ENST00000564566 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.79■■■□□ 2.2
USP10-211ENST00000564566 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
USP10-211ENST00000564566 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
USP10-211ENST00000564566 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.72■■■□□ 2.19
USP10-211ENST00000564566 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
USP10-211ENST00000564566 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.65■■■□□ 2.18
USP10-211ENST00000564566 RAPGEF3O95398 923 aa28.65■■■□□ 2.18
USP10-211ENST00000564566 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
USP10-211ENST00000564566 NEO1Q92859 1461 aa28.64■■■□□ 2.17
USP10-211ENST00000564566 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.63■■■□□ 2.17
USP10-211ENST00000564566 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.62■■■□□ 2.17
USP10-211ENST00000564566 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.61■■■□□ 2.17
USP10-211ENST00000564566 PTPRMP28827 1452 aa28.57■■■□□ 2.16
USP10-211ENST00000564566 EEA1Q15075 1411 aa28.56■■■□□ 2.16
USP10-211ENST00000564566 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.55■■■□□ 2.16
USP10-211ENST00000564566 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
USP10-211ENST00000564566 MADDQ8WXG6 1647 aa28.53■■■□□ 2.16
USP10-211ENST00000564566 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.49■■■□□ 2.15
USP10-211ENST00000564566 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.48■■■□□ 2.15
USP10-211ENST00000564566 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.48■■■□□ 2.15
USP10-211ENST00000564566 RICTORQ6R327 1708 aa28.48■■■□□ 2.15
USP10-211ENST00000564566 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
USP10-211ENST00000564566 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.46■■■□□ 2.15
USP10-211ENST00000564566 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.45■■■□□ 2.15
USP10-211ENST00000564566 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.45■■■□□ 2.151e-6■■■□□ 18.3
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USP10-211ENST00000564566 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
USP10-211ENST00000564566 AKNAQ7Z591 1439 aa28.43■■■□□ 2.14
USP10-211ENST00000564566 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
USP10-211ENST00000564566 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
USP10-211ENST00000564566 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.34■■■□□ 2.13
USP10-211ENST00000564566 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.34■■■□□ 2.13
USP10-211ENST00000564566 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.34■■■□□ 2.13
USP10-211ENST00000564566 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.33■■■□□ 2.13
USP10-211ENST00000564566 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.33■■■□□ 2.13
USP10-211ENST00000564566 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.32■■■□□ 2.12
USP10-211ENST00000564566 FBXO41Q8TF61 875 aa28.31■■■□□ 2.12
USP10-211ENST00000564566 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.3■■■□□ 2.12
USP10-211ENST00000564566 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.29■■■□□ 2.12
USP10-211ENST00000564566 HECW1Q76N89 1606 aa28.29■■■□□ 2.12
USP10-211ENST00000564566 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
USP10-211ENST00000564566 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.24■■■□□ 2.11
USP10-211ENST00000564566 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.23■■■□□ 2.11
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