RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562222.5

PPP4C-203, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 3

Gene PPP4C, Length 742 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-203ENST00000562222 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.68■■■■■ 4.1
PPP4C-203ENST00000562222 CUL7Q14999 1698 aa40.68■■■■■ 4.1
PPP4C-203ENST00000562222 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.65■■■■■ 4.1
PPP4C-203ENST00000562222 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.62■■■■■ 4.09
PPP4C-203ENST00000562222 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.32■■■■■ 4.05
PPP4C-203ENST00000562222 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.31■■■■■ 4.04
PPP4C-203ENST00000562222 PTPRGP23470 1445 aa40.23■■■■■ 4.03
PPP4C-203ENST00000562222 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.23■■■■■ 4.03
PPP4C-203ENST00000562222 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.21■■■■■ 4.03
PPP4C-203ENST00000562222 IQGAP2Q13576 1575 aa40.21■■■■■ 4.03
PPP4C-203ENST00000562222 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.16■■■■■ 4.02
PPP4C-203ENST00000562222 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.14■■■■■ 4.02
PPP4C-203ENST00000562222 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.07■■■■■ 4.01
PPP4C-203ENST00000562222 MAPKBP1O60336 1514 aa40.03■■■■■ 4
PPP4C-203ENST00000562222 DISP1Q96F81 1524 aa40.03■■■■■ 4
PPP4C-203ENST00000562222 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40■■■■□ 3.99
PPP4C-203ENST00000562222 UGGT2Q9NYU1 1516 aa39.99■■■■□ 3.99
PPP4C-203ENST00000562222 PRXQ9BXM0 1461 aa39.98■■■■□ 3.99
PPP4C-203ENST00000562222 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.97■■■■□ 3.99
PPP4C-203ENST00000562222 UACAQ9BZF9 1416 aa39.9■■■■□ 3.98
PPP4C-203ENST00000562222 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.89■■■■□ 3.98
PPP4C-203ENST00000562222 ABCC2Q92887 1545 aa39.87■■■■□ 3.97
PPP4C-203ENST00000562222 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa39.85■■■■□ 3.97
PPP4C-203ENST00000562222 DIP2BQ9P265 1576 aa39.83■■■■□ 3.97
PPP4C-203ENST00000562222 KIAA0556O60303 1618 aa39.83■■■■□ 3.97
PPP4C-203ENST00000562222 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.79■■■■□ 3.96
PPP4C-203ENST00000562222 GOLGA3Q08378 1498 aa39.75■■■■□ 3.95
PPP4C-203ENST00000562222 ASXL2Q76L83 1435 aa39.73■■■■□ 3.95
PPP4C-203ENST00000562222 PLB1Q6P1J6 1458 aa39.7■■■■□ 3.95
PPP4C-203ENST00000562222 EEA1Q15075 1411 aa39.68■■■■□ 3.94
PPP4C-203ENST00000562222 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39.66■■■■□ 3.94
PPP4C-203ENST00000562222 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.65■■■■□ 3.94
PPP4C-203ENST00000562222 P3H3Q8IVL6 736 aa39.57■■■■□ 3.93
PPP4C-203ENST00000562222 TSPOAP1O95153 1857 aa39.54■■■■□ 3.92
PPP4C-203ENST00000562222 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP39.51■■■■□ 3.91
PPP4C-203ENST00000562222 GLI2P10070 1586 aa39.5■■■■□ 3.91
PPP4C-203ENST00000562222 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.5■■■■□ 3.91
PPP4C-203ENST00000562222 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.5■■■■□ 3.91
PPP4C-203ENST00000562222 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP39.47■■■■□ 3.91
PPP4C-203ENST00000562222 ABCA8O94911 1581 aa39.46■■■■□ 3.91
PPP4C-203ENST00000562222 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.41■■■■□ 3.9
PPP4C-203ENST00000562222 KDM6BO15054 1643 aa39.4■■■■□ 3.9
PPP4C-203ENST00000562222 WDR7Q9Y4E6 1490 aa39.37■■■■□ 3.89
PPP4C-203ENST00000562222 KCNH8Q96L42 1107 aa39.34■■■■□ 3.89
PPP4C-203ENST00000562222 ARID3CA6NKF2 412 aa39.32■■■■□ 3.89
PPP4C-203ENST00000562222 SAMD9Q5K651 1589 aa39.31■■■■□ 3.88
PPP4C-203ENST00000562222 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP39.29■■■■□ 3.88
PPP4C-203ENST00000562222 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.25■■■■□ 3.87
PPP4C-203ENST00000562222 KIF21BO75037 1637 aa39.25■■■■□ 3.87
PPP4C-203ENST00000562222 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.22■■■■□ 3.87
PPP4C-203ENST00000562222 ATP10BO94823 1461 aa39.22■■■■□ 3.87
PPP4C-203ENST00000562222 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.2■■■■□ 3.87
PPP4C-203ENST00000562222 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.17■■■■□ 3.86
PPP4C-203ENST00000562222 FHOD3Q2V2M9 1422 aa39.16■■■■□ 3.86
PPP4C-203ENST00000562222 CD109Q6YHK3 1445 aa39.15■■■■□ 3.86
PPP4C-203ENST00000562222 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.13■■■■□ 3.85
PPP4C-203ENST00000562222 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.13■■■■□ 3.85
PPP4C-203ENST00000562222 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP39.13■■■■□ 3.85
PPP4C-203ENST00000562222 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39.1■■■■□ 3.85
PPP4C-203ENST00000562222 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.05■■■■□ 3.84
PPP4C-203ENST00000562222 EFCAB5A4FU69 1503 aa39.02■■■■□ 3.84
PPP4C-203ENST00000562222 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.02■■■■□ 3.84
PPP4C-203ENST00000562222 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP39.01■■■■□ 3.84
PPP4C-203ENST00000562222 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa38.99■■■■□ 3.83
PPP4C-203ENST00000562222 PLEKHD1A6NEE1 506 aa38.91■■■■□ 3.82
PPP4C-203ENST00000562222 ABCA9Q8IUA7 1624 aa38.82■■■■□ 3.81
PPP4C-203ENST00000562222 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.79■■■■□ 3.8
PPP4C-203ENST00000562222 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP38.78■■■■□ 3.8
PPP4C-203ENST00000562222 PHLDB1Q86UU1 1377 aa38.76■■■■□ 3.8
PPP4C-203ENST00000562222 FMN1Q68DA7 1419 aa38.75■■■■□ 3.79
PPP4C-203ENST00000562222 ARAP3Q8WWN8 1544 aa38.73■■■■□ 3.79
PPP4C-203ENST00000562222 ADGRL1O94910 1474 aa38.67■■■■□ 3.78
PPP4C-203ENST00000562222 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP38.66■■■■□ 3.78
PPP4C-203ENST00000562222 NEO1Q92859 1461 aa38.66■■■■□ 3.78
PPP4C-203ENST00000562222 RAPGEF3O95398 923 aa38.63■■■■□ 3.77
PPP4C-203ENST00000562222 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP38.57■■■■□ 3.76
PPP4C-203ENST00000562222 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP38.57■■■■□ 3.761e-10■■□□□ 13.3
PPP4C-203ENST00000562222 HECW1Q76N89 1606 aa38.55■■■■□ 3.76
PPP4C-203ENST00000562222 AKNAQ7Z591 1439 aa38.48■■■■□ 3.75
PPP4C-203ENST00000562222 FANCAO15360 1455 aa38.47■■■■□ 3.75
PPP4C-203ENST00000562222 TTC37Q6PGP7 1564 aa38.46■■■■□ 3.75
PPP4C-203ENST00000562222 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP38.41■■■■□ 3.74
PPP4C-203ENST00000562222 PLCH2O75038 1416 aa38.4■■■■□ 3.74
PPP4C-203ENST00000562222 CLIP1P30622 1438 aa38.37■■■■□ 3.73
PPP4C-203ENST00000562222 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa38.37■■■■□ 3.73
PPP4C-203ENST00000562222 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP38.36■■■■□ 3.73
PPP4C-203ENST00000562222 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa38.36■■■■□ 3.73
PPP4C-203ENST00000562222 CFAP74Q9C0B2 1584 aa38.34■■■■□ 3.73
PPP4C-203ENST00000562222 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa38.32■■■■□ 3.72
PPP4C-203ENST00000562222 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP38.27■■■■□ 3.72
PPP4C-203ENST00000562222 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP38.27■■■■□ 3.72
PPP4C-203ENST00000562222 SCAPERQ9BY12 1400 aa38.26■■■■□ 3.72
PPP4C-203ENST00000562222 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa38.26■■■■□ 3.71
PPP4C-203ENST00000562222 KIF14Q15058 1648 aa38.25■■■■□ 3.71
PPP4C-203ENST00000562222 CCDC18Q5T9S5 1454 aa38.24■■■■□ 3.71
PPP4C-203ENST00000562222 RICTORQ6R327 1708 aa38.23■■■■□ 3.71
PPP4C-203ENST00000562222 FYCO1Q9BQS8 1478 aa38.18■■■■□ 3.7
PPP4C-203ENST00000562222 MYO5CQ9NQX4 1742 aa38.17■■■■□ 3.7
PPP4C-203ENST00000562222 POGZQ7Z3K3 1410 aa38.14■■■■□ 3.7
PPP4C-203ENST00000562222 ARHGAP5Q13017 1502 aa38.12■■■■□ 3.69
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