RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561983.5

RHOT2-204, Transcript of ras homolog family member T2, human

TSL 5

Gene RHOT2, Length 1,044 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RHOT2-204	ENST00000561983	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	41.97	■■■■■ 4.31
RHOT2-204	ENST00000561983	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		41.93	■■■■■ 4.3
RHOT2-204	ENST00000561983	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		41.9	■■■■■ 4.3
RHOT2-204	ENST00000561983	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		41.85	■■■■■ 4.29
RHOT2-204	ENST00000561983	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		41.59	■■■■■ 4.25
RHOT2-204	ENST00000561983	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	41.56	■■■■■ 4.24
RHOT2-204	ENST00000561983	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		41.5	■■■■■ 4.23
RHOT2-204	ENST00000561983	IQGAP2	Q13576	1575 aa		41.48	■■■■■ 4.23
RHOT2-204	ENST00000561983	PTPRG	P23470	1445 aa		41.43	■■■■■ 4.22
RHOT2-204	ENST00000561983	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	41.42	■■■■■ 4.22
RHOT2-204	ENST00000561983	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		41.37	■■■■■ 4.21
RHOT2-204	ENST00000561983	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		41.32	■■■■■ 4.2
RHOT2-204	ENST00000561983	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		41.23	■■■■■ 4.19
RHOT2-204	ENST00000561983	DISP1	Q96F81	1524 aa		41.22	■■■■■ 4.19
RHOT2-204	ENST00000561983	PRX	Q9BXM0	1461 aa		41.21	■■■■■ 4.19
RHOT2-204	ENST00000561983	MAPKBP1	O60336	1514 aa		41.21	■■■■■ 4.19
RHOT2-204	ENST00000561983	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		41.2	■■■■■ 4.19
RHOT2-204	ENST00000561983	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		41.17	■■■■■ 4.18
RHOT2-204	ENST00000561983	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		41.16	■■■■■ 4.18
RHOT2-204	ENST00000561983	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		41.14	■■■■■ 4.18
RHOT2-204	ENST00000561983	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		41.13	■■■■■ 4.18
RHOT2-204	ENST00000561983	UACA	Q9BZF9	1416 aa		41.09	■■■■■ 4.17
RHOT2-204	ENST00000561983	KIAA0556	O60303	1618 aa		41.07	■■■■■ 4.16
RHOT2-204	ENST00000561983	ABCC2	Q92887	1545 aa		41.06	■■■■■ 4.16
RHOT2-204	ENST00000561983	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		41.04	■■■■■ 4.16
RHOT2-204	ENST00000561983	GOLGA3	Q08378	1498 aa		41.03	■■■■■ 4.16
RHOT2-204	ENST00000561983	EEA1	Q15075	1411 aa		41.02	■■■■■ 4.16
RHOT2-204	ENST00000561983	DIP2B	Q9P265	1576 aa		40.99	■■■■■ 4.15
RHOT2-204	ENST00000561983	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	40.93	■■■■■ 4.14
RHOT2-204	ENST00000561983	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		40.9	■■■■■ 4.14
RHOT2-204	ENST00000561983	ASXL2	Q76L83	1435 aa		40.89	■■■■■ 4.14
RHOT2-204	ENST00000561983	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		40.84	■■■■■ 4.13
RHOT2-204	ENST00000561983	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		40.81	■■■■■ 4.12
RHOT2-204	ENST00000561983	P3H3	Q8IVL6	736 aa		40.77	■■■■■ 4.12
RHOT2-204	ENST00000561983	TSPOAP1	O95153	1857 aa		40.75	■■■■■ 4.11
RHOT2-204	ENST00000561983	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	40.73	■■■■■ 4.11
RHOT2-204	ENST00000561983	GLI2	P10070	1586 aa		40.67	■■■■■ 4.1
RHOT2-204	ENST00000561983	ABCA8	O94911	1581 aa		40.66	■■■■■ 4.1
RHOT2-204	ENST00000561983	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	40.65	■■■■■ 4.1
RHOT2-204	ENST00000561983	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	40.62	■■■■■ 4.09
RHOT2-204	ENST00000561983	KIF21B	O75037	1637 aa		40.57	■■■■■ 4.09
RHOT2-204	ENST00000561983	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	40.57	■■■■■ 4.09
RHOT2-204	ENST00000561983	KDM6B	O15054	1643 aa		40.56	■■■■■ 4.08
RHOT2-204	ENST00000561983	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		40.56	■■■■■ 4.08
RHOT2-204	ENST00000561983	SAMD9	Q5K651	1589 aa		40.56	■■■■■ 4.08
RHOT2-204	ENST00000561983	KCNH8	Q96L42	1107 aa		40.51	■■■■■ 4.08
RHOT2-204	ENST00000561983	ARID3C	A6NKF2	412 aa		40.48	■■■■■ 4.07
RHOT2-204	ENST00000561983	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	40.47	■■■■■ 4.07
RHOT2-204	ENST00000561983	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		40.47	■■■■■ 4.07
RHOT2-204	ENST00000561983	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		40.44	■■■■■ 4.06
RHOT2-204	ENST00000561983	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	40.42	■■■■■ 4.06
RHOT2-204	ENST00000561983	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		40.4	■■■■■ 4.06
RHOT2-204	ENST00000561983	ATP10B	O94823	1461 aa		40.39	■■■■■ 4.06
RHOT2-204	ENST00000561983	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		40.37	■■■■■ 4.05
RHOT2-204	ENST00000561983	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	40.37	■■■■■ 4.05
RHOT2-204	ENST00000561983	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	40.37	■■■■■ 4.05
RHOT2-204	ENST00000561983	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		40.35	■■■■■ 4.05
RHOT2-204	ENST00000561983	CD109	Q6YHK3	1445 aa		40.32	■■■■■ 4.04
RHOT2-204	ENST00000561983	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		40.32	■■■■■ 4.04
RHOT2-204	ENST00000561983	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		40.25	■■■■■ 4.03
RHOT2-204	ENST00000561983	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		40.2	■■■■■ 4.03
RHOT2-204	ENST00000561983	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	40.19	■■■■■ 4.03
RHOT2-204	ENST00000561983	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	40.17	■■■■■ 4.02
RHOT2-204	ENST00000561983	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		40.13	■■■■■ 4.01
RHOT2-204	ENST00000561983	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	40.03	■■■■■ 4
RHOT2-204	ENST00000561983	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		40.02	■■■■■ 4
RHOT2-204	ENST00000561983	FMN1	Q68DA7	1419 aa		40.02	■■■■■ 4
RHOT2-204	ENST00000561983	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		40	■■■■□ 3.99
RHOT2-204	ENST00000561983	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		39.96	■■■■□ 3.99
RHOT2-204	ENST00000561983	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		39.94	■■■■□ 3.98
RHOT2-204	ENST00000561983	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		39.88	■■■■□ 3.97
RHOT2-204	ENST00000561983	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	39.85	■■■■□ 3.97
RHOT2-204	ENST00000561983	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	39.84	■■■■□ 3.97
RHOT2-204	ENST00000561983	HECW1	Q76N89	1606 aa		39.83	■■■■□ 3.97
RHOT2-204	ENST00000561983	NEO1	Q92859	1461 aa		39.82	■■■■□ 3.97
RHOT2-204	ENST00000561983	ADGRL1	O94910	1474 aa		39.75	■■■■□ 3.95
RHOT2-204	ENST00000561983	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	39.74	■■■■□ 3.95	4e-6	■■■■■ 29.6
RHOT2-204	ENST00000561983	RAPGEF3	O95398	923 aa		39.73	■■■■□ 3.95
RHOT2-204	ENST00000561983	FANCA	O15360	1455 aa		39.65	■■■■□ 3.94
RHOT2-204	ENST00000561983	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		39.64	■■■■□ 3.94
RHOT2-204	ENST00000561983	AKNA	Q7Z591	1439 aa		39.64	■■■■□ 3.94
RHOT2-204	ENST00000561983	CLIP1	P30622	1438 aa		39.63	■■■■□ 3.93
RHOT2-204	ENST00000561983	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		39.61	■■■■□ 3.93
RHOT2-204	ENST00000561983	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		39.6	■■■■□ 3.93
RHOT2-204	ENST00000561983	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	39.57	■■■■□ 3.93
RHOT2-204	ENST00000561983	PLCH2	O75038	1416 aa		39.56	■■■■□ 3.92
RHOT2-204	ENST00000561983	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	39.56	■■■■□ 3.92
RHOT2-204	ENST00000561983	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		39.52	■■■■□ 3.92
RHOT2-204	ENST00000561983	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	39.51	■■■■□ 3.92
RHOT2-204	ENST00000561983	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		39.51	■■■■□ 3.92
RHOT2-204	ENST00000561983	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		39.5	■■■■□ 3.91
RHOT2-204	ENST00000561983	KIF14	Q15058	1648 aa		39.5	■■■■□ 3.91
RHOT2-204	ENST00000561983	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		39.47	■■■■□ 3.91
RHOT2-204	ENST00000561983	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		39.45	■■■■□ 3.91
RHOT2-204	ENST00000561983	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		39.44	■■■■□ 3.9
RHOT2-204	ENST00000561983	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	39.41	■■■■□ 3.9
RHOT2-204	ENST00000561983	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		39.41	■■■■□ 3.9
RHOT2-204	ENST00000561983	RICTOR	Q6R327	1708 aa		39.41	■■■■□ 3.9
RHOT2-204	ENST00000561983	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		39.34	■■■■□ 3.89
RHOT2-204	ENST00000561983	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		39.29	■■■■□ 3.88

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