RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561036.1

HDDC3-206, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene HDDC3, Length 457 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-206ENST00000561036 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
HDDC3-206ENST00000561036 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.75■■□□□ 1.87
HDDC3-206ENST00000561036 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.75■■□□□ 1.87
HDDC3-206ENST00000561036 SYNJ2O15056 1496 aa26.67■■□□□ 1.86
HDDC3-206ENST00000561036 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.65■■□□□ 1.86
HDDC3-206ENST00000561036 GRIN2AQ12879 1464 aa26.65■■□□□ 1.86
HDDC3-206ENST00000561036 APLP2Q06481 763 aa26.61■■□□□ 1.85
HDDC3-206ENST00000561036 IQGAP2Q13576 1575 aa26.59■■□□□ 1.85
HDDC3-206ENST00000561036 SAMD9Q5K651 1589 aa26.59■■□□□ 1.85
HDDC3-206ENST00000561036 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.57■■□□□ 1.84
HDDC3-206ENST00000561036 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
HDDC3-206ENST00000561036 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
HDDC3-206ENST00000561036 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.51■■□□□ 1.83
HDDC3-206ENST00000561036 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.49■■□□□ 1.83
HDDC3-206ENST00000561036 MAP3K1Q13233 1512 aa26.49■■□□□ 1.83
HDDC3-206ENST00000561036 NUP160Q12769 1436 aa26.48■■□□□ 1.83
HDDC3-206ENST00000561036 FMN1Q68DA7 1419 aa26.48■■□□□ 1.83
HDDC3-206ENST00000561036 P3H3Q8IVL6 736 aa26.44■■□□□ 1.82
HDDC3-206ENST00000561036 CEP170Q5SW79 1584 aa26.44■■□□□ 1.82
HDDC3-206ENST00000561036 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.43■■□□□ 1.82
HDDC3-206ENST00000561036 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.42■■□□□ 1.82
HDDC3-206ENST00000561036 FBLN2P98095 1184 aa26.4■■□□□ 1.82
HDDC3-206ENST00000561036 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
HDDC3-206ENST00000561036 TIAM1Q13009 1591 aa26.35■■□□□ 1.81
HDDC3-206ENST00000561036 DISP1Q96F81 1524 aa26.31■■□□□ 1.8
HDDC3-206ENST00000561036 KIAA0556O60303 1618 aa26.31■■□□□ 1.8
HDDC3-206ENST00000561036 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.31■■□□□ 1.8
HDDC3-206ENST00000561036 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
HDDC3-206ENST00000561036 CHD1O14646 1710 aa26.28■■□□□ 1.8
HDDC3-206ENST00000561036 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
HDDC3-206ENST00000561036 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.24■■□□□ 1.79
HDDC3-206ENST00000561036 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.24■■□□□ 1.79
HDDC3-206ENST00000561036 JPH4Q96JJ6 628 aa26.24■■□□□ 1.79
HDDC3-206ENST00000561036 HECW1Q76N89 1606 aa26.19■■□□□ 1.78
HDDC3-206ENST00000561036 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
HDDC3-206ENST00000561036 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.17■■□□□ 1.78
HDDC3-206ENST00000561036 SHROOM2Q13796 1616 aa26.11■■□□□ 1.77
HDDC3-206ENST00000561036 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.09■■□□□ 1.77
HDDC3-206ENST00000561036 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
HDDC3-206ENST00000561036 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
HDDC3-206ENST00000561036 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.06■■□□□ 1.76
HDDC3-206ENST00000561036 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
HDDC3-206ENST00000561036 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.05■■□□□ 1.76
HDDC3-206ENST00000561036 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.03■■□□□ 1.76
HDDC3-206ENST00000561036 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.03■■□□□ 1.76
HDDC3-206ENST00000561036 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
HDDC3-206ENST00000561036 HRCP23327 699 aa25.99■■□□□ 1.75
HDDC3-206ENST00000561036 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.98■■□□□ 1.75
HDDC3-206ENST00000561036 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.95■■□□□ 1.75
HDDC3-206ENST00000561036 ABCA8O94911 1581 aa25.95■■□□□ 1.75
HDDC3-206ENST00000561036 PTPRGP23470 1445 aa25.94■■□□□ 1.74
HDDC3-206ENST00000561036 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
HDDC3-206ENST00000561036 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.93■■□□□ 1.74
HDDC3-206ENST00000561036 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
HDDC3-206ENST00000561036 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.9■■□□□ 1.74
HDDC3-206ENST00000561036 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
HDDC3-206ENST00000561036 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.89■■□□□ 1.74
HDDC3-206ENST00000561036 NCOA2Q15596 1464 aa25.89■■□□□ 1.73
HDDC3-206ENST00000561036 ARHGEF11O15085 1522 aa25.88■■□□□ 1.73
HDDC3-206ENST00000561036 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
HDDC3-206ENST00000561036 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.81■■□□□ 1.72
HDDC3-206ENST00000561036 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.81■■□□□ 1.72
HDDC3-206ENST00000561036 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
HDDC3-206ENST00000561036 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.8■■□□□ 1.72
HDDC3-206ENST00000561036 UACAQ9BZF9 1416 aa25.8■■□□□ 1.72
HDDC3-206ENST00000561036 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
HDDC3-206ENST00000561036 OSCARQ8IYS5 282 aa25.78■■□□□ 1.72
HDDC3-206ENST00000561036 ATP10BO94823 1461 aa25.77■■□□□ 1.72
HDDC3-206ENST00000561036 ARID3CA6NKF2 412 aa25.75■■□□□ 1.71
HDDC3-206ENST00000561036 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
HDDC3-206ENST00000561036 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.72■■□□□ 1.71
HDDC3-206ENST00000561036 ABCC2Q92887 1545 aa25.72■■□□□ 1.71
HDDC3-206ENST00000561036 MIA2Q96PC5 1412 aa25.71■■□□□ 1.71
HDDC3-206ENST00000561036 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
HDDC3-206ENST00000561036 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.71■■□□□ 1.71
HDDC3-206ENST00000561036 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
HDDC3-206ENST00000561036 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.68■■□□□ 1.7
HDDC3-206ENST00000561036 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
HDDC3-206ENST00000561036 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.66■■□□□ 1.7
HDDC3-206ENST00000561036 KIF14Q15058 1648 aa25.6■■□□□ 1.69
HDDC3-206ENST00000561036 ITGAEP38570 1179 aa25.59■■□□□ 1.69
HDDC3-206ENST00000561036 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.58■■□□□ 1.68
HDDC3-206ENST00000561036 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.57■■□□□ 1.68
HDDC3-206ENST00000561036 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.54■■□□□ 1.68
HDDC3-206ENST00000561036 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
HDDC3-206ENST00000561036 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.54■■□□□ 1.68
HDDC3-206ENST00000561036 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
HDDC3-206ENST00000561036 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.46■■□□□ 1.67
HDDC3-206ENST00000561036 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
HDDC3-206ENST00000561036 PTPRKQ15262 1439 aa25.46■■□□□ 1.67
HDDC3-206ENST00000561036 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.45■■□□□ 1.66
HDDC3-206ENST00000561036 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.44■■□□□ 1.66
HDDC3-206ENST00000561036 HFM1A2PYH4 1435 aa25.44■■□□□ 1.66
HDDC3-206ENST00000561036 AKNAQ7Z591 1439 aa25.44■■□□□ 1.66
HDDC3-206ENST00000561036 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
HDDC3-206ENST00000561036 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
HDDC3-206ENST00000561036 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.4■■□□□ 1.66
HDDC3-206ENST00000561036 DAPK1P53355 1430 aa25.38■■□□□ 1.65
HDDC3-206ENST00000561036 PREX2Q70Z35 1606 aa25.37■■□□□ 1.65
HDDC3-206ENST00000561036 ROCK1Q13464 1354 aa25.36■■□□□ 1.65
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