RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560935.1

IPO4-215, Transcript of importin 4, human

TSL 3

Gene IPO4, Length 701 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IPO4-215	ENST00000560935	JPH4	Q96JJ6	628 aa		34.18	■■■■□ 3.06
IPO4-215	ENST00000560935	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	34.18	■■■■□ 3.06
IPO4-215	ENST00000560935	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		34.14	■■■■□ 3.06
IPO4-215	ENST00000560935	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	34.06	■■■■□ 3.04
IPO4-215	ENST00000560935	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		33.99	■■■■□ 3.03
IPO4-215	ENST00000560935	IQGAP2	Q13576	1575 aa		33.93	■■■■□ 3.02
IPO4-215	ENST00000560935	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		33.82	■■■■□ 3
IPO4-215	ENST00000560935	PRX	Q9BXM0	1461 aa		33.76	■■■□□ 2.99
IPO4-215	ENST00000560935	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		33.74	■■■□□ 2.99
IPO4-215	ENST00000560935	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		33.72	■■■□□ 2.99
IPO4-215	ENST00000560935	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		33.71	■■■□□ 2.99
IPO4-215	ENST00000560935	PTPRG	P23470	1445 aa		33.71	■■■□□ 2.99
IPO4-215	ENST00000560935	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		33.71	■■■□□ 2.99
IPO4-215	ENST00000560935	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	33.68	■■■□□ 2.98
IPO4-215	ENST00000560935	DISP1	Q96F81	1524 aa		33.68	■■■□□ 2.98
IPO4-215	ENST00000560935	EEA1	Q15075	1411 aa		33.64	■■■□□ 2.98
IPO4-215	ENST00000560935	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	33.64	■■■□□ 2.98
IPO4-215	ENST00000560935	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		33.63	■■■□□ 2.97
IPO4-215	ENST00000560935	KIAA0556	O60303	1618 aa		33.61	■■■□□ 2.97
IPO4-215	ENST00000560935	MAPKBP1	O60336	1514 aa		33.59	■■■□□ 2.97
IPO4-215	ENST00000560935	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		33.54	■■■□□ 2.96
IPO4-215	ENST00000560935	GOLGA3	Q08378	1498 aa		33.52	■■■□□ 2.96
IPO4-215	ENST00000560935	UACA	Q9BZF9	1416 aa		33.49	■■■□□ 2.95
IPO4-215	ENST00000560935	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		33.48	■■■□□ 2.95
IPO4-215	ENST00000560935	ABCC2	Q92887	1545 aa		33.48	■■■□□ 2.95
IPO4-215	ENST00000560935	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		33.47	■■■□□ 2.95
IPO4-215	ENST00000560935	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		33.47	■■■□□ 2.95
IPO4-215	ENST00000560935	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	33.43	■■■□□ 2.94
IPO4-215	ENST00000560935	DIP2B	Q9P265	1576 aa		33.43	■■■□□ 2.94
IPO4-215	ENST00000560935	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		33.4	■■■□□ 2.94
IPO4-215	ENST00000560935	KIF21B	O75037	1637 aa		33.33	■■■□□ 2.93
IPO4-215	ENST00000560935	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		33.32	■■■□□ 2.92
IPO4-215	ENST00000560935	ASXL2	Q76L83	1435 aa		33.3	■■■□□ 2.92
IPO4-215	ENST00000560935	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		33.3	■■■□□ 2.92
IPO4-215	ENST00000560935	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	33.28	■■■□□ 2.92
IPO4-215	ENST00000560935	ABCA8	O94911	1581 aa		33.25	■■■□□ 2.91
IPO4-215	ENST00000560935	SAMD9	Q5K651	1589 aa		33.25	■■■□□ 2.91
IPO4-215	ENST00000560935	P3H3	Q8IVL6	736 aa		33.2	■■■□□ 2.91
IPO4-215	ENST00000560935	TSPOAP1	O95153	1857 aa		33.17	■■■□□ 2.9
IPO4-215	ENST00000560935	GLI2	P10070	1586 aa		33.16	■■■□□ 2.9
IPO4-215	ENST00000560935	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	33.11	■■■□□ 2.89
IPO4-215	ENST00000560935	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	33.1	■■■□□ 2.89
IPO4-215	ENST00000560935	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		33.08	■■■□□ 2.89
IPO4-215	ENST00000560935	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		33.05	■■■□□ 2.88
IPO4-215	ENST00000560935	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
IPO4-215	ENST00000560935	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		33.03	■■■□□ 2.88
IPO4-215	ENST00000560935	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		33.02	■■■□□ 2.88
IPO4-215	ENST00000560935	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		33.02	■■■□□ 2.88
IPO4-215	ENST00000560935	KDM6B	O15054	1643 aa		33.01	■■■□□ 2.87
IPO4-215	ENST00000560935	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		33	■■■□□ 2.87
IPO4-215	ENST00000560935	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	32.99	■■■□□ 2.87
IPO4-215	ENST00000560935	ATP10B	O94823	1461 aa		32.94	■■■□□ 2.86
IPO4-215	ENST00000560935	ARID3C	A6NKF2	412 aa		32.94	■■■□□ 2.86
IPO4-215	ENST00000560935	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		32.89	■■■□□ 2.86
IPO4-215	ENST00000560935	KCNH8	Q96L42	1107 aa		32.89	■■■□□ 2.86
IPO4-215	ENST00000560935	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		32.88	■■■□□ 2.85
IPO4-215	ENST00000560935	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	32.86	■■■□□ 2.85
IPO4-215	ENST00000560935	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	32.82	■■■□□ 2.84
IPO4-215	ENST00000560935	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	32.82	■■■□□ 2.84
IPO4-215	ENST00000560935	CD109	Q6YHK3	1445 aa		32.81	■■■□□ 2.84
IPO4-215	ENST00000560935	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		32.79	■■■□□ 2.84
IPO4-215	ENST00000560935	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		32.77	■■■□□ 2.84
IPO4-215	ENST00000560935	FMN1	Q68DA7	1419 aa		32.74	■■■□□ 2.83
IPO4-215	ENST00000560935	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		32.7	■■■□□ 2.83
IPO4-215	ENST00000560935	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	32.67	■■■□□ 2.82
IPO4-215	ENST00000560935	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		32.65	■■■□□ 2.82
IPO4-215	ENST00000560935	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	32.65	■■■□□ 2.82
IPO4-215	ENST00000560935	HECW1	Q76N89	1606 aa		32.65	■■■□□ 2.82
IPO4-215	ENST00000560935	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
IPO4-215	ENST00000560935	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
IPO4-215	ENST00000560935	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		32.5	■■■□□ 2.79
IPO4-215	ENST00000560935	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		32.49	■■■□□ 2.79
IPO4-215	ENST00000560935	CLIP1	P30622	1438 aa		32.48	■■■□□ 2.79
IPO4-215	ENST00000560935	NEO1	Q92859	1461 aa		32.48	■■■□□ 2.79
IPO4-215	ENST00000560935	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	32.47	■■■□□ 2.79
IPO4-215	ENST00000560935	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.79
IPO4-215	ENST00000560935	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
IPO4-215	ENST00000560935	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		32.43	■■■□□ 2.78
IPO4-215	ENST00000560935	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		32.43	■■■□□ 2.78
IPO4-215	ENST00000560935	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		32.42	■■■□□ 2.78
IPO4-215	ENST00000560935	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		32.39	■■■□□ 2.78
IPO4-215	ENST00000560935	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		32.36	■■■□□ 2.77
IPO4-215	ENST00000560935	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		32.35	■■■□□ 2.77
IPO4-215	ENST00000560935	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	32.34	■■■□□ 2.77
IPO4-215	ENST00000560935	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		32.34	■■■□□ 2.77
IPO4-215	ENST00000560935	FANCA	O15360	1455 aa		32.34	■■■□□ 2.77
IPO4-215	ENST00000560935	KIF14	Q15058	1648 aa		32.33	■■■□□ 2.77
IPO4-215	ENST00000560935	AKNA	Q7Z591	1439 aa		32.3	■■■□□ 2.76
IPO4-215	ENST00000560935	ADGRL1	O94910	1474 aa		32.29	■■■□□ 2.76
IPO4-215	ENST00000560935	RAPGEF3	O95398	923 aa		32.28	■■■□□ 2.76
IPO4-215	ENST00000560935	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		32.28	■■■□□ 2.76
IPO4-215	ENST00000560935	PLCH2	O75038	1416 aa		32.26	■■■□□ 2.76
IPO4-215	ENST00000560935	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		32.26	■■■□□ 2.75
IPO4-215	ENST00000560935	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75
IPO4-215	ENST00000560935	CEP162	Q5TB80	1403 aa		32.24	■■■□□ 2.75
IPO4-215	ENST00000560935	RICTOR	Q6R327	1708 aa		32.2	■■■□□ 2.75
IPO4-215	ENST00000560935	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		32.15	■■■□□ 2.74
IPO4-215	ENST00000560935	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		32.13	■■■□□ 2.73
IPO4-215	ENST00000560935	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		32.11	■■■□□ 2.73
IPO4-215	ENST00000560935	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		32.1	■■■□□ 2.73

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