RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559036.5

MEF2A-210, Transcript of myocyte enhancer factor 2A, humanhuman

TSL 2

Gene MEF2A, Length 685 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEF2A-210ENST00000559036 JPH4Q96JJ6 628 aa43.7■■■■■ 4.59
MEF2A-210ENST00000559036 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.68■■■■■ 4.58
MEF2A-210ENST00000559036 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.63■■■■■ 4.58
MEF2A-210ENST00000559036 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.53■■■■■ 4.56
MEF2A-210ENST00000559036 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.45■■■■■ 4.55
MEF2A-210ENST00000559036 IQGAP2Q13576 1575 aa43.33■■■■■ 4.53
MEF2A-210ENST00000559036 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.22■■■■■ 4.51
MEF2A-210ENST00000559036 PRXQ9BXM0 1461 aa43.17■■■■■ 4.5
MEF2A-210ENST00000559036 PTPRGP23470 1445 aa43.1■■■■■ 4.49
MEF2A-210ENST00000559036 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.09■■■■■ 4.49
MEF2A-210ENST00000559036 UGGT2Q9NYU1 1516 aa43.07■■■■■ 4.49
MEF2A-210ENST00000559036 ADCY10Q96PN6 1610 aa43.07■■■■■ 4.48
MEF2A-210ENST00000559036 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP43.05■■■■■ 4.48
MEF2A-210ENST00000559036 DISP1Q96F81 1524 aa43.04■■■■■ 4.48
MEF2A-210ENST00000559036 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.04■■■■■ 4.48
MEF2A-210ENST00000559036 EEA1Q15075 1411 aa43.02■■■■■ 4.48
MEF2A-210ENST00000559036 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.01■■■■■ 4.48
MEF2A-210ENST00000559036 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43■■■■■ 4.47
MEF2A-210ENST00000559036 KIAA0556O60303 1618 aa42.93■■■■■ 4.46
MEF2A-210ENST00000559036 MAPKBP1O60336 1514 aa42.91■■■■■ 4.46
MEF2A-210ENST00000559036 GOLGA3Q08378 1498 aa42.83■■■■■ 4.45
MEF2A-210ENST00000559036 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.83■■■■■ 4.45
MEF2A-210ENST00000559036 UACAQ9BZF9 1416 aa42.8■■■■■ 4.44
MEF2A-210ENST00000559036 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.79■■■■■ 4.44
MEF2A-210ENST00000559036 ABCC2Q92887 1545 aa42.78■■■■■ 4.44
MEF2A-210ENST00000559036 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.77■■■■■ 4.44
MEF2A-210ENST00000559036 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.77■■■■■ 4.44
MEF2A-210ENST00000559036 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.76■■■■■ 4.44
MEF2A-210ENST00000559036 FAM69CQ0P6D2 419 aa42.69■■■■■ 4.42
MEF2A-210ENST00000559036 DIP2BQ9P265 1576 aa42.68■■■■■ 4.42
MEF2A-210ENST00000559036 KIF21BO75037 1637 aa42.59■■■■■ 4.41
MEF2A-210ENST00000559036 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.57■■■■■ 4.41
MEF2A-210ENST00000559036 ASXL2Q76L83 1435 aa42.55■■■■■ 4.4
MEF2A-210ENST00000559036 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.55■■■■■ 4.4
MEF2A-210ENST00000559036 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP42.48■■■■■ 4.39
MEF2A-210ENST00000559036 SAMD9Q5K651 1589 aa42.48■■■■■ 4.39
MEF2A-210ENST00000559036 ABCA8O94911 1581 aa42.47■■■■■ 4.39
MEF2A-210ENST00000559036 P3H3Q8IVL6 736 aa42.46■■■■■ 4.39
MEF2A-210ENST00000559036 GLI2P10070 1586 aa42.35■■■■■ 4.37
MEF2A-210ENST00000559036 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.34■■■■■ 4.37
MEF2A-210ENST00000559036 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42.3■■■■■ 4.36
MEF2A-210ENST00000559036 TSPOAP1O95153 1857 aa42.28■■■■■ 4.36
MEF2A-210ENST00000559036 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.27■■■■■ 4.36
MEF2A-210ENST00000559036 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.25■■■■■ 4.35
MEF2A-210ENST00000559036 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.25■■■■■ 4.35
MEF2A-210ENST00000559036 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.23■■■■■ 4.35
MEF2A-210ENST00000559036 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.21■■■■■ 4.35
MEF2A-210ENST00000559036 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.17■■■■■ 4.34
MEF2A-210ENST00000559036 KDM6BO15054 1643 aa42.13■■■■■ 4.34
MEF2A-210ENST00000559036 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa42.13■■■■■ 4.34
MEF2A-210ENST00000559036 ARID3CA6NKF2 412 aa42.12■■■■■ 4.33
MEF2A-210ENST00000559036 ATP10BO94823 1461 aa42.11■■■■■ 4.33
MEF2A-210ENST00000559036 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP42.1■■■■■ 4.33
MEF2A-210ENST00000559036 KCNH8Q96L42 1107 aa42.04■■■■■ 4.32
MEF2A-210ENST00000559036 TEX14Q8IWB6 1497 aa42.02■■■■■ 4.32
MEF2A-210ENST00000559036 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP42.01■■■■■ 4.32
MEF2A-210ENST00000559036 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.95■■■■■ 4.31
MEF2A-210ENST00000559036 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
MEF2A-210ENST00000559036 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.95■■■■■ 4.31
MEF2A-210ENST00000559036 CD109Q6YHK3 1445 aa41.93■■■■■ 4.3
MEF2A-210ENST00000559036 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.92■■■■■ 4.3
MEF2A-210ENST00000559036 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.87■■■■■ 4.29
MEF2A-210ENST00000559036 FMN1Q68DA7 1419 aa41.85■■■■■ 4.29
MEF2A-210ENST00000559036 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.76■■■■■ 4.28
MEF2A-210ENST00000559036 ABCA9Q8IUA7 1624 aa41.76■■■■■ 4.28
MEF2A-210ENST00000559036 PLEKHD1A6NEE1 506 aa41.73■■■■■ 4.27
MEF2A-210ENST00000559036 HECW1Q76N89 1606 aa41.7■■■■■ 4.27
MEF2A-210ENST00000559036 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.69■■■■■ 4.26
MEF2A-210ENST00000559036 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
MEF2A-210ENST00000559036 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP41.66■■■■■ 4.26
MEF2A-210ENST00000559036 CLIP1P30622 1438 aa41.53■■■■■ 4.24
MEF2A-210ENST00000559036 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.53■■■■■ 4.24
MEF2A-210ENST00000559036 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.51■■■■■ 4.24
MEF2A-210ENST00000559036 NEO1Q92859 1461 aa41.5■■■■■ 4.23
MEF2A-210ENST00000559036 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP41.49■■■■■ 4.23
MEF2A-210ENST00000559036 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.48■■■■■ 4.23
MEF2A-210ENST00000559036 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.45■■■■■ 4.23
MEF2A-210ENST00000559036 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
MEF2A-210ENST00000559036 TTC37Q6PGP7 1564 aa41.43■■■■■ 4.22
MEF2A-210ENST00000559036 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.37■■■■■ 4.21
MEF2A-210ENST00000559036 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.36■■■■■ 4.21
MEF2A-210ENST00000559036 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.34■■■■■ 4.21
MEF2A-210ENST00000559036 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.34■■■■■ 4.21
MEF2A-210ENST00000559036 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.34■■■■■ 4.21
MEF2A-210ENST00000559036 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.34■■■■■ 4.21
MEF2A-210ENST00000559036 FANCAO15360 1455 aa41.34■■■■■ 4.21
MEF2A-210ENST00000559036 KIF14Q15058 1648 aa41.3■■■■■ 4.2
MEF2A-210ENST00000559036 AKNAQ7Z591 1439 aa41.27■■■■■ 4.2
MEF2A-210ENST00000559036 RAPGEF3O95398 923 aa41.27■■■■■ 4.2
MEF2A-210ENST00000559036 PLCH2O75038 1416 aa41.25■■■■■ 4.19
MEF2A-210ENST00000559036 ADGRL1O94910 1474 aa41.24■■■■■ 4.19
MEF2A-210ENST00000559036 CEP162Q5TB80 1403 aa41.23■■■■■ 4.19
MEF2A-210ENST00000559036 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
MEF2A-210ENST00000559036 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.2■■■■■ 4.19
MEF2A-210ENST00000559036 MYO5CQ9NQX4 1742 aa41.18■■■■■ 4.18
MEF2A-210ENST00000559036 RICTORQ6R327 1708 aa41.1■■■■■ 4.17
MEF2A-210ENST00000559036 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.1■■■■■ 4.17
MEF2A-210ENST00000559036 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.07■■■■■ 4.17
MEF2A-210ENST00000559036 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.05■■■■■ 4.16
MEF2A-210ENST00000559036 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.04■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms