RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558029.5

MFGE8-206, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 3

Gene MFGE8, Length 849 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-206ENST00000558029 EEA1Q15075 1411 aa29.2■■■□□ 2.27
MFGE8-206ENST00000558029 JPH4Q96JJ6 628 aa29.2■■■□□ 2.26
MFGE8-206ENST00000558029 PRXQ9BXM0 1461 aa29.19■■■□□ 2.26
MFGE8-206ENST00000558029 ARAP1Q96P48 1450 aa29.18■■■□□ 2.26
MFGE8-206ENST00000558029 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.16■■■□□ 2.26
MFGE8-206ENST00000558029 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.13■■■□□ 2.25
MFGE8-206ENST00000558029 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
MFGE8-206ENST00000558029 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.08■■■□□ 2.25
MFGE8-206ENST00000558029 IQGAP2Q13576 1575 aa29■■■□□ 2.23
MFGE8-206ENST00000558029 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
MFGE8-206ENST00000558029 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.9■■■□□ 2.22
MFGE8-206ENST00000558029 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.87■■■□□ 2.21
MFGE8-206ENST00000558029 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.86■■■□□ 2.21
MFGE8-206ENST00000558029 KIF21BO75037 1637 aa28.85■■■□□ 2.21
MFGE8-206ENST00000558029 DISP1Q96F81 1524 aa28.84■■■□□ 2.21
MFGE8-206ENST00000558029 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.79■■■□□ 2.2
MFGE8-206ENST00000558029 PTPRGP23470 1445 aa28.76■■■□□ 2.19
MFGE8-206ENST00000558029 KIAA0556O60303 1618 aa28.72■■■□□ 2.19
MFGE8-206ENST00000558029 GOLGA3Q08378 1498 aa28.72■■■□□ 2.19
MFGE8-206ENST00000558029 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.61■■■□□ 2.17
MFGE8-206ENST00000558029 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.59■■■□□ 2.17
MFGE8-206ENST00000558029 SAMD9Q5K651 1589 aa28.58■■■□□ 2.17
MFGE8-206ENST00000558029 UACAQ9BZF9 1416 aa28.58■■■□□ 2.17
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MFGE8-206ENST00000558029 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.53■■■□□ 2.16
MFGE8-206ENST00000558029 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
MFGE8-206ENST00000558029 ABCC2Q92887 1545 aa28.5■■■□□ 2.15
MFGE8-206ENST00000558029 MAPKBP1O60336 1514 aa28.48■■■□□ 2.15
MFGE8-206ENST00000558029 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
MFGE8-206ENST00000558029 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.46■■■□□ 2.15
MFGE8-206ENST00000558029 P3H3Q8IVL6 736 aa28.45■■■□□ 2.14
MFGE8-206ENST00000558029 ABCA8O94911 1581 aa28.45■■■□□ 2.14
MFGE8-206ENST00000558029 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.44■■■□□ 2.14
MFGE8-206ENST00000558029 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.44■■■□□ 2.14
MFGE8-206ENST00000558029 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.44■■■□□ 2.14
MFGE8-206ENST00000558029 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
MFGE8-206ENST00000558029 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.35■■■□□ 2.13
MFGE8-206ENST00000558029 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.34■■■□□ 2.13
MFGE8-206ENST00000558029 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.33■■■□□ 2.13
MFGE8-206ENST00000558029 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
MFGE8-206ENST00000558029 ASXL2Q76L83 1435 aa28.29■■■□□ 2.12
MFGE8-206ENST00000558029 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.27■■■□□ 2.12
MFGE8-206ENST00000558029 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.25■■■□□ 2.11
MFGE8-206ENST00000558029 DIP2BQ9P265 1576 aa28.24■■■□□ 2.11
MFGE8-206ENST00000558029 ATP10BO94823 1461 aa28.23■■■□□ 2.11
MFGE8-206ENST00000558029 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.23■■■□□ 2.11
MFGE8-206ENST00000558029 FMN1Q68DA7 1419 aa28.21■■■□□ 2.11
MFGE8-206ENST00000558029 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
MFGE8-206ENST00000558029 GLI2P10070 1586 aa28.17■■■□□ 2.1
MFGE8-206ENST00000558029 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.15■■■□□ 2.1
MFGE8-206ENST00000558029 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
MFGE8-206ENST00000558029 CLIP1P30622 1438 aa28.14■■■□□ 2.1
MFGE8-206ENST00000558029 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.11■■■□□ 2.09
MFGE8-206ENST00000558029 ARID3CA6NKF2 412 aa28.05■■■□□ 2.08
MFGE8-206ENST00000558029 CEP162Q5TB80 1403 aa28.02■■■□□ 2.08
MFGE8-206ENST00000558029 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.01■■■□□ 2.07
MFGE8-206ENST00000558029 HECW1Q76N89 1606 aa28■■■□□ 2.07
MFGE8-206ENST00000558029 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28■■■□□ 2.07
MFGE8-206ENST00000558029 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
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MFGE8-206ENST00000558029 KCNH8Q96L42 1107 aa27.98■■■□□ 2.07
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MFGE8-206ENST00000558029 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
MFGE8-206ENST00000558029 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
MFGE8-206ENST00000558029 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.91■■■□□ 2.06
MFGE8-206ENST00000558029 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.91■■■□□ 2.06
MFGE8-206ENST00000558029 TSPOAP1O95153 1857 aa27.91■■■□□ 2.06
MFGE8-206ENST00000558029 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
MFGE8-206ENST00000558029 CD109Q6YHK3 1445 aa27.9■■■□□ 2.06
MFGE8-206ENST00000558029 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
MFGE8-206ENST00000558029 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.89■■■□□ 2.06
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MFGE8-206ENST00000558029 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.88■■■□□ 2.05
MFGE8-206ENST00000558029 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.87■■■□□ 2.05
MFGE8-206ENST00000558029 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.86■■■□□ 2.05
MFGE8-206ENST00000558029 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.86■■■□□ 2.05
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MFGE8-206ENST00000558029 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
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MFGE8-206ENST00000558029 PLCH2O75038 1416 aa27.66■■■□□ 2.02
MFGE8-206ENST00000558029 KIF14Q15058 1648 aa27.65■■■□□ 2.02
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MFGE8-206ENST00000558029 MAP3K1Q13233 1512 aa27.56■■■□□ 2
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MFGE8-206ENST00000558029 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.54■■■□□ 2
MFGE8-206ENST00000558029 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.54■■■□□ 2
MFGE8-206ENST00000558029 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.53■■■□□ 2
MFGE8-206ENST00000558029 TIAM1Q13009 1591 aa27.51■■□□□ 1.99
MFGE8-206ENST00000558029 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.49■■□□□ 1.99
MFGE8-206ENST00000558029 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.46■■□□□ 1.99
MFGE8-206ENST00000558029 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
MFGE8-206ENST00000558029 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
MFGE8-206ENST00000558029 RAPGEF3O95398 923 aa27.44■■□□□ 1.98
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