RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555497.5

TMEM260-207, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 2

Gene TMEM260, Length 2,218 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-207ENST00000555497 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.55■■■■□ 3.44
TMEM260-207ENST00000555497 MAP3K1Q13233 1512 aa36.55■■■■□ 3.44
TMEM260-207ENST00000555497 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.53■■■■□ 3.44
TMEM260-207ENST00000555497 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.52■■■■□ 3.44
TMEM260-207ENST00000555497 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.51■■■■□ 3.44
TMEM260-207ENST00000555497 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.5■■■■□ 3.43
TMEM260-207ENST00000555497 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
TMEM260-207ENST00000555497 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.41■■■■□ 3.42
TMEM260-207ENST00000555497 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.38■■■■□ 3.41
TMEM260-207ENST00000555497 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.38■■■■□ 3.41
TMEM260-207ENST00000555497 PBRM1Q86U86 1689 aa36.37■■■■□ 3.41
TMEM260-207ENST00000555497 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.37■■■■□ 3.41
TMEM260-207ENST00000555497 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.32■■■■□ 3.41
TMEM260-207ENST00000555497 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.32■■■■□ 3.4
TMEM260-207ENST00000555497 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.31■■■■□ 3.4
TMEM260-207ENST00000555497 SAMD9Q5K651 1589 aa36.3■■■■□ 3.4
TMEM260-207ENST00000555497 WDR62O43379 1518 aa36.28■■■■□ 3.4
TMEM260-207ENST00000555497 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.24■■■■□ 3.39
TMEM260-207ENST00000555497 FMN1Q68DA7 1419 aa36.23■■■■□ 3.39
TMEM260-207ENST00000555497 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.21■■■■□ 3.39
TMEM260-207ENST00000555497 ADAMTS12P58397 1594 aa36.21■■■■□ 3.39
TMEM260-207ENST00000555497 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
TMEM260-207ENST00000555497 IFT140Q96RY7 1462 aa36.2■■■■□ 3.39
TMEM260-207ENST00000555497 GRIN2BQ13224 1484 aa36.18■■■■□ 3.38
TMEM260-207ENST00000555497 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
TMEM260-207ENST00000555497 ITGAEP38570 1179 aa36.15■■■■□ 3.38
TMEM260-207ENST00000555497 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.08■■■■□ 3.37
TMEM260-207ENST00000555497 ERCC6Q03468 1493 aa36.08■■■■□ 3.37
TMEM260-207ENST00000555497 IQGAP2Q13576 1575 aa36.03■■■■□ 3.36
TMEM260-207ENST00000555497 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.35
TMEM260-207ENST00000555497 CLSPNQ9HAW4 1339 aa36■■■■□ 3.35
TMEM260-207ENST00000555497 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.98■■■■□ 3.35
TMEM260-207ENST00000555497 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
TMEM260-207ENST00000555497 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP35.95■■■■□ 3.34
TMEM260-207ENST00000555497 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP35.93■■■■□ 3.34
TMEM260-207ENST00000555497 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.92■■■■□ 3.34
TMEM260-207ENST00000555497 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.9■■■■□ 3.34
TMEM260-207ENST00000555497 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.85■■■■□ 3.33
TMEM260-207ENST00000555497 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.84■■■■□ 3.33
TMEM260-207ENST00000555497 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.81■■■■□ 3.32
TMEM260-207ENST00000555497 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.81■■■■□ 3.32
TMEM260-207ENST00000555497 GRIN2AQ12879 1464 aa35.8■■■■□ 3.32
TMEM260-207ENST00000555497 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.79■■■■□ 3.32
TMEM260-207ENST00000555497 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.77■■■■□ 3.32
TMEM260-207ENST00000555497 NCOA2Q15596 1464 aa35.77■■■■□ 3.32
TMEM260-207ENST00000555497 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.75■■■■□ 3.31
TMEM260-207ENST00000555497 HECW1Q76N89 1606 aa35.74■■■■□ 3.31
TMEM260-207ENST00000555497 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.73■■■■□ 3.31
TMEM260-207ENST00000555497 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
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TMEM260-207ENST00000555497 DISP1Q96F81 1524 aa35.7■■■■□ 3.31
TMEM260-207ENST00000555497 MAPKBP1O60336 1514 aa35.69■■■■□ 3.3
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TMEM260-207ENST00000555497 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.67■■■■□ 3.3
TMEM260-207ENST00000555497 KIAA0556O60303 1618 aa35.67■■■■□ 3.3
TMEM260-207ENST00000555497 ARHGEF11O15085 1522 aa35.65■■■■□ 3.3
TMEM260-207ENST00000555497 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
TMEM260-207ENST00000555497 SYNJ2O15056 1496 aa35.63■■■■□ 3.29
TMEM260-207ENST00000555497 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
TMEM260-207ENST00000555497 CEP170Q5SW79 1584 aa35.61■■■■□ 3.29
TMEM260-207ENST00000555497 PTPRKQ15262 1439 aa35.6■■■■□ 3.29
TMEM260-207ENST00000555497 ARID3CA6NKF2 412 aa35.57■■■■□ 3.28
TMEM260-207ENST00000555497 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.53■■■■□ 3.28
TMEM260-207ENST00000555497 FBLN2P98095 1184 aa35.52■■■■□ 3.28
TMEM260-207ENST00000555497 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
TMEM260-207ENST00000555497 NUP160Q12769 1436 aa35.45■■■■□ 3.27
TMEM260-207ENST00000555497 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.44■■■■□ 3.26
TMEM260-207ENST00000555497 HFM1A2PYH4 1435 aa35.43■■■■□ 3.26
TMEM260-207ENST00000555497 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.42■■■■□ 3.26
TMEM260-207ENST00000555497 SIN3AQ96ST3 1273 aa35.38■■■■□ 3.26
TMEM260-207ENST00000555497 NAIPQ13075 1403 aa35.37■■■■□ 3.25
TMEM260-207ENST00000555497 JPH4Q96JJ6 628 aa35.35■■■■□ 3.25
TMEM260-207ENST00000555497 MIA2Q96PC5 1412 aa35.31■■■■□ 3.24
TMEM260-207ENST00000555497 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.3■■■■□ 3.24
TMEM260-207ENST00000555497 MIER1Q8N108 512 aa35.3■■■■□ 3.24
TMEM260-207ENST00000555497 NEUROD1Q13562 356 aa35.29■■■■□ 3.24
TMEM260-207ENST00000555497 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.25■■■■□ 3.23
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TMEM260-207ENST00000555497 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.24■■■■□ 3.23
TMEM260-207ENST00000555497 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.21■■■■□ 3.23
TMEM260-207ENST00000555497 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP35.18■■■■□ 3.22
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TMEM260-207ENST00000555497 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.16■■■■□ 3.22
TMEM260-207ENST00000555497 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP35.14■■■■□ 3.22
TMEM260-207ENST00000555497 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa35.12■■■■□ 3.21
TMEM260-207ENST00000555497 AKNAQ7Z591 1439 aa35.11■■■■□ 3.21
TMEM260-207ENST00000555497 KDM6BO15054 1643 aa35.11■■■■□ 3.21
TMEM260-207ENST00000555497 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.1■■■■□ 3.21
TMEM260-207ENST00000555497 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP35.1■■■■□ 3.21
TMEM260-207ENST00000555497 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP35.09■■■■□ 3.21
TMEM260-207ENST00000555497 ABCA8O94911 1581 aa35.08■■■■□ 3.21
TMEM260-207ENST00000555497 DAPK1P53355 1430 aa35.05■■■■□ 3.2
TMEM260-207ENST00000555497 KIF14Q15058 1648 aa35.04■■■■□ 3.2
TMEM260-207ENST00000555497 CHD1O14646 1710 aa35.04■■■■□ 3.2
TMEM260-207ENST00000555497 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
TMEM260-207ENST00000555497 ABCC5O15440 1437 aa35.03■■■■□ 3.2
TMEM260-207ENST00000555497 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.02■■■■□ 3.2
TMEM260-207ENST00000555497 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP35.02■■■■□ 3.2
TMEM260-207ENST00000555497 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP34.99■■■■□ 3.19
TMEM260-207ENST00000555497 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP34.98■■■■□ 3.19
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