RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554314.1

PAPLN-204, Transcript of papilin, proteoglycan like sulfated glycoprotein, humanhuman

TSL 3

Gene PAPLN, Length 707 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLN-204ENST00000554314 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.75■■□□□ 1.39
PAPLN-204ENST00000554314 GRIN2AQ12879 1464 aa23.72■■□□□ 1.39
PAPLN-204ENST00000554314 KIF21BO75037 1637 aa23.62■■□□□ 1.37
PAPLN-204ENST00000554314 NUP160Q12769 1436 aa23.59■■□□□ 1.37
PAPLN-204ENST00000554314 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.59■■□□□ 1.37
PAPLN-204ENST00000554314 GOLGA3Q08378 1498 aa23.59■■□□□ 1.37
PAPLN-204ENST00000554314 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
PAPLN-204ENST00000554314 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.54■■□□□ 1.36
PAPLN-204ENST00000554314 CEP170Q5SW79 1584 aa23.52■■□□□ 1.36
PAPLN-204ENST00000554314 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.51■■□□□ 1.35
PAPLN-204ENST00000554314 JPH4Q96JJ6 628 aa23.42■■□□□ 1.34
PAPLN-204ENST00000554314 IQGAP2Q13576 1575 aa23.4■■□□□ 1.34
PAPLN-204ENST00000554314 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.39■■□□□ 1.33
PAPLN-204ENST00000554314 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.39■■□□□ 1.33
PAPLN-204ENST00000554314 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.36■■□□□ 1.33
PAPLN-204ENST00000554314 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
PAPLN-204ENST00000554314 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.31■■□□□ 1.32
PAPLN-204ENST00000554314 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
PAPLN-204ENST00000554314 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.3■■□□□ 1.32
PAPLN-204ENST00000554314 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
PAPLN-204ENST00000554314 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.29■■□□□ 1.32
PAPLN-204ENST00000554314 SHROOM2Q13796 1616 aa23.29■■□□□ 1.32
PAPLN-204ENST00000554314 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.2■■□□□ 1.3
PAPLN-204ENST00000554314 DISP1Q96F81 1524 aa23.19■■□□□ 1.3
PAPLN-204ENST00000554314 CLIP1P30622 1438 aa23.18■■□□□ 1.3
PAPLN-204ENST00000554314 CEP162Q5TB80 1403 aa23.16■■□□□ 1.3
PAPLN-204ENST00000554314 KIAA0556O60303 1618 aa23.15■■□□□ 1.3
PAPLN-204ENST00000554314 P3H3Q8IVL6 736 aa23.15■■□□□ 1.3
PAPLN-204ENST00000554314 SAMD9Q5K651 1589 aa23.14■■□□□ 1.29
PAPLN-204ENST00000554314 PTPRGP23470 1445 aa23.12■■□□□ 1.29
PAPLN-204ENST00000554314 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.11■■□□□ 1.29
PAPLN-204ENST00000554314 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
PAPLN-204ENST00000554314 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.08■■□□□ 1.28
PAPLN-204ENST00000554314 FMN1Q68DA7 1419 aa23.02■■□□□ 1.28
PAPLN-204ENST00000554314 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.98■■□□□ 1.27
PAPLN-204ENST00000554314 UACAQ9BZF9 1416 aa22.96■■□□□ 1.27
PAPLN-204ENST00000554314 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.91■■□□□ 1.26
PAPLN-204ENST00000554314 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.9■■□□□ 1.26
PAPLN-204ENST00000554314 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
PAPLN-204ENST00000554314 ABCA8O94911 1581 aa22.88■■□□□ 1.25
PAPLN-204ENST00000554314 ABCC2Q92887 1545 aa22.87■■□□□ 1.25
PAPLN-204ENST00000554314 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PAPLN-204ENST00000554314 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.87■■□□□ 1.25
PAPLN-204ENST00000554314 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.85■■□□□ 1.25
PAPLN-204ENST00000554314 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.84■■□□□ 1.25
PAPLN-204ENST00000554314 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.83■■□□□ 1.25
PAPLN-204ENST00000554314 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.81■■□□□ 1.24
PAPLN-204ENST00000554314 HECW1Q76N89 1606 aa22.79■■□□□ 1.24
PAPLN-204ENST00000554314 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PAPLN-204ENST00000554314 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.79■■□□□ 1.24
PAPLN-204ENST00000554314 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PAPLN-204ENST00000554314 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PAPLN-204ENST00000554314 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PAPLN-204ENST00000554314 MAPKBP1O60336 1514 aa22.77■■□□□ 1.24
PAPLN-204ENST00000554314 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.77■■□□□ 1.24
PAPLN-204ENST00000554314 DIP2BQ9P265 1576 aa22.76■■□□□ 1.23
PAPLN-204ENST00000554314 ARID3CA6NKF2 412 aa22.76■■□□□ 1.23
PAPLN-204ENST00000554314 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.76■■□□□ 1.23
PAPLN-204ENST00000554314 APLP2Q06481 763 aa22.75■■□□□ 1.23
PAPLN-204ENST00000554314 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.73■■□□□ 1.23
PAPLN-204ENST00000554314 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PAPLN-204ENST00000554314 ATP10BO94823 1461 aa22.73■■□□□ 1.23
PAPLN-204ENST00000554314 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PAPLN-204ENST00000554314 KDM6BO15054 1643 aa22.69■■□□□ 1.22
PAPLN-204ENST00000554314 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.68■■□□□ 1.22
PAPLN-204ENST00000554314 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PAPLN-204ENST00000554314 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PAPLN-204ENST00000554314 ASXL2Q76L83 1435 aa22.62■■□□□ 1.21
PAPLN-204ENST00000554314 TSPOAP1O95153 1857 aa22.62■■□□□ 1.21
PAPLN-204ENST00000554314 MAP3K1Q13233 1512 aa22.61■■□□□ 1.21
PAPLN-204ENST00000554314 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.59■■□□□ 1.21
PAPLN-204ENST00000554314 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.57■■□□□ 1.2
PAPLN-204ENST00000554314 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.57■■□□□ 1.2
PAPLN-204ENST00000554314 TIAM1Q13009 1591 aa22.56■■□□□ 1.2
PAPLN-204ENST00000554314 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PAPLN-204ENST00000554314 KCNH8Q96L42 1107 aa22.54■■□□□ 1.2
PAPLN-204ENST00000554314 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.51■■□□□ 1.19
PAPLN-204ENST00000554314 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.51■■□□□ 1.19
PAPLN-204ENST00000554314 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.49■■□□□ 1.19
PAPLN-204ENST00000554314 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.49■■□□□ 1.19
PAPLN-204ENST00000554314 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PAPLN-204ENST00000554314 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.45■■□□□ 1.18
PAPLN-204ENST00000554314 KIF14Q15058 1648 aa22.43■■□□□ 1.18
PAPLN-204ENST00000554314 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
PAPLN-204ENST00000554314 GLI2P10070 1586 aa22.41■■□□□ 1.18
PAPLN-204ENST00000554314 ADGRL1O94910 1474 aa22.36■■□□□ 1.17
PAPLN-204ENST00000554314 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.36■■□□□ 1.17
PAPLN-204ENST00000554314 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.36■■□□□ 1.17
PAPLN-204ENST00000554314 NCOA2Q15596 1464 aa22.35■■□□□ 1.17
PAPLN-204ENST00000554314 CD109Q6YHK3 1445 aa22.35■■□□□ 1.17
PAPLN-204ENST00000554314 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PAPLN-204ENST00000554314 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PAPLN-204ENST00000554314 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.34■■□□□ 1.17
PAPLN-204ENST00000554314 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PAPLN-204ENST00000554314 PLCH2O75038 1416 aa22.29■■□□□ 1.16
PAPLN-204ENST00000554314 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.29■■□□□ 1.16
PAPLN-204ENST00000554314 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.28■■□□□ 1.16
PAPLN-204ENST00000554314 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.27■■□□□ 1.16
PAPLN-204ENST00000554314 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PAPLN-204ENST00000554314 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms