RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551430.6

CS-226, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-226ENST00000551430 JPH4Q96JJ6 628 aa35.63■■■■□ 3.29
CS-226ENST00000551430 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.6■■■■□ 3.29
CS-226ENST00000551430 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.58■■■■□ 3.29
CS-226ENST00000551430 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.46■■■■□ 3.27
CS-226ENST00000551430 PRXQ9BXM0 1461 aa35.32■■■■□ 3.24
CS-226ENST00000551430 IQGAP2Q13576 1575 aa35.31■■■■□ 3.24
CS-226ENST00000551430 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.28■■■■□ 3.24
CS-226ENST00000551430 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.19■■■■□ 3.22
CS-226ENST00000551430 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.17■■■■□ 3.22
CS-226ENST00000551430 DISP1Q96F81 1524 aa35.16■■■■□ 3.22
CS-226ENST00000551430 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.15■■■■□ 3.22
CS-226ENST00000551430 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.15■■■■□ 3.22
CS-226ENST00000551430 PTPRGP23470 1445 aa35.12■■■■□ 3.21
CS-226ENST00000551430 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.12■■■■□ 3.21
CS-226ENST00000551430 EEA1Q15075 1411 aa35.1■■■■□ 3.21
CS-226ENST00000551430 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.1■■■■□ 3.21
CS-226ENST00000551430 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
CS-226ENST00000551430 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.05■■■■□ 3.2
CS-226ENST00000551430 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.03■■■■□ 3.2
CS-226ENST00000551430 KIAA0556O60303 1618 aa35■■■■□ 3.19
CS-226ENST00000551430 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.91■■■■□ 3.18
CS-226ENST00000551430 MAPKBP1O60336 1514 aa34.9■■■■□ 3.18
CS-226ENST00000551430 UACAQ9BZF9 1416 aa34.88■■■■□ 3.17
CS-226ENST00000551430 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.86■■■■□ 3.17
CS-226ENST00000551430 GOLGA3Q08378 1498 aa34.85■■■■□ 3.17
CS-226ENST00000551430 ABCC2Q92887 1545 aa34.85■■■■□ 3.17
CS-226ENST00000551430 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.8■■■■□ 3.16
CS-226ENST00000551430 KIF21BO75037 1637 aa34.79■■■■□ 3.16
CS-226ENST00000551430 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.78■■■■□ 3.16
CS-226ENST00000551430 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.74■■■■□ 3.15
CS-226ENST00000551430 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.73■■■■□ 3.15
CS-226ENST00000551430 DIP2BQ9P265 1576 aa34.73■■■■□ 3.15
CS-226ENST00000551430 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.71■■■■□ 3.15
CS-226ENST00000551430 P3H3Q8IVL6 736 aa34.7■■■■□ 3.15
CS-226ENST00000551430 SAMD9Q5K651 1589 aa34.68■■■■□ 3.14
CS-226ENST00000551430 ASXL2Q76L83 1435 aa34.67■■■■□ 3.14
CS-226ENST00000551430 ABCA8O94911 1581 aa34.66■■■■□ 3.14
CS-226ENST00000551430 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.62■■■■□ 3.13
CS-226ENST00000551430 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.6■■■■□ 3.13
CS-226ENST00000551430 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.6■■■■□ 3.13
CS-226ENST00000551430 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.52■■■■□ 3.12
CS-226ENST00000551430 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.49■■■■□ 3.11
CS-226ENST00000551430 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
CS-226ENST00000551430 GLI2P10070 1586 aa34.46■■■■□ 3.11
CS-226ENST00000551430 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.44■■■■□ 3.1
CS-226ENST00000551430 EFCAB5A4FU69 1503 aa34.43■■■■□ 3.1
CS-226ENST00000551430 ARID3CA6NKF2 412 aa34.42■■■■□ 3.1
CS-226ENST00000551430 ATP10BO94823 1461 aa34.39■■■■□ 3.1
CS-226ENST00000551430 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.37■■■■□ 3.09
CS-226ENST00000551430 TSPOAP1O95153 1857 aa34.36■■■■□ 3.09
CS-226ENST00000551430 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.33■■■■□ 3.09
CS-226ENST00000551430 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.08
CS-226ENST00000551430 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.31■■■■□ 3.08
CS-226ENST00000551430 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.29■■■■□ 3.08
CS-226ENST00000551430 KCNH8Q96L42 1107 aa34.26■■■■□ 3.08
CS-226ENST00000551430 KDM6BO15054 1643 aa34.19■■■■□ 3.06
CS-226ENST00000551430 CD109Q6YHK3 1445 aa34.13■■■■□ 3.05
CS-226ENST00000551430 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
CS-226ENST00000551430 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
CS-226ENST00000551430 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
CS-226ENST00000551430 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.11■■■■□ 3.05
CS-226ENST00000551430 FMN1Q68DA7 1419 aa34.11■■■■□ 3.05
CS-226ENST00000551430 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.09■■■■□ 3.05
CS-226ENST00000551430 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.09■■■■□ 3.05
CS-226ENST00000551430 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
CS-226ENST00000551430 ABCA9Q8IUA7 1624 aa34.02■■■■□ 3.04
CS-226ENST00000551430 PLEKHD1A6NEE1 506 aa33.98■■■■□ 3.03
CS-226ENST00000551430 HECW1Q76N89 1606 aa33.97■■■■□ 3.03
CS-226ENST00000551430 CLIP1P30622 1438 aa33.96■■■■□ 3.03
CS-226ENST00000551430 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP33.96■■■■□ 3.03
CS-226ENST00000551430 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP33.87■■■■□ 3.01
CS-226ENST00000551430 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa33.87■■■■□ 3.01
CS-226ENST00000551430 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.85■■■■□ 3.012e-20■□□□□ 10.1
CS-226ENST00000551430 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa33.83■■■■□ 3.01
CS-226ENST00000551430 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.81■■■■□ 3
CS-226ENST00000551430 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.8■■■■□ 3
CS-226ENST00000551430 NEO1Q92859 1461 aa33.77■■■■□ 3
CS-226ENST00000551430 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.77■■■■□ 3
CS-226ENST00000551430 CEP162Q5TB80 1403 aa33.77■■■■□ 3
CS-226ENST00000551430 FYCO1Q9BQS8 1478 aa33.76■■■□□ 2.99
CS-226ENST00000551430 PHLDB1Q86UU1 1377 aa33.74■■■□□ 2.99
CS-226ENST00000551430 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP33.74■■■□□ 2.99
CS-226ENST00000551430 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP33.73■■■□□ 2.99
CS-226ENST00000551430 CCDC18Q5T9S5 1454 aa33.7■■■□□ 2.99
CS-226ENST00000551430 KIF14Q15058 1648 aa33.7■■■□□ 2.99
CS-226ENST00000551430 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa33.67■■■□□ 2.98
CS-226ENST00000551430 FANCAO15360 1455 aa33.67■■■□□ 2.98
CS-226ENST00000551430 RAPGEF3O95398 923 aa33.66■■■□□ 2.98
CS-226ENST00000551430 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.66■■■□□ 2.98
CS-226ENST00000551430 PLCH2O75038 1416 aa33.64■■■□□ 2.98
CS-226ENST00000551430 AKNAQ7Z591 1439 aa33.63■■■□□ 2.97
CS-226ENST00000551430 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa33.62■■■□□ 2.97
CS-226ENST00000551430 CFAP74Q9C0B2 1584 aa33.55■■■□□ 2.96
CS-226ENST00000551430 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP33.54■■■□□ 2.96
CS-226ENST00000551430 ADGRL1O94910 1474 aa33.51■■■□□ 2.96
CS-226ENST00000551430 MYO5CQ9NQX4 1742 aa33.5■■■□□ 2.95
CS-226ENST00000551430 RICTORQ6R327 1708 aa33.48■■■□□ 2.95
CS-226ENST00000551430 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa33.47■■■□□ 2.95
CS-226ENST00000551430 SCAPERQ9BY12 1400 aa33.45■■■□□ 2.95
CS-226ENST00000551430 ARHGAP5Q13017 1502 aa33.43■■■□□ 2.94
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