RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551098.5

DDX23-208, Transcript of DEAD-box helicase 23, human

TSL 2

Gene DDX23, Length 1,083 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX23-208	ENST00000551098	CUL7	Q14999	1698 aa		29.78	■■■□□ 2.36
DDX23-208	ENST00000551098	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		29.77	■■■□□ 2.36
DDX23-208	ENST00000551098	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		29.71	■■■□□ 2.35
DDX23-208	ENST00000551098	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		29.69	■■■□□ 2.34
DDX23-208	ENST00000551098	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	29.51	■■■□□ 2.31
DDX23-208	ENST00000551098	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		29.5	■■■□□ 2.31
DDX23-208	ENST00000551098	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		29.45	■■■□□ 2.3
DDX23-208	ENST00000551098	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	29.45	■■■□□ 2.3
DDX23-208	ENST00000551098	IQGAP2	Q13576	1575 aa		29.42	■■■□□ 2.3
DDX23-208	ENST00000551098	PTPRG	P23470	1445 aa		29.41	■■■□□ 2.3
DDX23-208	ENST00000551098	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		29.36	■■■□□ 2.29
DDX23-208	ENST00000551098	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		29.31	■■■□□ 2.28
DDX23-208	ENST00000551098	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		29.26	■■■□□ 2.27
DDX23-208	ENST00000551098	DISP1	Q96F81	1524 aa		29.25	■■■□□ 2.27
DDX23-208	ENST00000551098	PRX	Q9BXM0	1461 aa		29.24	■■■□□ 2.27
DDX23-208	ENST00000551098	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		29.24	■■■□□ 2.27
DDX23-208	ENST00000551098	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		29.23	■■■□□ 2.27
DDX23-208	ENST00000551098	MAPKBP1	O60336	1514 aa		29.22	■■■□□ 2.27
DDX23-208	ENST00000551098	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		29.19	■■■□□ 2.26
DDX23-208	ENST00000551098	UACA	Q9BZF9	1416 aa		29.16	■■■□□ 2.26
DDX23-208	ENST00000551098	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		29.15	■■■□□ 2.26
DDX23-208	ENST00000551098	ABCC2	Q92887	1545 aa		29.14	■■■□□ 2.25
DDX23-208	ENST00000551098	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		29.13	■■■□□ 2.25
DDX23-208	ENST00000551098	KIAA0556	O60303	1618 aa		29.12	■■■□□ 2.25
DDX23-208	ENST00000551098	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		29.1	■■■□□ 2.25
DDX23-208	ENST00000551098	GOLGA3	Q08378	1498 aa		29.1	■■■□□ 2.25
DDX23-208	ENST00000551098	EEA1	Q15075	1411 aa		29.1	■■■□□ 2.25
DDX23-208	ENST00000551098	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
DDX23-208	ENST00000551098	DIP2B	Q9P265	1576 aa		29.07	■■■□□ 2.24
DDX23-208	ENST00000551098	ASXL2	Q76L83	1435 aa		29.03	■■■□□ 2.24
DDX23-208	ENST00000551098	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		29.01	■■■□□ 2.23
DDX23-208	ENST00000551098	P3H3	Q8IVL6	736 aa		28.98	■■■□□ 2.23
DDX23-208	ENST00000551098	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		28.97	■■■□□ 2.23
DDX23-208	ENST00000551098	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		28.97	■■■□□ 2.23
DDX23-208	ENST00000551098	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
DDX23-208	ENST00000551098	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
DDX23-208	ENST00000551098	TSPOAP1	O95153	1857 aa		28.87	■■■□□ 2.21
DDX23-208	ENST00000551098	ABCA8	O94911	1581 aa		28.84	■■■□□ 2.21
DDX23-208	ENST00000551098	GLI2	P10070	1586 aa		28.84	■■■□□ 2.21
DDX23-208	ENST00000551098	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
DDX23-208	ENST00000551098	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
DDX23-208	ENST00000551098	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		28.79	■■■□□ 2.2
DDX23-208	ENST00000551098	ARID3C	A6NKF2	412 aa		28.78	■■■□□ 2.2
DDX23-208	ENST00000551098	KCNH8	Q96L42	1107 aa		28.78	■■■□□ 2.2
DDX23-208	ENST00000551098	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		28.78	■■■□□ 2.2
DDX23-208	ENST00000551098	KDM6B	O15054	1643 aa		28.77	■■■□□ 2.2
DDX23-208	ENST00000551098	KIF21B	O75037	1637 aa		28.76	■■■□□ 2.19
DDX23-208	ENST00000551098	SAMD9	Q5K651	1589 aa		28.75	■■■□□ 2.19
DDX23-208	ENST00000551098	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
DDX23-208	ENST00000551098	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
DDX23-208	ENST00000551098	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	28.68	■■■□□ 2.18
DDX23-208	ENST00000551098	ATP10B	O94823	1461 aa		28.66	■■■□□ 2.18
DDX23-208	ENST00000551098	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		28.66	■■■□□ 2.18
DDX23-208	ENST00000551098	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		28.66	■■■□□ 2.18
DDX23-208	ENST00000551098	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		28.66	■■■□□ 2.18
DDX23-208	ENST00000551098	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	28.64	■■■□□ 2.18
DDX23-208	ENST00000551098	CD109	Q6YHK3	1445 aa		28.62	■■■□□ 2.17
DDX23-208	ENST00000551098	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		28.61	■■■□□ 2.17
DDX23-208	ENST00000551098	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		28.59	■■■□□ 2.17
DDX23-208	ENST00000551098	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		28.52	■■■□□ 2.16
DDX23-208	ENST00000551098	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		28.52	■■■□□ 2.16
DDX23-208	ENST00000551098	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	28.52	■■■□□ 2.16
DDX23-208	ENST00000551098	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	28.52	■■■□□ 2.16
DDX23-208	ENST00000551098	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		28.49	■■■□□ 2.15
DDX23-208	ENST00000551098	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	28.46	■■■□□ 2.15
DDX23-208	ENST00000551098	FMN1	Q68DA7	1419 aa		28.4	■■■□□ 2.14
DDX23-208	ENST00000551098	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		28.39	■■■□□ 2.14
DDX23-208	ENST00000551098	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		28.39	■■■□□ 2.13
DDX23-208	ENST00000551098	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		28.37	■■■□□ 2.13
DDX23-208	ENST00000551098	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		28.34	■■■□□ 2.13
DDX23-208	ENST00000551098	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	28.28	■■■□□ 2.12
DDX23-208	ENST00000551098	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		28.28	■■■□□ 2.12
DDX23-208	ENST00000551098	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	28.28	■■■□□ 2.12
DDX23-208	ENST00000551098	NEO1	Q92859	1461 aa		28.26	■■■□□ 2.11
DDX23-208	ENST00000551098	HECW1	Q76N89	1606 aa		28.25	■■■□□ 2.11
DDX23-208	ENST00000551098	RAPGEF3	O95398	923 aa		28.22	■■■□□ 2.11
DDX23-208	ENST00000551098	ADGRL1	O94910	1474 aa		28.21	■■■□□ 2.11
DDX23-208	ENST00000551098	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	28.19	■■■□□ 2.1
DDX23-208	ENST00000551098	FANCA	O15360	1455 aa		28.15	■■■□□ 2.1
DDX23-208	ENST00000551098	CLIP1	P30622	1438 aa		28.13	■■■□□ 2.09
DDX23-208	ENST00000551098	AKNA	Q7Z591	1439 aa		28.13	■■■□□ 2.09
DDX23-208	ENST00000551098	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		28.12	■■■□□ 2.09
DDX23-208	ENST00000551098	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		28.09	■■■□□ 2.09
DDX23-208	ENST00000551098	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	28.08	■■■□□ 2.09
DDX23-208	ENST00000551098	PLCH2	O75038	1416 aa		28.08	■■■□□ 2.09
DDX23-208	ENST00000551098	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		28.07	■■■□□ 2.08
DDX23-208	ENST00000551098	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	28.07	■■■□□ 2.08
DDX23-208	ENST00000551098	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		28.05	■■■□□ 2.08
DDX23-208	ENST00000551098	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	28.03	■■■□□ 2.08
DDX23-208	ENST00000551098	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		28.02	■■■□□ 2.08
DDX23-208	ENST00000551098	KIF14	Q15058	1648 aa		28.01	■■■□□ 2.07
DDX23-208	ENST00000551098	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
DDX23-208	ENST00000551098	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		27.99	■■■□□ 2.07
DDX23-208	ENST00000551098	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		27.98	■■■□□ 2.07
DDX23-208	ENST00000551098	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		27.98	■■■□□ 2.07
DDX23-208	ENST00000551098	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		27.97	■■■□□ 2.07
DDX23-208	ENST00000551098	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		27.94	■■■□□ 2.06
DDX23-208	ENST00000551098	RICTOR	Q6R327	1708 aa		27.92	■■■□□ 2.06
DDX23-208	ENST00000551098	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		27.92	■■■□□ 2.06
DDX23-208	ENST00000551098	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		27.88	■■■□□ 2.05

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