RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
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CS-215ENST00000549143 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
CS-215ENST00000549143 FHOD3Q2V2M9 1422 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-215ENST00000549143 CUL7Q14999 1698 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-215ENST00000549143 FHAD1B1AJZ9 1412 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-215ENST00000549143 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
CS-215ENST00000549143 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
CS-215ENST00000549143 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa12.86□□□□□ -0.35
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CS-215ENST00000549143 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
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CS-215ENST00000549143 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
CS-215ENST00000549143 GRIN2AQ12879 1464 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-215ENST00000549143 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-215ENST00000549143 FMN1Q68DA7 1419 aa12.74□□□□□ -0.37
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CS-215ENST00000549143 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
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CS-215ENST00000549143 JPH4Q96JJ6 628 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-215ENST00000549143 IQGAP2Q13576 1575 aa12.72□□□□□ -0.37
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CS-215ENST00000549143 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-215ENST00000549143 TIAM1Q13009 1591 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-215ENST00000549143 FYCO1Q9BQS8 1478 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-215ENST00000549143 SAMD9Q5K651 1589 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-215ENST00000549143 PHLDB1Q86UU1 1377 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-215ENST00000549143 CCNB3Q8WWL7 1395 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-215ENST00000549143 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
CS-215ENST00000549143 CEP170Q5SW79 1584 aa12.64□□□□□ -0.39
CS-215ENST00000549143 DISP1Q96F81 1524 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-215ENST00000549143 NUP160Q12769 1436 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-215ENST00000549143 UGGT2Q9NYU1 1516 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-215ENST00000549143 MAP3K1Q13233 1512 aa12.61□□□□□ -0.39
CS-215ENST00000549143 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-215ENST00000549143 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
CS-215ENST00000549143 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
CS-215ENST00000549143 KIAA0556O60303 1618 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-215ENST00000549143 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
CS-215ENST00000549143 PLB1Q6P1J6 1458 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-215ENST00000549143 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
CS-215ENST00000549143 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
CS-215ENST00000549143 CFAP43Q8NDM7 1665 aa12.53□□□□□ -0.4
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CS-215ENST00000549143 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
CS-215ENST00000549143 CCDC18Q5T9S5 1454 aa12.52□□□□□ -0.41
CS-215ENST00000549143 PTPRGP23470 1445 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-215ENST00000549143 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-215ENST00000549143 HECW1Q76N89 1606 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-215ENST00000549143 CHIC2Q9UKJ5 165 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-215ENST00000549143 FGD6Q6ZV73 1430 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-215ENST00000549143 CHD1O14646 1710 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-215ENST00000549143 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa12.49□□□□□ -0.41
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CS-215ENST00000549143 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
CS-215ENST00000549143 MYOM3Q5VTT5 1437 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-215ENST00000549143 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-215ENST00000549143 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-215ENST00000549143 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.42
CS-215ENST00000549143 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-215ENST00000549143 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-215ENST00000549143 ERCC6L2Q5T890 1561 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-215ENST00000549143 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
CS-215ENST00000549143 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
CS-215ENST00000549143 KCNH8Q96L42 1107 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-215ENST00000549143 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
CS-215ENST00000549143 SETD5Q9C0A6 1442 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-215ENST00000549143 OSCARQ8IYS5 282 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-215ENST00000549143 ATP10BO94823 1461 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-215ENST00000549143 PTPRKQ15262 1439 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-215ENST00000549143 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
CS-215ENST00000549143 UACAQ9BZF9 1416 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-215ENST00000549143 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP12.38□□□□□ -0.43
CS-215ENST00000549143 ARHGEF11O15085 1522 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-215ENST00000549143 ABCA8O94911 1581 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-215ENST00000549143 NEUROD1Q13562 356 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-215ENST00000549143 PTPN23Q9H3S7 1636 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-215ENST00000549143 TRIM52Q96A61 297 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-215ENST00000549143 MIA2Q96PC5 1412 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-215ENST00000549143 SIN3AQ96ST3 1273 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-215ENST00000549143 CLASP1Q7Z460 1538 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-215ENST00000549143 SHROOM2Q13796 1616 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-215ENST00000549143 KIF14Q15058 1648 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-215ENST00000549143 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
CS-215ENST00000549143 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP12.3□□□□□ -0.44
CS-215ENST00000549143 HFM1A2PYH4 1435 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-215ENST00000549143 NAIPQ13075 1403 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-215ENST00000549143 CLSPNQ9HAW4 1339 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-215ENST00000549143 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
CS-215ENST00000549143 ABCC5O15440 1437 aa12.27□□□□□ -0.44
CS-215ENST00000549143 DAPK1P53355 1430 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-215ENST00000549143 ABCC2Q92887 1545 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-215ENST00000549143 TSPY4P0CV99 314 aa12.26□□□□□ -0.45
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