RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546585.1

CS-203, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,803 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-203ENST00000546585 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa10.93□□□□□ -0.66
CS-203ENST00000546585 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP10.92□□□□□ -0.663e-9■■■■■ 32.9
CS-203ENST00000546585 ADAMTS12P58397 1594 aa10.92□□□□□ -0.66
CS-203ENST00000546585 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
CS-203ENST00000546585 FHAD1B1AJZ9 1412 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-203ENST00000546585 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
CS-203ENST00000546585 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-203ENST00000546585 HRCP23327 699 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-203ENST00000546585 SAMD9Q5K651 1589 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-203ENST00000546585 EFCAB5A4FU69 1503 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-203ENST00000546585 SYNJ2O15056 1496 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-203ENST00000546585 GRIN2AQ12879 1464 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-203ENST00000546585 CHD1O14646 1710 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-203ENST00000546585 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
CS-203ENST00000546585 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
CS-203ENST00000546585 MAP3K1Q13233 1512 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-203ENST00000546585 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-203ENST00000546585 CFAP43Q8NDM7 1665 aa10.77□□□□□ -0.68
CS-203ENST00000546585 TIAM1Q13009 1591 aa10.77□□□□□ -0.69
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CS-203ENST00000546585 FHOD3Q2V2M9 1422 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-203ENST00000546585 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
CS-203ENST00000546585 CEP170Q5SW79 1584 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-203ENST00000546585 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-203ENST00000546585 NUP160Q12769 1436 aa10.73□□□□□ -0.69
CS-203ENST00000546585 UGGT2Q9NYU1 1516 aa10.72□□□□□ -0.69
CS-203ENST00000546585 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
CS-203ENST00000546585 FYCO1Q9BQS8 1478 aa10.72□□□□□ -0.69
CS-203ENST00000546585 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
CS-203ENST00000546585 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa10.71□□□□□ -0.69
CS-203ENST00000546585 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
CS-203ENST00000546585 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-203ENST00000546585 DISP1Q96F81 1524 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-203ENST00000546585 KIAA0556O60303 1618 aa10.67□□□□□ -0.7
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CS-203ENST00000546585 FBLN2P98095 1184 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-203ENST00000546585 P3H3Q8IVL6 736 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-203ENST00000546585 SHROOM2Q13796 1616 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-203ENST00000546585 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-203ENST00000546585 CLASP1Q7Z460 1538 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-203ENST00000546585 APLP2Q06481 763 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-203ENST00000546585 PHLDB1Q86UU1 1377 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-203ENST00000546585 ARHGEF11O15085 1522 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-203ENST00000546585 JPH4Q96JJ6 628 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-203ENST00000546585 HECW1Q76N89 1606 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-203ENST00000546585 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-203ENST00000546585 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CS-203ENST00000546585 CCNB3Q8WWL7 1395 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-203ENST00000546585 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-203ENST00000546585 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
CS-203ENST00000546585 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-203ENST00000546585 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-203ENST00000546585 CCDC18Q5T9S5 1454 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-203ENST00000546585 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
CS-203ENST00000546585 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
CS-203ENST00000546585 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
CS-203ENST00000546585 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
CS-203ENST00000546585 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP10.53□□□□□ -0.72
CS-203ENST00000546585 NCOA2Q15596 1464 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-203ENST00000546585 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
CS-203ENST00000546585 ABCA8O94911 1581 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-203ENST00000546585 ERCC6L2Q5T890 1561 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-203ENST00000546585 FGD6Q6ZV73 1430 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-203ENST00000546585 PLB1Q6P1J6 1458 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-203ENST00000546585 OSCARQ8IYS5 282 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-203ENST00000546585 MYOM3Q5VTT5 1437 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-203ENST00000546585 MTUS2Q5JR59 1369 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-203ENST00000546585 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
CS-203ENST00000546585 PTPRKQ15262 1439 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-203ENST00000546585 ADCY10Q96PN6 1610 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-203ENST00000546585 PTPRGP23470 1445 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-203ENST00000546585 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
CS-203ENST00000546585 PTPN23Q9H3S7 1636 aa10.46□□□□□ -0.74
CS-203ENST00000546585 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-203ENST00000546585 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-203ENST00000546585 ABCC2Q92887 1545 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-203ENST00000546585 KIF14Q15058 1648 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-203ENST00000546585 UACAQ9BZF9 1416 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-203ENST00000546585 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-203ENST00000546585 MAPKBP1O60336 1514 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-203ENST00000546585 ATP10BO94823 1461 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-203ENST00000546585 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-203ENST00000546585 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
CS-203ENST00000546585 MIA2Q96PC5 1412 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-203ENST00000546585 SETD5Q9C0A6 1442 aa10.4□□□□□ -0.75
CS-203ENST00000546585 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-203ENST00000546585 ABCC10Q5T3U5 1492 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-203ENST00000546585 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
CS-203ENST00000546585 GCC2Q8IWJ2 1684 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-203ENST00000546585 HFM1A2PYH4 1435 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-203ENST00000546585 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
CS-203ENST00000546585 CLSPNQ9HAW4 1339 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-203ENST00000546585 KDM5BQ9UGL1 1544 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-203ENST00000546585 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
CS-203ENST00000546585 ITSN2Q9NZM3 1697 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-203ENST00000546585 NAIPQ13075 1403 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-203ENST00000546585 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
CS-203ENST00000546585 ARID3CA6NKF2 412 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-203ENST00000546585 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
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