RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545600.1

TM7SF3-219, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 4

Gene TM7SF3, Length 579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-219ENST00000545600 JPH4Q96JJ6 628 aa42.23■■■■■ 4.35
TM7SF3-219ENST00000545600 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.21■■■■■ 4.35
TM7SF3-219ENST00000545600 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.2■■■■■ 4.35
TM7SF3-219ENST00000545600 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.12■■■■■ 4.33
TM7SF3-219ENST00000545600 IQGAP2Q13576 1575 aa41.96■■■■■ 4.31
TM7SF3-219ENST00000545600 PRXQ9BXM0 1461 aa41.95■■■■■ 4.31
TM7SF3-219ENST00000545600 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.88■■■■■ 4.29
TM7SF3-219ENST00000545600 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.79■■■■■ 4.28
TM7SF3-219ENST00000545600 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.77■■■■■ 4.28
TM7SF3-219ENST00000545600 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.76■■■■■ 4.28
TM7SF3-219ENST00000545600 EEA1Q15075 1411 aa41.74■■■■■ 4.27
TM7SF3-219ENST00000545600 DISP1Q96F81 1524 aa41.73■■■■■ 4.27
TM7SF3-219ENST00000545600 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.73■■■■■ 4.27
TM7SF3-219ENST00000545600 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.7■■■■■ 4.27
TM7SF3-219ENST00000545600 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.7■■■■■ 4.27
TM7SF3-219ENST00000545600 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.66■■■■■ 4.26
TM7SF3-219ENST00000545600 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.64■■■■■ 4.26
TM7SF3-219ENST00000545600 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.64■■■■■ 4.26
TM7SF3-219ENST00000545600 PTPRGP23470 1445 aa41.63■■■■■ 4.26
TM7SF3-219ENST00000545600 KIAA0556O60303 1618 aa41.6■■■■■ 4.25
TM7SF3-219ENST00000545600 KIF21BO75037 1637 aa41.42■■■■■ 4.22
TM7SF3-219ENST00000545600 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.39■■■■■ 4.22
TM7SF3-219ENST00000545600 GOLGA3Q08378 1498 aa41.39■■■■■ 4.22
TM7SF3-219ENST00000545600 MAPKBP1O60336 1514 aa41.37■■■■■ 4.21
TM7SF3-219ENST00000545600 UACAQ9BZF9 1416 aa41.36■■■■■ 4.21
TM7SF3-219ENST00000545600 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.33■■■■■ 4.21
TM7SF3-219ENST00000545600 ABCC2Q92887 1545 aa41.32■■■■■ 4.2
TM7SF3-219ENST00000545600 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.3■■■■■ 4.2
TM7SF3-219ENST00000545600 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.24■■■■■ 4.19
TM7SF3-219ENST00000545600 SAMD9Q5K651 1589 aa41.24■■■■■ 4.19
TM7SF3-219ENST00000545600 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.23■■■■■ 4.19
TM7SF3-219ENST00000545600 P3H3Q8IVL6 736 aa41.23■■■■■ 4.19
TM7SF3-219ENST00000545600 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.22■■■■■ 4.19
TM7SF3-219ENST00000545600 DIP2BQ9P265 1576 aa41.2■■■■■ 4.19
TM7SF3-219ENST00000545600 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.17■■■■■ 4.18
TM7SF3-219ENST00000545600 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.16■■■■■ 4.18
TM7SF3-219ENST00000545600 ABCA8O94911 1581 aa41.16■■■■■ 4.18
TM7SF3-219ENST00000545600 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.13■■■■■ 4.17
TM7SF3-219ENST00000545600 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
TM7SF3-219ENST00000545600 ASXL2Q76L83 1435 aa41.1■■■■■ 4.17
TM7SF3-219ENST00000545600 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
TM7SF3-219ENST00000545600 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.01■■■■■ 4.15
TM7SF3-219ENST00000545600 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.93■■■■■ 4.14
TM7SF3-219ENST00000545600 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.88■■■■■ 4.13
TM7SF3-219ENST00000545600 ARID3CA6NKF2 412 aa40.87■■■■■ 4.13
TM7SF3-219ENST00000545600 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.87■■■■■ 4.13
TM7SF3-219ENST00000545600 GLI2P10070 1586 aa40.86■■■■■ 4.13
TM7SF3-219ENST00000545600 TSPOAP1O95153 1857 aa40.85■■■■■ 4.13
TM7SF3-219ENST00000545600 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.84■■■■■ 4.13
TM7SF3-219ENST00000545600 ATP10BO94823 1461 aa40.81■■■■■ 4.12
TM7SF3-219ENST00000545600 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.78■■■■■ 4.12
TM7SF3-219ENST00000545600 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
TM7SF3-219ENST00000545600 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.74■■■■■ 4.11
TM7SF3-219ENST00000545600 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.71■■■■■ 4.11
TM7SF3-219ENST00000545600 KCNH8Q96L42 1107 aa40.64■■■■■ 4.1
TM7SF3-219ENST00000545600 KDM6BO15054 1643 aa40.56■■■■■ 4.08
TM7SF3-219ENST00000545600 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.55■■■■■ 4.08
TM7SF3-219ENST00000545600 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.55■■■■■ 4.08
TM7SF3-219ENST00000545600 FMN1Q68DA7 1419 aa40.53■■■■■ 4.08
TM7SF3-219ENST00000545600 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.51■■■■■ 4.08
TM7SF3-219ENST00000545600 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.48■■■■■ 4.07
TM7SF3-219ENST00000545600 CD109Q6YHK3 1445 aa40.47■■■■■ 4.07
TM7SF3-219ENST00000545600 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.45■■■■■ 4.07
TM7SF3-219ENST00000545600 HECW1Q76N89 1606 aa40.42■■■■■ 4.06
TM7SF3-219ENST00000545600 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.41■■■■■ 4.06
TM7SF3-219ENST00000545600 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.4■■■■■ 4.06
TM7SF3-219ENST00000545600 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.4■■■■■ 4.06
TM7SF3-219ENST00000545600 CLIP1P30622 1438 aa40.4■■■■■ 4.06
TM7SF3-219ENST00000545600 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.39■■■■■ 4.06
TM7SF3-219ENST00000545600 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.33■■■■■ 4.05
TM7SF3-219ENST00000545600 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.05
TM7SF3-219ENST00000545600 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.32■■■■■ 4.05
TM7SF3-219ENST00000545600 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.24■■■■■ 4.03
TM7SF3-219ENST00000545600 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.22■■■■■ 4.03
TM7SF3-219ENST00000545600 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.21■■■■■ 4.03
TM7SF3-219ENST00000545600 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.18■■■■■ 4.02
TM7SF3-219ENST00000545600 CEP162Q5TB80 1403 aa40.18■■■■■ 4.02
TM7SF3-219ENST00000545600 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.13■■■■■ 4.01
TM7SF3-219ENST00000545600 KIF14Q15058 1648 aa40.08■■■■■ 4.01
TM7SF3-219ENST00000545600 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.07■■■■■ 4
TM7SF3-219ENST00000545600 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.06■■■■■ 4
TM7SF3-219ENST00000545600 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.06■■■■■ 4
TM7SF3-219ENST00000545600 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.05■■■■■ 4
TM7SF3-219ENST00000545600 NEO1Q92859 1461 aa40.05■■■■■ 4
TM7SF3-219ENST00000545600 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.97■■■■□ 3.99
TM7SF3-219ENST00000545600 FANCAO15360 1455 aa39.96■■■■□ 3.99
TM7SF3-219ENST00000545600 PLCH2O75038 1416 aa39.91■■■■□ 3.98
TM7SF3-219ENST00000545600 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.9■■■■□ 3.98
TM7SF3-219ENST00000545600 AKNAQ7Z591 1439 aa39.9■■■■□ 3.98
TM7SF3-219ENST00000545600 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.89■■■■□ 3.98
TM7SF3-219ENST00000545600 RAPGEF3O95398 923 aa39.89■■■■□ 3.98
TM7SF3-219ENST00000545600 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.88■■■■□ 3.98
TM7SF3-219ENST00000545600 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa39.8■■■■□ 3.96
TM7SF3-219ENST00000545600 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.78■■■■□ 3.96
TM7SF3-219ENST00000545600 RICTORQ6R327 1708 aa39.78■■■■□ 3.96
TM7SF3-219ENST00000545600 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.78■■■■□ 3.96
TM7SF3-219ENST00000545600 ADGRL1O94910 1474 aa39.75■■■■□ 3.95
TM7SF3-219ENST00000545600 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.74■■■■□ 3.95
TM7SF3-219ENST00000545600 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.73■■■■□ 3.95
TM7SF3-219ENST00000545600 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.71■■■■□ 3.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms