RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542720.1

LATS1-205, Transcript of large tumor suppressor kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LATS1, Length 1,096 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LATS1-205ENST00000542720 NUP160Q12769 1436 aa29.61■■■□□ 2.33
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LATS1-205ENST00000542720 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.47■■■□□ 2.31
LATS1-205ENST00000542720 EEA1Q15075 1411 aa29.41■■■□□ 2.3
LATS1-205ENST00000542720 PRXQ9BXM0 1461 aa29.41■■■□□ 2.3
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LATS1-205ENST00000542720 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.37■■■□□ 2.29
LATS1-205ENST00000542720 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.35■■■□□ 2.29
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LATS1-205ENST00000542720 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
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LATS1-205ENST00000542720 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.04■■■□□ 2.24
LATS1-205ENST00000542720 DISP1Q96F81 1524 aa29.04■■■□□ 2.24
LATS1-205ENST00000542720 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.03■■■□□ 2.24
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LATS1-205ENST00000542720 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.96■■■□□ 2.23
LATS1-205ENST00000542720 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.96■■■□□ 2.23
LATS1-205ENST00000542720 PTPRGP23470 1445 aa28.95■■■□□ 2.23
LATS1-205ENST00000542720 KIAA0556O60303 1618 aa28.94■■■□□ 2.22
LATS1-205ENST00000542720 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.93■■■□□ 2.22
LATS1-205ENST00000542720 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.93■■■□□ 2.22
LATS1-205ENST00000542720 P3H3Q8IVL6 736 aa28.91■■■□□ 2.22
LATS1-205ENST00000542720 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.81■■■□□ 2.2
LATS1-205ENST00000542720 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
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LATS1-205ENST00000542720 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.79■■■□□ 2.2
LATS1-205ENST00000542720 SAMD9Q5K651 1589 aa28.79■■■□□ 2.2
LATS1-205ENST00000542720 DIP2BQ9P265 1576 aa28.76■■■□□ 2.19
LATS1-205ENST00000542720 UACAQ9BZF9 1416 aa28.74■■■□□ 2.19
LATS1-205ENST00000542720 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.7■■■□□ 2.19
LATS1-205ENST00000542720 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.7■■■□□ 2.18
LATS1-205ENST00000542720 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.69■■■□□ 2.18
LATS1-205ENST00000542720 KDM6BO15054 1643 aa28.68■■■□□ 2.18
LATS1-205ENST00000542720 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.67■■■□□ 2.18
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LATS1-205ENST00000542720 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.65■■■□□ 2.18
LATS1-205ENST00000542720 ABCA8O94911 1581 aa28.63■■■□□ 2.17
LATS1-205ENST00000542720 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.63■■■□□ 2.17
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LATS1-205ENST00000542720 ARID3CA6NKF2 412 aa28.54■■■□□ 2.16
LATS1-205ENST00000542720 CLIP1P30622 1438 aa28.5■■■□□ 2.15
LATS1-205ENST00000542720 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
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LATS1-205ENST00000542720 TSPOAP1O95153 1857 aa28.48■■■□□ 2.15
LATS1-205ENST00000542720 ASXL2Q76L83 1435 aa28.46■■■□□ 2.15
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LATS1-205ENST00000542720 CEP162Q5TB80 1403 aa28.4■■■□□ 2.14
LATS1-205ENST00000542720 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
LATS1-205ENST00000542720 ADGRL1O94910 1474 aa28.39■■■□□ 2.13
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LATS1-205ENST00000542720 GLI2P10070 1586 aa28.33■■■□□ 2.12
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LATS1-205ENST00000542720 KCNH8Q96L42 1107 aa28.31■■■□□ 2.12
LATS1-205ENST00000542720 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.31■■■□□ 2.12
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LATS1-205ENST00000542720 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
LATS1-205ENST00000542720 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.22■■■□□ 2.11
LATS1-205ENST00000542720 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.2■■■□□ 2.1
LATS1-205ENST00000542720 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.19■■■□□ 2.1
LATS1-205ENST00000542720 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.15■■■□□ 2.1
LATS1-205ENST00000542720 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.11■■■□□ 2.09
LATS1-205ENST00000542720 CD109Q6YHK3 1445 aa28.08■■■□□ 2.09
LATS1-205ENST00000542720 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.08■■■□□ 2.09
LATS1-205ENST00000542720 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
LATS1-205ENST00000542720 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.07■■■□□ 2.08
LATS1-205ENST00000542720 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.03■■■□□ 2.08
LATS1-205ENST00000542720 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.03■■■□□ 2.08
LATS1-205ENST00000542720 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.02■■■□□ 2.08
LATS1-205ENST00000542720 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28■■■□□ 2.07
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LATS1-205ENST00000542720 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.98■■■□□ 2.072e-8■■□□□ 14.3
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LATS1-205ENST00000542720 KIF14Q15058 1648 aa27.95■■■□□ 2.06
LATS1-205ENST00000542720 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.94■■■□□ 2.06
LATS1-205ENST00000542720 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.85■■■□□ 2.05
LATS1-205ENST00000542720 TIAM1Q13009 1591 aa27.82■■■□□ 2.04
LATS1-205ENST00000542720 PLCH2O75038 1416 aa27.82■■■□□ 2.04
LATS1-205ENST00000542720 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
LATS1-205ENST00000542720 NEO1Q92859 1461 aa27.77■■■□□ 2.04
LATS1-205ENST00000542720 FANCAO15360 1455 aa27.76■■■□□ 2.04
LATS1-205ENST00000542720 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.76■■■□□ 2.03
LATS1-205ENST00000542720 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.76■■■□□ 2.03
LATS1-205ENST00000542720 AKNAQ7Z591 1439 aa27.75■■■□□ 2.03
LATS1-205ENST00000542720 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.73■■■□□ 2.03
LATS1-205ENST00000542720 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.73■■■□□ 2.03
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