RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542663.1

CLSTN3-214, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CLSTN3, Length 390 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-214ENST00000542663 JPH4Q96JJ6 628 aa31.91■■■□□ 2.7
CLSTN3-214ENST00000542663 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.81■■■□□ 2.68
CLSTN3-214ENST00000542663 MAPKBP1O60336 1514 aa31.78■■■□□ 2.68
CLSTN3-214ENST00000542663 ABCC10Q5T3U5 1492 aa31.77■■■□□ 2.68
CLSTN3-214ENST00000542663 DIP2BQ9P265 1576 aa31.76■■■□□ 2.67
CLSTN3-214ENST00000542663 CUL7Q14999 1698 aa31.73■■■□□ 2.67
CLSTN3-214ENST00000542663 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.7■■■□□ 2.66
CLSTN3-214ENST00000542663 FAM69CQ0P6D2 419 aa31.67■■■□□ 2.66
CLSTN3-214ENST00000542663 IGF1RP08069 1367 aa31.66■■■□□ 2.66
CLSTN3-214ENST00000542663 TSPOAP1O95153 1857 aa31.63■■■□□ 2.65
CLSTN3-214ENST00000542663 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.63■■■□□ 2.65
CLSTN3-214ENST00000542663 KIF27Q86VH2 1401 aa31.6■■■□□ 2.65
CLSTN3-214ENST00000542663 KDM6BO15054 1643 aa31.55■■■□□ 2.64
CLSTN3-214ENST00000542663 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.42■■■□□ 2.62
CLSTN3-214ENST00000542663 PTPRGP23470 1445 aa31.41■■■□□ 2.62
CLSTN3-214ENST00000542663 IQGAP2Q13576 1575 aa31.39■■■□□ 2.62
CLSTN3-214ENST00000542663 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP31.38■■■□□ 2.61
CLSTN3-214ENST00000542663 ABCC2Q92887 1545 aa31.37■■■□□ 2.61
CLSTN3-214ENST00000542663 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.34■■■□□ 2.61
CLSTN3-214ENST00000542663 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.33■■■□□ 2.61
CLSTN3-214ENST00000542663 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa31.32■■■□□ 2.6
CLSTN3-214ENST00000542663 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.31■■■□□ 2.6
CLSTN3-214ENST00000542663 GLI2P10070 1586 aa31.3■■■□□ 2.6
CLSTN3-214ENST00000542663 ASXL2Q76L83 1435 aa31.28■■■□□ 2.6
CLSTN3-214ENST00000542663 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa31.27■■■□□ 2.6
CLSTN3-214ENST00000542663 DISP1Q96F81 1524 aa31.27■■■□□ 2.6
CLSTN3-214ENST00000542663 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.25■■■□□ 2.59
CLSTN3-214ENST00000542663 UACAQ9BZF9 1416 aa31.2■■■□□ 2.59
CLSTN3-214ENST00000542663 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa31.18■■■□□ 2.58
CLSTN3-214ENST00000542663 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.17■■■□□ 2.58
CLSTN3-214ENST00000542663 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31.16■■■□□ 2.58
CLSTN3-214ENST00000542663 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.15■■■□□ 2.58
CLSTN3-214ENST00000542663 KIAA0556O60303 1618 aa31.14■■■□□ 2.58
CLSTN3-214ENST00000542663 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.13■■■□□ 2.57
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CLSTN3-214ENST00000542663 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.08■■■□□ 2.57
CLSTN3-214ENST00000542663 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
CLSTN3-214ENST00000542663 ADGRL1O94910 1474 aa31.01■■■□□ 2.56
CLSTN3-214ENST00000542663 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.97■■■□□ 2.55
CLSTN3-214ENST00000542663 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.93■■■□□ 2.54
CLSTN3-214ENST00000542663 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.88■■■□□ 2.53
CLSTN3-214ENST00000542663 ABCA8O94911 1581 aa30.87■■■□□ 2.53
CLSTN3-214ENST00000542663 GOLGA3Q08378 1498 aa30.82■■■□□ 2.52
CLSTN3-214ENST00000542663 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.78■■■□□ 2.52
CLSTN3-214ENST00000542663 HECW2Q9P2P5 1572 aa30.76■■■□□ 2.52
CLSTN3-214ENST00000542663 CD109Q6YHK3 1445 aa30.74■■■□□ 2.51
CLSTN3-214ENST00000542663 PRXQ9BXM0 1461 aa30.74■■■□□ 2.51
CLSTN3-214ENST00000542663 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
CLSTN3-214ENST00000542663 KCNH8Q96L42 1107 aa30.67■■■□□ 2.5
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CLSTN3-214ENST00000542663 ARAP3Q8WWN8 1544 aa30.57■■■□□ 2.48
CLSTN3-214ENST00000542663 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.56■■■□□ 2.48
CLSTN3-214ENST00000542663 ATP10BO94823 1461 aa30.56■■■□□ 2.48
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CLSTN3-214ENST00000542663 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.48■■■□□ 2.47
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CLSTN3-214ENST00000542663 ADAMTSL3P82987 1691 aa30.42■■■□□ 2.46
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CLSTN3-214ENST00000542663 BCORL1Q5H9F3 1711 aa30.33■■■□□ 2.45
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CLSTN3-214ENST00000542663 RAPGEF3O95398 923 aa30.3■■■□□ 2.44
CLSTN3-214ENST00000542663 PTPRMP28827 1452 aa30.3■■■□□ 2.44
CLSTN3-214ENST00000542663 RICTORQ6R327 1708 aa30.26■■■□□ 2.43
CLSTN3-214ENST00000542663 MADDQ8WXG6 1647 aa30.25■■■□□ 2.43
CLSTN3-214ENST00000542663 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.22■■■□□ 2.43
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CLSTN3-214ENST00000542663 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa30.2■■■□□ 2.42
CLSTN3-214ENST00000542663 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
CLSTN3-214ENST00000542663 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.15■■■□□ 2.42
CLSTN3-214ENST00000542663 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.15■■■□□ 2.42
CLSTN3-214ENST00000542663 EEA1Q15075 1411 aa30.14■■■□□ 2.42
CLSTN3-214ENST00000542663 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.14■■■□□ 2.42
CLSTN3-214ENST00000542663 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
CLSTN3-214ENST00000542663 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa30.13■■■□□ 2.41
CLSTN3-214ENST00000542663 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
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CLSTN3-214ENST00000542663 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.09■■■□□ 2.41
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CLSTN3-214ENST00000542663 AKNAQ7Z591 1439 aa30.09■■■□□ 2.41
CLSTN3-214ENST00000542663 LMTK3Q96Q04 1460 aa30.08■■■□□ 2.41
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CLSTN3-214ENST00000542663 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
CLSTN3-214ENST00000542663 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.06■■■□□ 2.4
CLSTN3-214ENST00000542663 FBXO41Q8TF61 875 aa30.03■■■□□ 2.4
CLSTN3-214ENST00000542663 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
CLSTN3-214ENST00000542663 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.99■■■□□ 2.39
CLSTN3-214ENST00000542663 HECW1Q76N89 1606 aa29.97■■■□□ 2.39
CLSTN3-214ENST00000542663 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.96■■■□□ 2.39
CLSTN3-214ENST00000542663 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.96■■■□□ 2.39
CLSTN3-214ENST00000542663 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.93■■■□□ 2.38
CLSTN3-214ENST00000542663 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.91■■■□□ 2.38
CLSTN3-214ENST00000542663 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.89■■■□□ 2.38
CLSTN3-214ENST00000542663 PLCH2O75038 1416 aa29.88■■■□□ 2.37
CLSTN3-214ENST00000542663 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.85■■■□□ 2.37
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