RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542636.1

DNAJA4-212, Transcript of DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member A4, humanhuman

TSL 5

Gene DNAJA4, Length 866 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Exosome, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4-212ENST00000542636 KIF27Q86VH2 1401 aa40.42■■■■■ 4.06
DNAJA4-212ENST00000542636 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.28■■■■■ 4.04
DNAJA4-212ENST00000542636 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.23■■■■■ 4.03
DNAJA4-212ENST00000542636 CUL7Q14999 1698 aa40.21■■■■■ 4.03
DNAJA4-212ENST00000542636 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.21■■■■■ 4.03
DNAJA4-212ENST00000542636 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.19■■■■■ 4.02
DNAJA4-212ENST00000542636 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.15■■■■■ 4.02
DNAJA4-212ENST00000542636 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.13■■■■■ 4.01
DNAJA4-212ENST00000542636 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
DNAJA4-212ENST00000542636 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.09■■■■■ 4.01
DNAJA4-212ENST00000542636 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.06■■■■■ 4
DNAJA4-212ENST00000542636 MAPKBP1O60336 1514 aa40.01■■■■□ 3.99
DNAJA4-212ENST00000542636 PTPRGP23470 1445 aa39.99■■■■□ 3.99
DNAJA4-212ENST00000542636 DIP2BQ9P265 1576 aa39.91■■■■□ 3.98
DNAJA4-212ENST00000542636 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa39.9■■■■□ 3.98
DNAJA4-212ENST00000542636 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.89■■■■□ 3.98
DNAJA4-212ENST00000542636 IQGAP2Q13576 1575 aa39.84■■■■□ 3.97
DNAJA4-212ENST00000542636 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.77■■■■□ 3.96
DNAJA4-212ENST00000542636 DISP1Q96F81 1524 aa39.73■■■■□ 3.95
DNAJA4-212ENST00000542636 ABCC2Q92887 1545 aa39.71■■■■□ 3.95
DNAJA4-212ENST00000542636 UACAQ9BZF9 1416 aa39.65■■■■□ 3.94
DNAJA4-212ENST00000542636 TSPOAP1O95153 1857 aa39.64■■■■□ 3.94
DNAJA4-212ENST00000542636 ASXL2Q76L83 1435 aa39.64■■■■□ 3.94
DNAJA4-212ENST00000542636 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa39.61■■■■□ 3.93
DNAJA4-212ENST00000542636 UGGT2Q9NYU1 1516 aa39.6■■■■□ 3.93
DNAJA4-212ENST00000542636 KDM6BO15054 1643 aa39.58■■■■□ 3.93
DNAJA4-212ENST00000542636 PLB1Q6P1J6 1458 aa39.56■■■■□ 3.92
DNAJA4-212ENST00000542636 KIAA0556O60303 1618 aa39.5■■■■□ 3.91
DNAJA4-212ENST00000542636 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39.45■■■■□ 3.91
DNAJA4-212ENST00000542636 GLI2P10070 1586 aa39.43■■■■□ 3.9
DNAJA4-212ENST00000542636 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa39.38■■■■□ 3.89
DNAJA4-212ENST00000542636 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP39.37■■■■□ 3.89
DNAJA4-212ENST00000542636 PRXQ9BXM0 1461 aa39.35■■■■□ 3.89
DNAJA4-212ENST00000542636 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP39.35■■■■□ 3.89
DNAJA4-212ENST00000542636 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP39.34■■■■□ 3.89
DNAJA4-212ENST00000542636 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.31■■■■□ 3.88
DNAJA4-212ENST00000542636 GOLGA3Q08378 1498 aa39.28■■■■□ 3.88
DNAJA4-212ENST00000542636 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.24■■■■□ 3.87
DNAJA4-212ENST00000542636 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.2■■■■□ 3.87
DNAJA4-212ENST00000542636 WDR7Q9Y4E6 1490 aa39.19■■■■□ 3.86
DNAJA4-212ENST00000542636 P3H3Q8IVL6 736 aa39.18■■■■□ 3.86
DNAJA4-212ENST00000542636 KCNH8Q96L42 1107 aa39.17■■■■□ 3.86
DNAJA4-212ENST00000542636 ABCA8O94911 1581 aa39.16■■■■□ 3.86
DNAJA4-212ENST00000542636 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.13■■■■□ 3.85
DNAJA4-212ENST00000542636 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.13■■■■□ 3.85
DNAJA4-212ENST00000542636 ARID3CA6NKF2 412 aa39.1■■■■□ 3.85
DNAJA4-212ENST00000542636 CD109Q6YHK3 1445 aa39.02■■■■□ 3.84
DNAJA4-212ENST00000542636 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.98■■■■□ 3.83
DNAJA4-212ENST00000542636 ADGRL1O94910 1474 aa38.96■■■■□ 3.83
DNAJA4-212ENST00000542636 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP38.92■■■■□ 3.82
DNAJA4-212ENST00000542636 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa38.92■■■■□ 3.82
DNAJA4-212ENST00000542636 ATP10BO94823 1461 aa38.91■■■■□ 3.82
DNAJA4-212ENST00000542636 CFAP43Q8NDM7 1665 aa38.87■■■■□ 3.81
DNAJA4-212ENST00000542636 SAMD9Q5K651 1589 aa38.82■■■■□ 3.8
DNAJA4-212ENST00000542636 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP38.78■■■■□ 3.8
DNAJA4-212ENST00000542636 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP38.78■■■■□ 3.8
DNAJA4-212ENST00000542636 EEA1Q15075 1411 aa38.78■■■■□ 3.8
DNAJA4-212ENST00000542636 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa38.7■■■■□ 3.79
DNAJA4-212ENST00000542636 FHOD3Q2V2M9 1422 aa38.69■■■■□ 3.78
DNAJA4-212ENST00000542636 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP38.62■■■■□ 3.77
DNAJA4-212ENST00000542636 ARAP3Q8WWN8 1544 aa38.61■■■■□ 3.77
DNAJA4-212ENST00000542636 ABCA9Q8IUA7 1624 aa38.6■■■■□ 3.77
DNAJA4-212ENST00000542636 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.58■■■■□ 3.77
DNAJA4-212ENST00000542636 RAPGEF3O95398 923 aa38.56■■■■□ 3.76
DNAJA4-212ENST00000542636 PHLDB1Q86UU1 1377 aa38.51■■■■□ 3.76
DNAJA4-212ENST00000542636 PLEKHD1A6NEE1 506 aa38.5■■■■□ 3.75
DNAJA4-212ENST00000542636 KIF21BO75037 1637 aa38.49■■■■□ 3.75
DNAJA4-212ENST00000542636 NEO1Q92859 1461 aa38.44■■■■□ 3.74
DNAJA4-212ENST00000542636 HECW2Q9P2P5 1572 aa38.41■■■■□ 3.74
DNAJA4-212ENST00000542636 EFCAB5A4FU69 1503 aa38.4■■■■□ 3.74
DNAJA4-212ENST00000542636 UBTFP17480 764 aaKnown RBP38.4■■■■□ 3.74
DNAJA4-212ENST00000542636 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.37■■■■□ 3.73
DNAJA4-212ENST00000542636 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa38.29■■■■□ 3.72
DNAJA4-212ENST00000542636 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP38.29■■■■□ 3.72
DNAJA4-212ENST00000542636 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP38.28■■■■□ 3.72
DNAJA4-212ENST00000542636 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP38.27■■■■□ 3.72
DNAJA4-212ENST00000542636 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP38.27■■■■□ 3.72
DNAJA4-212ENST00000542636 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP38.27■■■■□ 3.72
DNAJA4-212ENST00000542636 AKNAQ7Z591 1439 aa38.26■■■■□ 3.72
DNAJA4-212ENST00000542636 FANCAO15360 1455 aa38.22■■■■□ 3.71
DNAJA4-212ENST00000542636 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP38.22■■■■□ 3.71
DNAJA4-212ENST00000542636 TTC37Q6PGP7 1564 aa38.19■■■■□ 3.7
DNAJA4-212ENST00000542636 PTPRMP28827 1452 aa38.16■■■■□ 3.7
DNAJA4-212ENST00000542636 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.16■■■■□ 3.7
DNAJA4-212ENST00000542636 ADAMTSL3P82987 1691 aa38.16■■■■□ 3.7
DNAJA4-212ENST00000542636 FMN1Q68DA7 1419 aa38.12■■■■□ 3.69
DNAJA4-212ENST00000542636 RICTORQ6R327 1708 aa38.09■■■■□ 3.69
DNAJA4-212ENST00000542636 BCORL1Q5H9F3 1711 aa38.07■■■■□ 3.68
DNAJA4-212ENST00000542636 CFAP74Q9C0B2 1584 aa38.06■■■■□ 3.68
DNAJA4-212ENST00000542636 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa38.06■■■■□ 3.68
DNAJA4-212ENST00000542636 PLCH2O75038 1416 aa38.05■■■■□ 3.68
DNAJA4-212ENST00000542636 HECW1Q76N89 1606 aa38.03■■■■□ 3.68
DNAJA4-212ENST00000542636 SCAPERQ9BY12 1400 aa38.02■■■■□ 3.68
DNAJA4-212ENST00000542636 YEATS2Q9ULM3 1422 aa38.02■■■■□ 3.68
DNAJA4-212ENST00000542636 MADDQ8WXG6 1647 aa38.01■■■■□ 3.68
DNAJA4-212ENST00000542636 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP38.01■■■■□ 3.68
DNAJA4-212ENST00000542636 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa37.96■■■■□ 3.67
DNAJA4-212ENST00000542636 PLPPR3Q6T4P5 718 aa37.96■■■■□ 3.67
DNAJA4-212ENST00000542636 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa37.96■■■■□ 3.67
DNAJA4-212ENST00000542636 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa37.95■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.7 ms