RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539754.5

REXO2-208, Transcript of RNA exonuclease 2, human

TSL 2 BASIC

Gene REXO2, Length 791 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
REXO2-208	ENST00000539754	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		33.77	■■■■□ 3
REXO2-208	ENST00000539754	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		33.77	■■■■□ 3
REXO2-208	ENST00000539754	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		33.76	■■■□□ 2.99
REXO2-208	ENST00000539754	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	33.75	■■■□□ 2.99
REXO2-208	ENST00000539754	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		33.74	■■■□□ 2.99
REXO2-208	ENST00000539754	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		33.64	■■■□□ 2.98
REXO2-208	ENST00000539754	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	33.58	■■■□□ 2.97
REXO2-208	ENST00000539754	EEA1	Q15075	1411 aa		33.57	■■■□□ 2.96
REXO2-208	ENST00000539754	PRX	Q9BXM0	1461 aa		33.56	■■■□□ 2.96
REXO2-208	ENST00000539754	IQGAP2	Q13576	1575 aa		33.55	■■■□□ 2.96
REXO2-208	ENST00000539754	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		33.46	■■■□□ 2.95
REXO2-208	ENST00000539754	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	33.43	■■■□□ 2.94
REXO2-208	ENST00000539754	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	33.42	■■■□□ 2.94
REXO2-208	ENST00000539754	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		33.42	■■■□□ 2.94
REXO2-208	ENST00000539754	PTPRG	P23470	1445 aa		33.36	■■■□□ 2.93
REXO2-208	ENST00000539754	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		33.34	■■■□□ 2.93
REXO2-208	ENST00000539754	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		33.34	■■■□□ 2.93
REXO2-208	ENST00000539754	DISP1	Q96F81	1524 aa		33.31	■■■□□ 2.92
REXO2-208	ENST00000539754	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	33.28	■■■□□ 2.92
REXO2-208	ENST00000539754	KIAA0556	O60303	1618 aa		33.22	■■■□□ 2.91
REXO2-208	ENST00000539754	GOLGA3	Q08378	1498 aa		33.21	■■■□□ 2.91
REXO2-208	ENST00000539754	KIF21B	O75037	1637 aa		33.2	■■■□□ 2.9
REXO2-208	ENST00000539754	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		33.18	■■■□□ 2.9
REXO2-208	ENST00000539754	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		33.18	■■■□□ 2.9
REXO2-208	ENST00000539754	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	33.11	■■■□□ 2.89
REXO2-208	ENST00000539754	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	33.1	■■■□□ 2.89
REXO2-208	ENST00000539754	P3H3	Q8IVL6	736 aa		33.1	■■■□□ 2.89
REXO2-208	ENST00000539754	UACA	Q9BZF9	1416 aa		33.1	■■■□□ 2.89
REXO2-208	ENST00000539754	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		33.02	■■■□□ 2.88
REXO2-208	ENST00000539754	ABCC2	Q92887	1545 aa		33	■■■□□ 2.87
REXO2-208	ENST00000539754	MAPKBP1	O60336	1514 aa		32.97	■■■□□ 2.87
REXO2-208	ENST00000539754	SAMD9	Q5K651	1589 aa		32.94	■■■□□ 2.86
REXO2-208	ENST00000539754	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		32.93	■■■□□ 2.86
REXO2-208	ENST00000539754	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		32.92	■■■□□ 2.86
REXO2-208	ENST00000539754	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		32.87	■■■□□ 2.85
REXO2-208	ENST00000539754	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		32.87	■■■□□ 2.85
REXO2-208	ENST00000539754	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		32.87	■■■□□ 2.85
REXO2-208	ENST00000539754	ABCA8	O94911	1581 aa		32.86	■■■□□ 2.85
REXO2-208	ENST00000539754	ASXL2	Q76L83	1435 aa		32.83	■■■□□ 2.85
REXO2-208	ENST00000539754	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	32.81	■■■□□ 2.84
REXO2-208	ENST00000539754	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		32.81	■■■□□ 2.84
REXO2-208	ENST00000539754	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		32.8	■■■□□ 2.84
REXO2-208	ENST00000539754	DIP2B	Q9P265	1576 aa		32.79	■■■□□ 2.84
REXO2-208	ENST00000539754	ARID3C	A6NKF2	412 aa		32.75	■■■□□ 2.83
REXO2-208	ENST00000539754	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		32.7	■■■□□ 2.83
REXO2-208	ENST00000539754	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	32.66	■■■□□ 2.82
REXO2-208	ENST00000539754	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
REXO2-208	ENST00000539754	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		32.65	■■■□□ 2.82
REXO2-208	ENST00000539754	ATP10B	O94823	1461 aa		32.64	■■■□□ 2.82
REXO2-208	ENST00000539754	TSPOAP1	O95153	1857 aa		32.63	■■■□□ 2.81
REXO2-208	ENST00000539754	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		32.62	■■■□□ 2.81
REXO2-208	ENST00000539754	KCNH8	Q96L42	1107 aa		32.62	■■■□□ 2.81
REXO2-208	ENST00000539754	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
REXO2-208	ENST00000539754	GLI2	P10070	1586 aa		32.6	■■■□□ 2.81
REXO2-208	ENST00000539754	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
REXO2-208	ENST00000539754	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8
REXO2-208	ENST00000539754	FMN1	Q68DA7	1419 aa		32.55	■■■□□ 2.8
REXO2-208	ENST00000539754	CLIP1	P30622	1438 aa		32.46	■■■□□ 2.79
REXO2-208	ENST00000539754	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		32.45	■■■□□ 2.79
REXO2-208	ENST00000539754	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		32.44	■■■□□ 2.78
REXO2-208	ENST00000539754	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		32.42	■■■□□ 2.78
REXO2-208	ENST00000539754	CD109	Q6YHK3	1445 aa		32.39	■■■□□ 2.78
REXO2-208	ENST00000539754	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
REXO2-208	ENST00000539754	HECW1	Q76N89	1606 aa		32.38	■■■□□ 2.77
REXO2-208	ENST00000539754	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		32.36	■■■□□ 2.77
REXO2-208	ENST00000539754	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		32.35	■■■□□ 2.77
REXO2-208	ENST00000539754	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
REXO2-208	ENST00000539754	KDM6B	O15054	1643 aa		32.34	■■■□□ 2.77
REXO2-208	ENST00000539754	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
REXO2-208	ENST00000539754	CEP162	Q5TB80	1403 aa		32.27	■■■□□ 2.76
REXO2-208	ENST00000539754	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		32.27	■■■□□ 2.76
REXO2-208	ENST00000539754	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		32.26	■■■□□ 2.76
REXO2-208	ENST00000539754	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		32.26	■■■□□ 2.75
REXO2-208	ENST00000539754	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
REXO2-208	ENST00000539754	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		32.18	■■■□□ 2.74
REXO2-208	ENST00000539754	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		32.16	■■■□□ 2.74
REXO2-208	ENST00000539754	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		32.15	■■■□□ 2.74
REXO2-208	ENST00000539754	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	32.14	■■■□□ 2.74
REXO2-208	ENST00000539754	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	32.12	■■■□□ 2.73	1e-13	■■■□□ 15.1
REXO2-208	ENST00000539754	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	32.09	■■■□□ 2.73
REXO2-208	ENST00000539754	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		32.07	■■■□□ 2.72
REXO2-208	ENST00000539754	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		32.05	■■■□□ 2.72
REXO2-208	ENST00000539754	NEO1	Q92859	1461 aa		32.03	■■■□□ 2.72
REXO2-208	ENST00000539754	KIF14	Q15058	1648 aa		32.01	■■■□□ 2.72
REXO2-208	ENST00000539754	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		32	■■■□□ 2.71
REXO2-208	ENST00000539754	FANCA	O15360	1455 aa		31.97	■■■□□ 2.71
REXO2-208	ENST00000539754	PLCH2	O75038	1416 aa		31.96	■■■□□ 2.71
REXO2-208	ENST00000539754	AKNA	Q7Z591	1439 aa		31.93	■■■□□ 2.7
REXO2-208	ENST00000539754	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		31.92	■■■□□ 2.7
REXO2-208	ENST00000539754	RAPGEF3	O95398	923 aa		31.92	■■■□□ 2.7
REXO2-208	ENST00000539754	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		31.92	■■■□□ 2.7
REXO2-208	ENST00000539754	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		31.92	■■■□□ 2.7
REXO2-208	ENST00000539754	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		31.89	■■■□□ 2.7
REXO2-208	ENST00000539754	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		31.89	■■■□□ 2.7
REXO2-208	ENST00000539754	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	31.84	■■■□□ 2.69
REXO2-208	ENST00000539754	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	31.83	■■■□□ 2.69
REXO2-208	ENST00000539754	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		31.83	■■■□□ 2.69
REXO2-208	ENST00000539754	ADGRL1	O94910	1474 aa		31.8	■■■□□ 2.68
REXO2-208	ENST00000539754	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		31.79	■■■□□ 2.68
REXO2-208	ENST00000539754	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		31.76	■■■□□ 2.67

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