RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534145.1

SIGIRR-221, Transcript of single Ig and TIR domain containing, humanhuman

TSL 2

Gene SIGIRR, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGIRR-221ENST00000534145 JPH4Q96JJ6 628 aa40.8■■■■■ 4.12
SIGIRR-221ENST00000534145 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.75■■■■■ 4.11
SIGIRR-221ENST00000534145 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.71■■■■■ 4.11
SIGIRR-221ENST00000534145 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.59■■■■■ 4.09
SIGIRR-221ENST00000534145 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.58■■■■■ 4.09
SIGIRR-221ENST00000534145 IQGAP2Q13576 1575 aa40.48■■■■■ 4.07
SIGIRR-221ENST00000534145 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.34■■■■■ 4.05
SIGIRR-221ENST00000534145 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.33■■■■■ 4.05
SIGIRR-221ENST00000534145 PRXQ9BXM0 1461 aa40.3■■■■■ 4.04
SIGIRR-221ENST00000534145 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.25■■■■■ 4.03
SIGIRR-221ENST00000534145 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.24■■■■■ 4.03
SIGIRR-221ENST00000534145 PTPRGP23470 1445 aa40.22■■■■■ 4.03
SIGIRR-221ENST00000534145 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.2■■■■■ 4.03
SIGIRR-221ENST00000534145 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.2■■■■■ 4.03
SIGIRR-221ENST00000534145 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.2■■■■■ 4.03
SIGIRR-221ENST00000534145 EEA1Q15075 1411 aa40.18■■■■■ 4.02
SIGIRR-221ENST00000534145 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.18■■■■■ 4.02
SIGIRR-221ENST00000534145 DISP1Q96F81 1524 aa40.17■■■■■ 4.02
SIGIRR-221ENST00000534145 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.14■■■■■ 4.02
SIGIRR-221ENST00000534145 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
SIGIRR-221ENST00000534145 KIAA0556O60303 1618 aa40.09■■■■■ 4.01
SIGIRR-221ENST00000534145 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.02■■■■■ 4
SIGIRR-221ENST00000534145 GOLGA3Q08378 1498 aa39.98■■■■□ 3.99
SIGIRR-221ENST00000534145 MAPKBP1O60336 1514 aa39.97■■■■□ 3.99
SIGIRR-221ENST00000534145 UACAQ9BZF9 1416 aa39.92■■■■□ 3.98
SIGIRR-221ENST00000534145 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa39.88■■■■□ 3.98
SIGIRR-221ENST00000534145 ABCC2Q92887 1545 aa39.88■■■■□ 3.97
SIGIRR-221ENST00000534145 KIF21BO75037 1637 aa39.84■■■■□ 3.97
SIGIRR-221ENST00000534145 ABCC10Q5T3U5 1492 aa39.84■■■■□ 3.97
SIGIRR-221ENST00000534145 FAM69CQ0P6D2 419 aa39.82■■■■□ 3.97
SIGIRR-221ENST00000534145 DIP2BQ9P265 1576 aa39.8■■■■□ 3.96
SIGIRR-221ENST00000534145 P3H3Q8IVL6 736 aa39.74■■■■□ 3.95
SIGIRR-221ENST00000534145 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP39.72■■■■□ 3.95
SIGIRR-221ENST00000534145 PLB1Q6P1J6 1458 aa39.71■■■■□ 3.95
SIGIRR-221ENST00000534145 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39.7■■■■□ 3.95
SIGIRR-221ENST00000534145 SAMD9Q5K651 1589 aa39.69■■■■□ 3.94
SIGIRR-221ENST00000534145 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.69■■■■□ 3.94
SIGIRR-221ENST00000534145 ASXL2Q76L83 1435 aa39.68■■■■□ 3.94
SIGIRR-221ENST00000534145 TSPOAP1O95153 1857 aa39.67■■■■□ 3.94
SIGIRR-221ENST00000534145 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.66■■■■□ 3.94
SIGIRR-221ENST00000534145 ABCA8O94911 1581 aa39.66■■■■□ 3.94
SIGIRR-221ENST00000534145 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.57■■■■□ 3.93
SIGIRR-221ENST00000534145 GLI2P10070 1586 aa39.49■■■■□ 3.91
SIGIRR-221ENST00000534145 FHOD3Q2V2M9 1422 aa39.45■■■■□ 3.91
SIGIRR-221ENST00000534145 EFCAB5A4FU69 1503 aa39.45■■■■□ 3.91
SIGIRR-221ENST00000534145 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP39.45■■■■□ 3.91
SIGIRR-221ENST00000534145 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39.43■■■■□ 3.9
SIGIRR-221ENST00000534145 WDR7Q9Y4E6 1490 aa39.42■■■■□ 3.9
SIGIRR-221ENST00000534145 ARID3CA6NKF2 412 aa39.39■■■■□ 3.9
SIGIRR-221ENST00000534145 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP39.35■■■■□ 3.89
SIGIRR-221ENST00000534145 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.34■■■■□ 3.89
SIGIRR-221ENST00000534145 ATP10BO94823 1461 aa39.32■■■■□ 3.89
SIGIRR-221ENST00000534145 KCNH8Q96L42 1107 aa39.31■■■■□ 3.88
SIGIRR-221ENST00000534145 KDM6BO15054 1643 aa39.31■■■■□ 3.88
SIGIRR-221ENST00000534145 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.24■■■■□ 3.87
SIGIRR-221ENST00000534145 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP39.24■■■■□ 3.87
SIGIRR-221ENST00000534145 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP39.21■■■■□ 3.87
SIGIRR-221ENST00000534145 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.21■■■■□ 3.87
SIGIRR-221ENST00000534145 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.17■■■■□ 3.86
SIGIRR-221ENST00000534145 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.17■■■■□ 3.86
SIGIRR-221ENST00000534145 CD109Q6YHK3 1445 aa39.12■■■■□ 3.85
SIGIRR-221ENST00000534145 FMN1Q68DA7 1419 aa39.08■■■■□ 3.85
SIGIRR-221ENST00000534145 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP39.03■■■■□ 3.84
SIGIRR-221ENST00000534145 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.03■■■■□ 3.84
SIGIRR-221ENST00000534145 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39■■■■□ 3.83
SIGIRR-221ENST00000534145 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39■■■■□ 3.83
SIGIRR-221ENST00000534145 HECW1Q76N89 1606 aa38.99■■■■□ 3.83
SIGIRR-221ENST00000534145 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP38.95■■■■□ 3.83
SIGIRR-221ENST00000534145 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP38.92■■■■□ 3.82
SIGIRR-221ENST00000534145 CLIP1P30622 1438 aa38.84■■■■□ 3.81
SIGIRR-221ENST00000534145 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38.84■■■■□ 3.81
SIGIRR-221ENST00000534145 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa38.83■■■■□ 3.81
SIGIRR-221ENST00000534145 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP38.76■■■■□ 3.8
SIGIRR-221ENST00000534145 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP38.76■■■■□ 3.8
SIGIRR-221ENST00000534145 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP38.75■■■■□ 3.799e-8■■■□□ 16.1
SIGIRR-221ENST00000534145 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa38.72■■■■□ 3.79
SIGIRR-221ENST00000534145 TTC37Q6PGP7 1564 aa38.71■■■■□ 3.79
SIGIRR-221ENST00000534145 PHLDB1Q86UU1 1377 aa38.7■■■■□ 3.79
SIGIRR-221ENST00000534145 ARAP3Q8WWN8 1544 aa38.7■■■■□ 3.79
SIGIRR-221ENST00000534145 NEO1Q92859 1461 aa38.69■■■■□ 3.78
SIGIRR-221ENST00000534145 CCDC18Q5T9S5 1454 aa38.63■■■■□ 3.77
SIGIRR-221ENST00000534145 FYCO1Q9BQS8 1478 aa38.62■■■■□ 3.77
SIGIRR-221ENST00000534145 CFAP74Q9C0B2 1584 aa38.61■■■■□ 3.77
SIGIRR-221ENST00000534145 KIF14Q15058 1648 aa38.6■■■■□ 3.77
SIGIRR-221ENST00000534145 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP38.59■■■■□ 3.77
SIGIRR-221ENST00000534145 MYO5CQ9NQX4 1742 aa38.58■■■■□ 3.77
SIGIRR-221ENST00000534145 CEP162Q5TB80 1403 aa38.57■■■■□ 3.77
SIGIRR-221ENST00000534145 FANCAO15360 1455 aa38.57■■■■□ 3.76
SIGIRR-221ENST00000534145 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.55■■■■□ 3.76
SIGIRR-221ENST00000534145 AKNAQ7Z591 1439 aa38.53■■■■□ 3.76
SIGIRR-221ENST00000534145 RAPGEF3O95398 923 aa38.52■■■■□ 3.76
SIGIRR-221ENST00000534145 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa38.51■■■■□ 3.76
SIGIRR-221ENST00000534145 PLCH2O75038 1416 aa38.49■■■■□ 3.75
SIGIRR-221ENST00000534145 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa38.44■■■■□ 3.74
SIGIRR-221ENST00000534145 RICTORQ6R327 1708 aa38.43■■■■□ 3.74
SIGIRR-221ENST00000534145 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP38.43■■■■□ 3.74
SIGIRR-221ENST00000534145 ADGRL1O94910 1474 aa38.41■■■■□ 3.74
SIGIRR-221ENST00000534145 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa38.38■■■■□ 3.73
SIGIRR-221ENST00000534145 ARHGAP5Q13017 1502 aa38.36■■■■□ 3.73
SIGIRR-221ENST00000534145 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa38.35■■■■□ 3.73
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