RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533069.1

PKP3-209, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 2

Gene PKP3, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-209ENST00000533069 JPH4Q96JJ6 628 aa28.38■■■□□ 2.13
PKP3-209ENST00000533069 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.37■■■□□ 2.13
PKP3-209ENST00000533069 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
PKP3-209ENST00000533069 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.24■■■□□ 2.11
PKP3-209ENST00000533069 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
PKP3-209ENST00000533069 IQGAP2Q13576 1575 aa28.15■■■□□ 2.1
PKP3-209ENST00000533069 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.09■■■□□ 2.09
PKP3-209ENST00000533069 PRXQ9BXM0 1461 aa28.08■■■□□ 2.09
PKP3-209ENST00000533069 EEA1Q15075 1411 aa28.01■■■□□ 2.08
PKP3-209ENST00000533069 TNIKQ9UKE5 1360 aa28■■■□□ 2.07
PKP3-209ENST00000533069 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28■■■□□ 2.07
PKP3-209ENST00000533069 PTPRGP23470 1445 aa28■■■□□ 2.07
PKP3-209ENST00000533069 DISP1Q96F81 1524 aa27.97■■■□□ 2.07
PKP3-209ENST00000533069 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.96■■■□□ 2.07
PKP3-209ENST00000533069 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.95■■■□□ 2.06
PKP3-209ENST00000533069 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.95■■■□□ 2.06
PKP3-209ENST00000533069 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.92■■■□□ 2.06
PKP3-209ENST00000533069 MAPKBP1O60336 1514 aa27.88■■■□□ 2.05
PKP3-209ENST00000533069 KIAA0556O60303 1618 aa27.88■■■□□ 2.05
PKP3-209ENST00000533069 GOLGA3Q08378 1498 aa27.85■■■□□ 2.05
PKP3-209ENST00000533069 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
PKP3-209ENST00000533069 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.84■■■□□ 2.05
PKP3-209ENST00000533069 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.83■■■□□ 2.04
PKP3-209ENST00000533069 UACAQ9BZF9 1416 aa27.81■■■□□ 2.04
PKP3-209ENST00000533069 ABCC2Q92887 1545 aa27.81■■■□□ 2.04
PKP3-209ENST00000533069 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.77■■■□□ 2.04
PKP3-209ENST00000533069 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
PKP3-209ENST00000533069 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.7■■■□□ 2.02
PKP3-209ENST00000533069 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.7■■■□□ 2.02
PKP3-209ENST00000533069 DIP2BQ9P265 1576 aa27.69■■■□□ 2.02
PKP3-209ENST00000533069 KIF21BO75037 1637 aa27.69■■■□□ 2.02
PKP3-209ENST00000533069 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.67■■■□□ 2.02
PKP3-209ENST00000533069 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.65■■■□□ 2.02
PKP3-209ENST00000533069 ASXL2Q76L83 1435 aa27.63■■■□□ 2.01
PKP3-209ENST00000533069 SAMD9Q5K651 1589 aa27.6■■■□□ 2.01
PKP3-209ENST00000533069 ABCA8O94911 1581 aa27.6■■■□□ 2.01
PKP3-209ENST00000533069 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
PKP3-209ENST00000533069 P3H3Q8IVL6 736 aa27.53■■■□□ 2
PKP3-209ENST00000533069 GLI2P10070 1586 aa27.52■■■□□ 2
PKP3-209ENST00000533069 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.47■■□□□ 1.99
PKP3-209ENST00000533069 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
PKP3-209ENST00000533069 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.46■■□□□ 1.99
PKP3-209ENST00000533069 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
PKP3-209ENST00000533069 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
PKP3-209ENST00000533069 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.41■■□□□ 1.98
PKP3-209ENST00000533069 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.38■■□□□ 1.97
PKP3-209ENST00000533069 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.36■■□□□ 1.97
PKP3-209ENST00000533069 ATP10BO94823 1461 aa27.36■■□□□ 1.97
PKP3-209ENST00000533069 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.34■■□□□ 1.97
PKP3-209ENST00000533069 TSPOAP1O95153 1857 aa27.34■■□□□ 1.97
PKP3-209ENST00000533069 KDM6BO15054 1643 aa27.33■■□□□ 1.97
PKP3-209ENST00000533069 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.31■■□□□ 1.96
PKP3-209ENST00000533069 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
PKP3-209ENST00000533069 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
PKP3-209ENST00000533069 ARID3CA6NKF2 412 aa27.29■■□□□ 1.96
PKP3-209ENST00000533069 KCNH8Q96L42 1107 aa27.26■■□□□ 1.95
PKP3-209ENST00000533069 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.25■■□□□ 1.95
PKP3-209ENST00000533069 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.23■■□□□ 1.95
PKP3-209ENST00000533069 FMN1Q68DA7 1419 aa27.23■■□□□ 1.95
PKP3-209ENST00000533069 CD109Q6YHK3 1445 aa27.23■■□□□ 1.95
PKP3-209ENST00000533069 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
PKP3-209ENST00000533069 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
PKP3-209ENST00000533069 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.21■■□□□ 1.95
PKP3-209ENST00000533069 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.12■■□□□ 1.93
PKP3-209ENST00000533069 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.11■■□□□ 1.93
PKP3-209ENST00000533069 HECW1Q76N89 1606 aa27.1■■□□□ 1.93
PKP3-209ENST00000533069 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
PKP3-209ENST00000533069 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
PKP3-209ENST00000533069 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.02■■□□□ 1.92
PKP3-209ENST00000533069 CLIP1P30622 1438 aa27.01■■□□□ 1.91
PKP3-209ENST00000533069 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
PKP3-209ENST00000533069 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
PKP3-209ENST00000533069 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.99■■□□□ 1.91
PKP3-209ENST00000533069 NEO1Q92859 1461 aa26.98■■□□□ 1.91
PKP3-209ENST00000533069 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
PKP3-209ENST00000533069 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.96■■□□□ 1.91
PKP3-209ENST00000533069 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.94■■□□□ 1.94e-8■□□□□ 8.6
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PKP3-209ENST00000533069 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.91■■□□□ 1.9
PKP3-209ENST00000533069 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.89■■□□□ 1.9
PKP3-209ENST00000533069 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.89■■□□□ 1.9
PKP3-209ENST00000533069 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
PKP3-209ENST00000533069 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.85■■□□□ 1.89
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PKP3-209ENST00000533069 KIF14Q15058 1648 aa26.83■■□□□ 1.89
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PKP3-209ENST00000533069 PLCH2O75038 1416 aa26.82■■□□□ 1.88
PKP3-209ENST00000533069 CEP162Q5TB80 1403 aa26.82■■□□□ 1.88
PKP3-209ENST00000533069 AKNAQ7Z591 1439 aa26.81■■□□□ 1.88
PKP3-209ENST00000533069 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.8■■□□□ 1.88
PKP3-209ENST00000533069 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
PKP3-209ENST00000533069 RAPGEF3O95398 923 aa26.77■■□□□ 1.88
PKP3-209ENST00000533069 ADGRL1O94910 1474 aa26.75■■□□□ 1.87
PKP3-209ENST00000533069 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.74■■□□□ 1.87
PKP3-209ENST00000533069 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.72■■□□□ 1.87
PKP3-209ENST00000533069 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.71■■□□□ 1.87
PKP3-209ENST00000533069 RICTORQ6R327 1708 aa26.66■■□□□ 1.86
PKP3-209ENST00000533069 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.65■■□□□ 1.86
PKP3-209ENST00000533069 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.65■■□□□ 1.86
PKP3-209ENST00000533069 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.65■■□□□ 1.86
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