RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531895.5

ANKRD42-208, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 1,887 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-208ENST00000531895 ERCC6Q03468 1493 aa23.73■■□□□ 1.39
ANKRD42-208ENST00000531895 IFT140Q96RY7 1462 aa23.72■■□□□ 1.39
ANKRD42-208ENST00000531895 P3H3Q8IVL6 736 aa23.72■■□□□ 1.39
ANKRD42-208ENST00000531895 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
ANKRD42-208ENST00000531895 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.67■■□□□ 1.38
ANKRD42-208ENST00000531895 ADAMTS12P58397 1594 aa23.65■■□□□ 1.38
ANKRD42-208ENST00000531895 GRIN2BQ13224 1484 aa23.65■■□□□ 1.38
ANKRD42-208ENST00000531895 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.64■■□□□ 1.38
ANKRD42-208ENST00000531895 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.64■■□□□ 1.38
ANKRD42-208ENST00000531895 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
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ANKRD42-208ENST00000531895 MAP3K1Q13233 1512 aa23.58■■□□□ 1.37
ANKRD42-208ENST00000531895 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
ANKRD42-208ENST00000531895 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
ANKRD42-208ENST00000531895 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.52■■□□□ 1.36
ANKRD42-208ENST00000531895 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
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ANKRD42-208ENST00000531895 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD42-208ENST00000531895 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD42-208ENST00000531895 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
ANKRD42-208ENST00000531895 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.48■■□□□ 1.35
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ANKRD42-208ENST00000531895 FMN1Q68DA7 1419 aa23.44■■□□□ 1.34
ANKRD42-208ENST00000531895 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
ANKRD42-208ENST00000531895 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.42■■□□□ 1.34
ANKRD42-208ENST00000531895 GRIN2AQ12879 1464 aa23.41■■□□□ 1.34
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ANKRD42-208ENST00000531895 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.37■■□□□ 1.33
ANKRD42-208ENST00000531895 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.36■■□□□ 1.33
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ANKRD42-208ENST00000531895 CEP170Q5SW79 1584 aa23.31■■□□□ 1.32
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ANKRD42-208ENST00000531895 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
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ANKRD42-208ENST00000531895 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.22■■□□□ 1.31
ANKRD42-208ENST00000531895 NUP160Q12769 1436 aa23.22■■□□□ 1.31
ANKRD42-208ENST00000531895 FBLN2P98095 1184 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD42-208ENST00000531895 ITGAEP38570 1179 aa23.19■■□□□ 1.3
ANKRD42-208ENST00000531895 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.17■■□□□ 1.3
ANKRD42-208ENST00000531895 HECW1Q76N89 1606 aa23.17■■□□□ 1.3
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ANKRD42-208ENST00000531895 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.13■■□□□ 1.29
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ANKRD42-208ENST00000531895 NCOA2Q15596 1464 aa23.12■■□□□ 1.29
ANKRD42-208ENST00000531895 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
ANKRD42-208ENST00000531895 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.12■■□□□ 1.29
ANKRD42-208ENST00000531895 ARHGEF11O15085 1522 aa23.1■■□□□ 1.29
ANKRD42-208ENST00000531895 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.1■■□□□ 1.29
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ANKRD42-208ENST00000531895 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.04■■□□□ 1.28
ANKRD42-208ENST00000531895 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.03■■□□□ 1.28
ANKRD42-208ENST00000531895 CHD1O14646 1710 aa23.01■■□□□ 1.27
ANKRD42-208ENST00000531895 PLB1Q6P1J6 1458 aa23■■□□□ 1.27
ANKRD42-208ENST00000531895 PTPRKQ15262 1439 aa23■■□□□ 1.27
ANKRD42-208ENST00000531895 SETD5Q9C0A6 1442 aa23■■□□□ 1.27
ANKRD42-208ENST00000531895 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.97■■□□□ 1.27
ANKRD42-208ENST00000531895 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.94■■□□□ 1.26
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ANKRD42-208ENST00000531895 MIA2Q96PC5 1412 aa22.83■■□□□ 1.24
ANKRD42-208ENST00000531895 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
ANKRD42-208ENST00000531895 HFM1A2PYH4 1435 aa22.81■■□□□ 1.24
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ANKRD42-208ENST00000531895 KIF14Q15058 1648 aa22.78■■□□□ 1.24
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ANKRD42-208ENST00000531895 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.75■■□□□ 1.23
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ANKRD42-208ENST00000531895 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
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ANKRD42-208ENST00000531895 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.72■■□□□ 1.23
ANKRD42-208ENST00000531895 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
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ANKRD42-208ENST00000531895 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.68■■□□□ 1.22
ANKRD42-208ENST00000531895 KDM6BO15054 1643 aa22.68■■□□□ 1.22
ANKRD42-208ENST00000531895 ABCC5O15440 1437 aa22.67■■□□□ 1.22
ANKRD42-208ENST00000531895 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.66■■□□□ 1.22
ANKRD42-208ENST00000531895 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.66■■□□□ 1.22
ANKRD42-208ENST00000531895 DAPK1P53355 1430 aa22.66■■□□□ 1.22
ANKRD42-208ENST00000531895 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
ANKRD42-208ENST00000531895 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.65■■□□□ 1.22
ANKRD42-208ENST00000531895 UACAQ9BZF9 1416 aa22.65■■□□□ 1.22
ANKRD42-208ENST00000531895 AKNAQ7Z591 1439 aa22.64■■□□□ 1.21
ANKRD42-208ENST00000531895 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
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