RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531558.1

PICALM-215, Transcript of phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein, human

TSL 5

Gene PICALM, Length 565 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PICALM-215	ENST00000531558	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		43.38	■■■■■ 4.53
PICALM-215	ENST00000531558	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		43.36	■■■■■ 4.53
PICALM-215	ENST00000531558	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		43.32	■■■■■ 4.52
PICALM-215	ENST00000531558	JPH4	Q96JJ6	628 aa		43.3	■■■■■ 4.52
PICALM-215	ENST00000531558	EEA1	Q15075	1411 aa		43.3	■■■■■ 4.52
PICALM-215	ENST00000531558	PRX	Q9BXM0	1461 aa		43.28	■■■■■ 4.52
PICALM-215	ENST00000531558	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	43.25	■■■■■ 4.51
PICALM-215	ENST00000531558	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		43.2	■■■■■ 4.51
PICALM-215	ENST00000531558	IQGAP2	Q13576	1575 aa		43.13	■■■■■ 4.5
PICALM-215	ENST00000531558	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	43.05	■■■■■ 4.48
PICALM-215	ENST00000531558	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		42.95	■■■■■ 4.47
PICALM-215	ENST00000531558	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		42.92	■■■■■ 4.46
PICALM-215	ENST00000531558	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		42.9	■■■■■ 4.46
PICALM-215	ENST00000531558	KIF21B	O75037	1637 aa		42.84	■■■■■ 4.45
PICALM-215	ENST00000531558	DISP1	Q96F81	1524 aa		42.84	■■■■■ 4.45
PICALM-215	ENST00000531558	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		42.77	■■■■■ 4.44
PICALM-215	ENST00000531558	PTPRG	P23470	1445 aa		42.73	■■■■■ 4.43
PICALM-215	ENST00000531558	KIAA0556	O60303	1618 aa		42.73	■■■■■ 4.43
PICALM-215	ENST00000531558	GOLGA3	Q08378	1498 aa		42.67	■■■■■ 4.42
PICALM-215	ENST00000531558	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	42.61	■■■■■ 4.41
PICALM-215	ENST00000531558	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		42.59	■■■■■ 4.41
PICALM-215	ENST00000531558	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		42.48	■■■■■ 4.39
PICALM-215	ENST00000531558	SAMD9	Q5K651	1589 aa		42.46	■■■■■ 4.39
PICALM-215	ENST00000531558	UACA	Q9BZF9	1416 aa		42.46	■■■■■ 4.39
PICALM-215	ENST00000531558	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	42.45	■■■■■ 4.39
PICALM-215	ENST00000531558	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		42.43	■■■■■ 4.38
PICALM-215	ENST00000531558	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	42.43	■■■■■ 4.38
PICALM-215	ENST00000531558	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	42.42	■■■■■ 4.38
PICALM-215	ENST00000531558	ABCC2	Q92887	1545 aa		42.39	■■■■■ 4.38
PICALM-215	ENST00000531558	P3H3	Q8IVL6	736 aa		42.35	■■■■■ 4.37
PICALM-215	ENST00000531558	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	42.34	■■■■■ 4.37
PICALM-215	ENST00000531558	MAPKBP1	O60336	1514 aa		42.34	■■■■■ 4.37
PICALM-215	ENST00000531558	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		42.3	■■■■■ 4.36
PICALM-215	ENST00000531558	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		42.28	■■■■■ 4.36
PICALM-215	ENST00000531558	ABCA8	O94911	1581 aa		42.26	■■■■■ 4.36
PICALM-215	ENST00000531558	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		42.22	■■■■■ 4.35
PICALM-215	ENST00000531558	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		42.21	■■■■■ 4.35
PICALM-215	ENST00000531558	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		42.12	■■■■■ 4.33
PICALM-215	ENST00000531558	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	42.11	■■■■■ 4.33
PICALM-215	ENST00000531558	ASXL2	Q76L83	1435 aa		42.09	■■■■■ 4.33
PICALM-215	ENST00000531558	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		42.07	■■■■■ 4.33
PICALM-215	ENST00000531558	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		42.06	■■■■■ 4.32
PICALM-215	ENST00000531558	DIP2B	Q9P265	1576 aa		42.05	■■■■■ 4.32
PICALM-215	ENST00000531558	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		42.02	■■■■■ 4.32
PICALM-215	ENST00000531558	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		42	■■■■■ 4.31
PICALM-215	ENST00000531558	ATP10B	O94823	1461 aa		41.91	■■■■■ 4.3
PICALM-215	ENST00000531558	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	41.91	■■■■■ 4.3
PICALM-215	ENST00000531558	ARID3C	A6NKF2	412 aa		41.89	■■■■■ 4.3
PICALM-215	ENST00000531558	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		41.89	■■■■■ 4.3
PICALM-215	ENST00000531558	FMN1	Q68DA7	1419 aa		41.88	■■■■■ 4.3
PICALM-215	ENST00000531558	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	41.85	■■■■■ 4.29
PICALM-215	ENST00000531558	GLI2	P10070	1586 aa		41.84	■■■■■ 4.29
PICALM-215	ENST00000531558	CLIP1	P30622	1438 aa		41.82	■■■■■ 4.29
PICALM-215	ENST00000531558	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	41.69	■■■■■ 4.26
PICALM-215	ENST00000531558	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	41.69	■■■■■ 4.26
PICALM-215	ENST00000531558	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		41.68	■■■■■ 4.26
PICALM-215	ENST00000531558	HECW1	Q76N89	1606 aa		41.67	■■■■■ 4.26
PICALM-215	ENST00000531558	CEP162	Q5TB80	1403 aa		41.65	■■■■■ 4.26
PICALM-215	ENST00000531558	KCNH8	Q96L42	1107 aa		41.64	■■■■■ 4.26
PICALM-215	ENST00000531558	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		41.63	■■■■■ 4.26
PICALM-215	ENST00000531558	TSPOAP1	O95153	1857 aa		41.61	■■■■■ 4.25
PICALM-215	ENST00000531558	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	41.6	■■■■■ 4.25
PICALM-215	ENST00000531558	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	41.58	■■■■■ 4.25
PICALM-215	ENST00000531558	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		41.57	■■■■■ 4.25
PICALM-215	ENST00000531558	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	41.55	■■■■■ 4.24
PICALM-215	ENST00000531558	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	41.55	■■■■■ 4.24
PICALM-215	ENST00000531558	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		41.51	■■■■■ 4.24
PICALM-215	ENST00000531558	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		41.51	■■■■■ 4.24
PICALM-215	ENST00000531558	CD109	Q6YHK3	1445 aa		41.48	■■■■■ 4.23
PICALM-215	ENST00000531558	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		41.47	■■■■■ 4.23
PICALM-215	ENST00000531558	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		41.45	■■■■■ 4.23
PICALM-215	ENST00000531558	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		41.44	■■■■■ 4.22
PICALM-215	ENST00000531558	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		41.42	■■■■■ 4.22
PICALM-215	ENST00000531558	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		41.41	■■■■■ 4.22
PICALM-215	ENST00000531558	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		41.41	■■■■■ 4.22
PICALM-215	ENST00000531558	KDM6B	O15054	1643 aa		41.36	■■■■■ 4.21
PICALM-215	ENST00000531558	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	41.36	■■■■■ 4.21
PICALM-215	ENST00000531558	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	41.27	■■■■■ 4.2
PICALM-215	ENST00000531558	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	41.27	■■■■■ 4.2	2e-43	■■□□□ 12.3
PICALM-215	ENST00000531558	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		41.23	■■■■■ 4.19
PICALM-215	ENST00000531558	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	41.19	■■■■■ 4.18
PICALM-215	ENST00000531558	KIF14	Q15058	1648 aa		41.18	■■■■■ 4.18
PICALM-215	ENST00000531558	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		41.15	■■■■■ 4.18
PICALM-215	ENST00000531558	NEO1	Q92859	1461 aa		41.11	■■■■■ 4.17
PICALM-215	ENST00000531558	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		41.1	■■■■■ 4.17
PICALM-215	ENST00000531558	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		41.05	■■■■■ 4.16
PICALM-215	ENST00000531558	PLCH2	O75038	1416 aa		41.03	■■■■■ 4.16
PICALM-215	ENST00000531558	FANCA	O15360	1455 aa		41.02	■■■■■ 4.16
PICALM-215	ENST00000531558	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		40.99	■■■■■ 4.15
PICALM-215	ENST00000531558	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		40.97	■■■■■ 4.15
PICALM-215	ENST00000531558	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		40.96	■■■■■ 4.15
PICALM-215	ENST00000531558	AKNA	Q7Z591	1439 aa		40.94	■■■■■ 4.14
PICALM-215	ENST00000531558	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		40.9	■■■■■ 4.14
PICALM-215	ENST00000531558	TIAM1	Q13009	1591 aa		40.89	■■■■■ 4.14
PICALM-215	ENST00000531558	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		40.86	■■■■■ 4.13
PICALM-215	ENST00000531558	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		40.85	■■■■■ 4.13
PICALM-215	ENST00000531558	PREX2	Q70Z35	1606 aa		40.83	■■■■■ 4.13
PICALM-215	ENST00000531558	RAPGEF3	O95398	923 aa		40.82	■■■■■ 4.13
PICALM-215	ENST00000531558	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	40.82	■■■■■ 4.12
PICALM-215	ENST00000531558	ADGRL1	O94910	1474 aa		40.81	■■■■■ 4.12

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