RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531290.5

TRAPPC4-210, Transcript of trafficking protein particle complex 4, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC4, Length 1,135 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4-210ENST00000531290 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.39■■■■□ 3.74
TRAPPC4-210ENST00000531290 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.39■■■■□ 3.74
TRAPPC4-210ENST00000531290 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.38■■■■□ 3.73
TRAPPC4-210ENST00000531290 CUL7Q14999 1698 aa38.35■■■■□ 3.73
TRAPPC4-210ENST00000531290 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP38.27■■■■□ 3.72
TRAPPC4-210ENST00000531290 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP38.07■■■■□ 3.68
TRAPPC4-210ENST00000531290 PTPRGP23470 1445 aa38.06■■■■□ 3.68
TRAPPC4-210ENST00000531290 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa38.06■■■■□ 3.68
TRAPPC4-210ENST00000531290 FAM69CQ0P6D2 419 aa38.02■■■■□ 3.68
TRAPPC4-210ENST00000531290 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.01■■■■□ 3.67
TRAPPC4-210ENST00000531290 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.99■■■■□ 3.67
TRAPPC4-210ENST00000531290 ADCY10Q96PN6 1610 aa37.95■■■■□ 3.67
TRAPPC4-210ENST00000531290 IQGAP2Q13576 1575 aa37.95■■■■□ 3.67
TRAPPC4-210ENST00000531290 ABCC10Q5T3U5 1492 aa37.93■■■■□ 3.66
TRAPPC4-210ENST00000531290 MAPKBP1O60336 1514 aa37.92■■■■□ 3.66
TRAPPC4-210ENST00000531290 KIF13AQ9H1H9 1805 aa37.8■■■■□ 3.64
TRAPPC4-210ENST00000531290 DISP1Q96F81 1524 aa37.79■■■■□ 3.64
TRAPPC4-210ENST00000531290 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP37.77■■■■□ 3.64
TRAPPC4-210ENST00000531290 UGGT2Q9NYU1 1516 aa37.75■■■■□ 3.63
TRAPPC4-210ENST00000531290 ABCC2Q92887 1545 aa37.73■■■■□ 3.63
TRAPPC4-210ENST00000531290 UACAQ9BZF9 1416 aa37.73■■■■□ 3.63
TRAPPC4-210ENST00000531290 DIP2BQ9P265 1576 aa37.72■■■■□ 3.63
TRAPPC4-210ENST00000531290 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa37.69■■■■□ 3.62
TRAPPC4-210ENST00000531290 PRXQ9BXM0 1461 aa37.64■■■■□ 3.62
TRAPPC4-210ENST00000531290 ASXL2Q76L83 1435 aa37.61■■■■□ 3.61
TRAPPC4-210ENST00000531290 PLB1Q6P1J6 1458 aa37.61■■■■□ 3.61
TRAPPC4-210ENST00000531290 KIAA0556O60303 1618 aa37.58■■■■□ 3.61
TRAPPC4-210ENST00000531290 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.56■■■■□ 3.6
TRAPPC4-210ENST00000531290 GOLGA3Q08378 1498 aa37.54■■■■□ 3.6
TRAPPC4-210ENST00000531290 KDM5BQ9UGL1 1544 aa37.5■■■■□ 3.59
TRAPPC4-210ENST00000531290 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.44■■■■□ 3.58
TRAPPC4-210ENST00000531290 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.44■■■■□ 3.58
TRAPPC4-210ENST00000531290 GLI2P10070 1586 aa37.39■■■■□ 3.58
TRAPPC4-210ENST00000531290 KDM6BO15054 1643 aa37.37■■■■□ 3.57
TRAPPC4-210ENST00000531290 TSPOAP1O95153 1857 aa37.36■■■■□ 3.57
TRAPPC4-210ENST00000531290 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP37.36■■■■□ 3.57
TRAPPC4-210ENST00000531290 P3H3Q8IVL6 736 aa37.34■■■■□ 3.57
TRAPPC4-210ENST00000531290 EEA1Q15075 1411 aa37.34■■■■□ 3.57
TRAPPC4-210ENST00000531290 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP37.31■■■■□ 3.56
TRAPPC4-210ENST00000531290 WDR7Q9Y4E6 1490 aa37.26■■■■□ 3.55
TRAPPC4-210ENST00000531290 KCNH8Q96L42 1107 aa37.24■■■■□ 3.55
TRAPPC4-210ENST00000531290 ABCA8O94911 1581 aa37.24■■■■□ 3.55
TRAPPC4-210ENST00000531290 TEX14Q8IWB6 1497 aa37.17■■■■□ 3.54
TRAPPC4-210ENST00000531290 ARID3CA6NKF2 412 aa37.16■■■■□ 3.54
TRAPPC4-210ENST00000531290 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.16■■■■□ 3.54
TRAPPC4-210ENST00000531290 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP37.12■■■■□ 3.53
TRAPPC4-210ENST00000531290 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa37.12■■■■□ 3.53
TRAPPC4-210ENST00000531290 CD109Q6YHK3 1445 aa37.08■■■■□ 3.53
TRAPPC4-210ENST00000531290 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa37.07■■■■□ 3.52
TRAPPC4-210ENST00000531290 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP37.06■■■■□ 3.52
TRAPPC4-210ENST00000531290 ATP10BO94823 1461 aa37.04■■■■□ 3.52
TRAPPC4-210ENST00000531290 SAMD9Q5K651 1589 aa37.01■■■■□ 3.52
TRAPPC4-210ENST00000531290 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP37.01■■■■□ 3.52
TRAPPC4-210ENST00000531290 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP37.01■■■■□ 3.52
TRAPPC4-210ENST00000531290 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.01■■■■□ 3.52
TRAPPC4-210ENST00000531290 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa36.97■■■■□ 3.51
TRAPPC4-210ENST00000531290 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.93■■■■□ 3.5
TRAPPC4-210ENST00000531290 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.89■■■■□ 3.5
TRAPPC4-210ENST00000531290 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.89■■■■□ 3.5
TRAPPC4-210ENST00000531290 KIF21BO75037 1637 aa36.88■■■■□ 3.49
TRAPPC4-210ENST00000531290 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.87■■■■□ 3.49
TRAPPC4-210ENST00000531290 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.85■■■■□ 3.49
TRAPPC4-210ENST00000531290 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP36.81■■■■□ 3.48
TRAPPC4-210ENST00000531290 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.78■■■■□ 3.48
TRAPPC4-210ENST00000531290 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.77■■■■□ 3.48
TRAPPC4-210ENST00000531290 ADGRL1O94910 1474 aa36.73■■■■□ 3.47
TRAPPC4-210ENST00000531290 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.72■■■■□ 3.47
TRAPPC4-210ENST00000531290 ARAP3Q8WWN8 1544 aa36.67■■■■□ 3.46
TRAPPC4-210ENST00000531290 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.67■■■■□ 3.46
TRAPPC4-210ENST00000531290 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.62■■■■□ 3.45
TRAPPC4-210ENST00000531290 NEO1Q92859 1461 aa36.58■■■■□ 3.45
TRAPPC4-210ENST00000531290 RAPGEF3O95398 923 aa36.58■■■■□ 3.45
TRAPPC4-210ENST00000531290 FMN1Q68DA7 1419 aa36.54■■■■□ 3.44
TRAPPC4-210ENST00000531290 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.5■■■■□ 3.43
TRAPPC4-210ENST00000531290 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.46■■■■□ 3.43
TRAPPC4-210ENST00000531290 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
TRAPPC4-210ENST00000531290 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.4■■■■□ 3.42
TRAPPC4-210ENST00000531290 AKNAQ7Z591 1439 aa36.4■■■■□ 3.42
TRAPPC4-210ENST00000531290 FANCAO15360 1455 aa36.38■■■■□ 3.41
TRAPPC4-210ENST00000531290 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
TRAPPC4-210ENST00000531290 HECW1Q76N89 1606 aa36.33■■■■□ 3.41
TRAPPC4-210ENST00000531290 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.32■■■■□ 3.4
TRAPPC4-210ENST00000531290 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.28■■■■□ 3.4
TRAPPC4-210ENST00000531290 PLCH2O75038 1416 aa36.28■■■■□ 3.4
TRAPPC4-210ENST00000531290 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.25■■■■□ 3.39
TRAPPC4-210ENST00000531290 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.24■■■■□ 3.39
TRAPPC4-210ENST00000531290 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.24■■■■□ 3.39
TRAPPC4-210ENST00000531290 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
TRAPPC4-210ENST00000531290 CLIP1P30622 1438 aa36.19■■■■□ 3.38
TRAPPC4-210ENST00000531290 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.18■■■■□ 3.38
TRAPPC4-210ENST00000531290 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.14■■■■□ 3.38
TRAPPC4-210ENST00000531290 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.1■■■■□ 3.37
TRAPPC4-210ENST00000531290 RICTORQ6R327 1708 aa36.09■■■■□ 3.37
TRAPPC4-210ENST00000531290 MAGI2Q86UL8 1455 aa36.09■■■■□ 3.37
TRAPPC4-210ENST00000531290 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.08■■■■□ 3.37
TRAPPC4-210ENST00000531290 PTPRMP28827 1452 aa36.08■■■■□ 3.37
TRAPPC4-210ENST00000531290 KIF14Q15058 1648 aa36.08■■■■□ 3.37
TRAPPC4-210ENST00000531290 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.07■■■■□ 3.36
TRAPPC4-210ENST00000531290 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.06■■■■□ 3.36
TRAPPC4-210ENST00000531290 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.06■■■■□ 3.36
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