RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.96■■■□□ 2.71
PACSIN3-208ENST00000531226 EEA1Q15075 1411 aa31.95■■■□□ 2.71
PACSIN3-208ENST00000531226 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.94■■■□□ 2.7
PACSIN3-208ENST00000531226 PRXQ9BXM0 1461 aa31.91■■■□□ 2.7
PACSIN3-208ENST00000531226 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.87■■■□□ 2.69
PACSIN3-208ENST00000531226 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.86■■■□□ 2.69
PACSIN3-208ENST00000531226 JPH4Q96JJ6 628 aa31.86■■■□□ 2.69
PACSIN3-208ENST00000531226 IQGAP2Q13576 1575 aa31.85■■■□□ 2.69
PACSIN3-208ENST00000531226 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.84■■■□□ 2.69
PACSIN3-208ENST00000531226 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.82■■■□□ 2.68
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.67
PACSIN3-208ENST00000531226 KIF21BO75037 1637 aa31.69■■■□□ 2.66
PACSIN3-208ENST00000531226 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.66■■■□□ 2.66
PACSIN3-208ENST00000531226 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.6■■■□□ 2.65
PACSIN3-208ENST00000531226 DISP1Q96F81 1524 aa31.59■■■□□ 2.65
PACSIN3-208ENST00000531226 KIAA0556O60303 1618 aa31.57■■■□□ 2.64
PACSIN3-208ENST00000531226 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.49■■■□□ 2.63
PACSIN3-208ENST00000531226 GOLGA3Q08378 1498 aa31.46■■■□□ 2.63
PACSIN3-208ENST00000531226 PTPRGP23470 1445 aa31.45■■■□□ 2.63
PACSIN3-208ENST00000531226 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.45■■■□□ 2.62
PACSIN3-208ENST00000531226 SAMD9Q5K651 1589 aa31.39■■■□□ 2.61
PACSIN3-208ENST00000531226 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
PACSIN3-208ENST00000531226 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa31.27■■■□□ 2.6
PACSIN3-208ENST00000531226 UACAQ9BZF9 1416 aa31.27■■■□□ 2.6
PACSIN3-208ENST00000531226 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.27■■■□□ 2.6
PACSIN3-208ENST00000531226 ABCC2Q92887 1545 aa31.27■■■□□ 2.6
PACSIN3-208ENST00000531226 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.25■■■□□ 2.59
PACSIN3-208ENST00000531226 EFCAB5A4FU69 1503 aa31.23■■■□□ 2.59
PACSIN3-208ENST00000531226 MAPKBP1O60336 1514 aa31.22■■■□□ 2.59
PACSIN3-208ENST00000531226 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.2■■■□□ 2.59
PACSIN3-208ENST00000531226 ABCA8O94911 1581 aa31.2■■■□□ 2.58
PACSIN3-208ENST00000531226 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.19■■■□□ 2.58
PACSIN3-208ENST00000531226 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.17■■■□□ 2.58
PACSIN3-208ENST00000531226 P3H3Q8IVL6 736 aa31.17■■■□□ 2.58
PACSIN3-208ENST00000531226 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
PACSIN3-208ENST00000531226 KIF13AQ9H1H9 1805 aa31.16■■■□□ 2.58
PACSIN3-208ENST00000531226 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
PACSIN3-208ENST00000531226 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.13■■■□□ 2.57
PACSIN3-208ENST00000531226 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.11■■■□□ 2.57
PACSIN3-208ENST00000531226 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa31.07■■■□□ 2.56
PACSIN3-208ENST00000531226 DIP2BQ9P265 1576 aa31.05■■■□□ 2.56
PACSIN3-208ENST00000531226 ABCC10Q5T3U5 1492 aa31.03■■■□□ 2.56
PACSIN3-208ENST00000531226 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.03■■■□□ 2.56
PACSIN3-208ENST00000531226 ASXL2Q76L83 1435 aa30.99■■■□□ 2.55
PACSIN3-208ENST00000531226 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.88■■■□□ 2.53
PACSIN3-208ENST00000531226 FMN1Q68DA7 1419 aa30.88■■■□□ 2.53
PACSIN3-208ENST00000531226 ATP10BO94823 1461 aa30.88■■■□□ 2.53
PACSIN3-208ENST00000531226 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.87■■■□□ 2.53
PACSIN3-208ENST00000531226 GLI2P10070 1586 aa30.87■■■□□ 2.53
PACSIN3-208ENST00000531226 TSPOAP1O95153 1857 aa30.84■■■□□ 2.53
PACSIN3-208ENST00000531226 CLIP1P30622 1438 aa30.84■■■□□ 2.53
PACSIN3-208ENST00000531226 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
PACSIN3-208ENST00000531226 HECW1Q76N89 1606 aa30.81■■■□□ 2.52
PACSIN3-208ENST00000531226 ARID3CA6NKF2 412 aa30.8■■■□□ 2.52
PACSIN3-208ENST00000531226 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa30.77■■■□□ 2.52
PACSIN3-208ENST00000531226 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
PACSIN3-208ENST00000531226 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.73■■■□□ 2.51
PACSIN3-208ENST00000531226 CEP162Q5TB80 1403 aa30.73■■■□□ 2.51
PACSIN3-208ENST00000531226 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
PACSIN3-208ENST00000531226 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.71■■■□□ 2.51
PACSIN3-208ENST00000531226 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.71■■■□□ 2.51
PACSIN3-208ENST00000531226 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.69■■■□□ 2.5
PACSIN3-208ENST00000531226 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
PACSIN3-208ENST00000531226 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
PACSIN3-208ENST00000531226 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.64■■■□□ 2.5
PACSIN3-208ENST00000531226 KCNH8Q96L42 1107 aa30.62■■■□□ 2.49
PACSIN3-208ENST00000531226 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.62■■■□□ 2.49
PACSIN3-208ENST00000531226 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.61■■■□□ 2.49
PACSIN3-208ENST00000531226 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
PACSIN3-208ENST00000531226 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.56■■■□□ 2.48
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.56■■■□□ 2.48
PACSIN3-208ENST00000531226 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.55■■■□□ 2.48
PACSIN3-208ENST00000531226 CD109Q6YHK3 1445 aa30.54■■■□□ 2.48
PACSIN3-208ENST00000531226 KDM6BO15054 1643 aa30.53■■■□□ 2.48
PACSIN3-208ENST00000531226 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.52■■■□□ 2.48
PACSIN3-208ENST00000531226 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.47■■■□□ 2.47
PACSIN3-208ENST00000531226 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.45■■■□□ 2.47
PACSIN3-208ENST00000531226 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.47
PACSIN3-208ENST00000531226 KIF14Q15058 1648 aa30.43■■■□□ 2.46
PACSIN3-208ENST00000531226 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
PACSIN3-208ENST00000531226 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.37■■■□□ 2.45
PACSIN3-208ENST00000531226 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.37■■■□□ 2.45
PACSIN3-208ENST00000531226 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.32■■■□□ 2.44
PACSIN3-208ENST00000531226 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
PACSIN3-208ENST00000531226 NEO1Q92859 1461 aa30.31■■■□□ 2.44
PACSIN3-208ENST00000531226 ARAP3Q8WWN8 1544 aa30.26■■■□□ 2.43
PACSIN3-208ENST00000531226 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.26■■■□□ 2.43
PACSIN3-208ENST00000531226 PLCH2O75038 1416 aa30.23■■■□□ 2.43
PACSIN3-208ENST00000531226 FANCAO15360 1455 aa30.23■■■□□ 2.43
PACSIN3-208ENST00000531226 TIAM1Q13009 1591 aa30.23■■■□□ 2.43
PACSIN3-208ENST00000531226 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.22■■■□□ 2.43
PACSIN3-208ENST00000531226 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.22■■■□□ 2.43
PACSIN3-208ENST00000531226 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.22■■■□□ 2.43
PACSIN3-208ENST00000531226 PREX2Q70Z35 1606 aa30.21■■■□□ 2.43
PACSIN3-208ENST00000531226 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.18■■■□□ 2.42
PACSIN3-208ENST00000531226 AKNAQ7Z591 1439 aa30.15■■■□□ 2.42
PACSIN3-208ENST00000531226 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.14■■■□□ 2.42
PACSIN3-208ENST00000531226 RICTORQ6R327 1708 aa30.13■■■□□ 2.41
PACSIN3-208ENST00000531226 MAP3K1Q13233 1512 aa30.13■■■□□ 2.41
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