RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530925.5

SERGEF-214, Transcript of secretion regulating guanine nucleotide exchange factor, humanhuman

TSL 3

Gene SERGEF, Length 793 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERGEF-214ENST00000530925 JPH4Q96JJ6 628 aa38.74■■■■□ 3.79
SERGEF-214ENST00000530925 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.73■■■■□ 3.79
SERGEF-214ENST00000530925 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.73■■■■□ 3.79
SERGEF-214ENST00000530925 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.59■■■■□ 3.77
SERGEF-214ENST00000530925 IQGAP2Q13576 1575 aa38.51■■■■□ 3.76
SERGEF-214ENST00000530925 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.48■■■■□ 3.75
SERGEF-214ENST00000530925 PRXQ9BXM0 1461 aa38.36■■■■□ 3.73
SERGEF-214ENST00000530925 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.33■■■■□ 3.73
SERGEF-214ENST00000530925 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa38.32■■■■□ 3.73
SERGEF-214ENST00000530925 UGGT2Q9NYU1 1516 aa38.26■■■■□ 3.72
SERGEF-214ENST00000530925 ADCY10Q96PN6 1610 aa38.24■■■■□ 3.71
SERGEF-214ENST00000530925 DISP1Q96F81 1524 aa38.23■■■■□ 3.71
SERGEF-214ENST00000530925 EEA1Q15075 1411 aa38.22■■■■□ 3.71
SERGEF-214ENST00000530925 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.22■■■■□ 3.71
SERGEF-214ENST00000530925 PTPRGP23470 1445 aa38.21■■■■□ 3.71
SERGEF-214ENST00000530925 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.21■■■■□ 3.71
SERGEF-214ENST00000530925 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP38.17■■■■□ 3.7
SERGEF-214ENST00000530925 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.16■■■■□ 3.7
SERGEF-214ENST00000530925 KIAA0556O60303 1618 aa38.15■■■■□ 3.7
SERGEF-214ENST00000530925 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP38.09■■■■□ 3.69
SERGEF-214ENST00000530925 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.07■■■■□ 3.68
SERGEF-214ENST00000530925 MAPKBP1O60336 1514 aa38.04■■■■□ 3.68
SERGEF-214ENST00000530925 KIF13AQ9H1H9 1805 aa38.01■■■■□ 3.67
SERGEF-214ENST00000530925 GOLGA3Q08378 1498 aa38■■■■□ 3.67
SERGEF-214ENST00000530925 UACAQ9BZF9 1416 aa37.95■■■■□ 3.67
SERGEF-214ENST00000530925 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa37.95■■■■□ 3.67
SERGEF-214ENST00000530925 ABCC2Q92887 1545 aa37.94■■■■□ 3.66
SERGEF-214ENST00000530925 KIF21BO75037 1637 aa37.91■■■■□ 3.66
SERGEF-214ENST00000530925 ABCC10Q5T3U5 1492 aa37.89■■■■□ 3.66
SERGEF-214ENST00000530925 DIP2BQ9P265 1576 aa37.87■■■■□ 3.65
SERGEF-214ENST00000530925 FAM69CQ0P6D2 419 aa37.8■■■■□ 3.64
SERGEF-214ENST00000530925 PLB1Q6P1J6 1458 aa37.78■■■■□ 3.64
SERGEF-214ENST00000530925 SAMD9Q5K651 1589 aa37.78■■■■□ 3.64
SERGEF-214ENST00000530925 KDM5BQ9UGL1 1544 aa37.77■■■■□ 3.64
SERGEF-214ENST00000530925 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP37.76■■■■□ 3.63
SERGEF-214ENST00000530925 ABCA8O94911 1581 aa37.74■■■■□ 3.63
SERGEF-214ENST00000530925 ASXL2Q76L83 1435 aa37.73■■■■□ 3.63
SERGEF-214ENST00000530925 P3H3Q8IVL6 736 aa37.72■■■■□ 3.63
SERGEF-214ENST00000530925 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.64■■■■□ 3.62
SERGEF-214ENST00000530925 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.62■■■■□ 3.61
SERGEF-214ENST00000530925 TSPOAP1O95153 1857 aa37.6■■■■□ 3.61
SERGEF-214ENST00000530925 GLI2P10070 1586 aa37.56■■■■□ 3.6
SERGEF-214ENST00000530925 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.54■■■■□ 3.6
SERGEF-214ENST00000530925 EFCAB5A4FU69 1503 aa37.53■■■■□ 3.6
SERGEF-214ENST00000530925 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.53■■■■□ 3.6
SERGEF-214ENST00000530925 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP37.51■■■■□ 3.6
SERGEF-214ENST00000530925 WDR7Q9Y4E6 1490 aa37.5■■■■□ 3.59
SERGEF-214ENST00000530925 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa37.5■■■■□ 3.59
SERGEF-214ENST00000530925 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP37.41■■■■□ 3.58
SERGEF-214ENST00000530925 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa37.41■■■■□ 3.58
SERGEF-214ENST00000530925 ARID3CA6NKF2 412 aa37.41■■■■□ 3.58
SERGEF-214ENST00000530925 ATP10BO94823 1461 aa37.39■■■■□ 3.58
SERGEF-214ENST00000530925 KDM6BO15054 1643 aa37.36■■■■□ 3.57
SERGEF-214ENST00000530925 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.33■■■■□ 3.57
SERGEF-214ENST00000530925 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.28■■■■□ 3.56
SERGEF-214ENST00000530925 KCNH8Q96L42 1107 aa37.28■■■■□ 3.56
SERGEF-214ENST00000530925 CFAP43Q8NDM7 1665 aa37.26■■■■□ 3.56
SERGEF-214ENST00000530925 TEX14Q8IWB6 1497 aa37.22■■■■□ 3.55
SERGEF-214ENST00000530925 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP37.21■■■■□ 3.55
SERGEF-214ENST00000530925 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP37.21■■■■□ 3.55
SERGEF-214ENST00000530925 CD109Q6YHK3 1445 aa37.17■■■■□ 3.54
SERGEF-214ENST00000530925 FMN1Q68DA7 1419 aa37.16■■■■□ 3.54
SERGEF-214ENST00000530925 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa37.12■■■■□ 3.53
SERGEF-214ENST00000530925 ABCA9Q8IUA7 1624 aa37.1■■■■□ 3.53
SERGEF-214ENST00000530925 HECW1Q76N89 1606 aa37.08■■■■□ 3.53
SERGEF-214ENST00000530925 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP37.06■■■■□ 3.52
SERGEF-214ENST00000530925 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP37.04■■■■□ 3.52
SERGEF-214ENST00000530925 PLEKHD1A6NEE1 506 aa37■■■■□ 3.51
SERGEF-214ENST00000530925 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP37■■■■□ 3.51
SERGEF-214ENST00000530925 CLIP1P30622 1438 aa36.94■■■■□ 3.5
SERGEF-214ENST00000530925 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.91■■■■□ 3.5
SERGEF-214ENST00000530925 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.9■■■■□ 3.5
SERGEF-214ENST00000530925 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.86■■■■□ 3.49
SERGEF-214ENST00000530925 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.84■■■■□ 3.49
SERGEF-214ENST00000530925 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.84■■■■□ 3.49
SERGEF-214ENST00000530925 ARAP3Q8WWN8 1544 aa36.8■■■■□ 3.48
SERGEF-214ENST00000530925 NEO1Q92859 1461 aa36.8■■■■□ 3.48
SERGEF-214ENST00000530925 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36.78■■■■□ 3.48
SERGEF-214ENST00000530925 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.77■■■■□ 3.48
SERGEF-214ENST00000530925 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.77■■■■□ 3.48
SERGEF-214ENST00000530925 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.75■■■■□ 3.47
SERGEF-214ENST00000530925 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.75■■■■□ 3.47
SERGEF-214ENST00000530925 KIF14Q15058 1648 aa36.71■■■■□ 3.47
SERGEF-214ENST00000530925 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.71■■■■□ 3.47
SERGEF-214ENST00000530925 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.7■■■■□ 3.47
SERGEF-214ENST00000530925 CEP162Q5TB80 1403 aa36.7■■■■□ 3.47
SERGEF-214ENST00000530925 FANCAO15360 1455 aa36.68■■■■□ 3.46
SERGEF-214ENST00000530925 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.65■■■■□ 3.46
SERGEF-214ENST00000530925 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.61■■■■□ 3.45
SERGEF-214ENST00000530925 AKNAQ7Z591 1439 aa36.6■■■■□ 3.45
SERGEF-214ENST00000530925 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.6■■■■□ 3.45
SERGEF-214ENST00000530925 PLCH2O75038 1416 aa36.59■■■■□ 3.45
SERGEF-214ENST00000530925 RAPGEF3O95398 923 aa36.59■■■■□ 3.45
SERGEF-214ENST00000530925 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.58■■■■□ 3.45
SERGEF-214ENST00000530925 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
SERGEF-214ENST00000530925 RICTORQ6R327 1708 aa36.54■■■■□ 3.44
SERGEF-214ENST00000530925 ADGRL1O94910 1474 aa36.53■■■■□ 3.44
SERGEF-214ENST00000530925 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.45■■■■□ 3.43
SERGEF-214ENST00000530925 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.44■■■■□ 3.42
SERGEF-214ENST00000530925 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.43■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms