RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530500.5

ATG13-216, Transcript of autophagy related 13, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG13, Length 2,030 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13-216ENST00000530500 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.07■■□□□ 1.44
ATG13-216ENST00000530500 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.05■■□□□ 1.44
ATG13-216ENST00000530500 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
ATG13-216ENST00000530500 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.03■■□□□ 1.44
ATG13-216ENST00000530500 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.01■■□□□ 1.43
ATG13-216ENST00000530500 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24■■□□□ 1.437e-6■□□□□ 9.9
ATG13-216ENST00000530500 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
ATG13-216ENST00000530500 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.99■■□□□ 1.43
ATG13-216ENST00000530500 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.98■■□□□ 1.43
ATG13-216ENST00000530500 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
ATG13-216ENST00000530500 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.95■■□□□ 1.43
ATG13-216ENST00000530500 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.95■■□□□ 1.42
ATG13-216ENST00000530500 P3H3Q8IVL6 736 aa23.94■■□□□ 1.42
ATG13-216ENST00000530500 FMN1Q68DA7 1419 aa23.94■■□□□ 1.42
ATG13-216ENST00000530500 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.92■■□□□ 1.42
ATG13-216ENST00000530500 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
ATG13-216ENST00000530500 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
ATG13-216ENST00000530500 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
ATG13-216ENST00000530500 SAMD9Q5K651 1589 aa23.88■■□□□ 1.41
ATG13-216ENST00000530500 PBRM1Q86U86 1689 aa23.84■■□□□ 1.41
ATG13-216ENST00000530500 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
ATG13-216ENST00000530500 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.83■■□□□ 1.4
ATG13-216ENST00000530500 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.81■■□□□ 1.4
ATG13-216ENST00000530500 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.77■■□□□ 1.4
ATG13-216ENST00000530500 IFT140Q96RY7 1462 aa23.76■■□□□ 1.39
ATG13-216ENST00000530500 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
ATG13-216ENST00000530500 GRIN2BQ13224 1484 aa23.76■■□□□ 1.39
ATG13-216ENST00000530500 WDR62O43379 1518 aa23.75■■□□□ 1.39
ATG13-216ENST00000530500 ITGAEP38570 1179 aa23.75■■□□□ 1.39
ATG13-216ENST00000530500 ADAMTS12P58397 1594 aa23.75■■□□□ 1.39
ATG13-216ENST00000530500 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.71■■□□□ 1.39
ATG13-216ENST00000530500 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.7■■□□□ 1.39
ATG13-216ENST00000530500 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
ATG13-216ENST00000530500 IQGAP2Q13576 1575 aa23.68■■□□□ 1.38
ATG13-216ENST00000530500 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.67■■□□□ 1.38
ATG13-216ENST00000530500 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.63■■□□□ 1.37
ATG13-216ENST00000530500 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.62■■□□□ 1.37
ATG13-216ENST00000530500 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.62■■□□□ 1.37
ATG13-216ENST00000530500 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
ATG13-216ENST00000530500 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.59■■□□□ 1.37
ATG13-216ENST00000530500 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
ATG13-216ENST00000530500 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.57■■□□□ 1.36
ATG13-216ENST00000530500 ERCC6Q03468 1493 aa23.57■■□□□ 1.36
ATG13-216ENST00000530500 HECW1Q76N89 1606 aa23.57■■□□□ 1.36
ATG13-216ENST00000530500 NCOA2Q15596 1464 aa23.55■■□□□ 1.36
ATG13-216ENST00000530500 MAPKBP1O60336 1514 aa23.54■■□□□ 1.36
ATG13-216ENST00000530500 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.53■■□□□ 1.36
ATG13-216ENST00000530500 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.53■■□□□ 1.36
ATG13-216ENST00000530500 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
ATG13-216ENST00000530500 ARHGEF11O15085 1522 aa23.49■■□□□ 1.35
ATG13-216ENST00000530500 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
ATG13-216ENST00000530500 GRIN2AQ12879 1464 aa23.47■■□□□ 1.35
ATG13-216ENST00000530500 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
ATG13-216ENST00000530500 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
ATG13-216ENST00000530500 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.43■■□□□ 1.34
ATG13-216ENST00000530500 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
ATG13-216ENST00000530500 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.43■■□□□ 1.34
ATG13-216ENST00000530500 HFM1A2PYH4 1435 aa23.42■■□□□ 1.34
ATG13-216ENST00000530500 KIAA0556O60303 1618 aa23.42■■□□□ 1.34
ATG13-216ENST00000530500 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.41■■□□□ 1.34
ATG13-216ENST00000530500 DISP1Q96F81 1524 aa23.4■■□□□ 1.34
ATG13-216ENST00000530500 MIER1Q8N108 512 aa23.38■■□□□ 1.33
ATG13-216ENST00000530500 SYNJ2O15056 1496 aa23.38■■□□□ 1.33
ATG13-216ENST00000530500 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
ATG13-216ENST00000530500 PTPRKQ15262 1439 aa23.36■■□□□ 1.33
ATG13-216ENST00000530500 MIA2Q96PC5 1412 aa23.36■■□□□ 1.33
ATG13-216ENST00000530500 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
ATG13-216ENST00000530500 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
ATG13-216ENST00000530500 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
ATG13-216ENST00000530500 NEUROD1Q13562 356 aa23.33■■□□□ 1.32
ATG13-216ENST00000530500 UACAQ9BZF9 1416 aa23.32■■□□□ 1.32
ATG13-216ENST00000530500 NAIPQ13075 1403 aa23.32■■□□□ 1.32
ATG13-216ENST00000530500 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.3■■□□□ 1.32
ATG13-216ENST00000530500 CEP170Q5SW79 1584 aa23.28■■□□□ 1.32
ATG13-216ENST00000530500 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
ATG13-216ENST00000530500 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.27■■□□□ 1.32
ATG13-216ENST00000530500 AKNAQ7Z591 1439 aa23.27■■□□□ 1.32
ATG13-216ENST00000530500 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
ATG13-216ENST00000530500 NUP160Q12769 1436 aa23.25■■□□□ 1.31
ATG13-216ENST00000530500 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.23■■□□□ 1.31
ATG13-216ENST00000530500 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.22■■□□□ 1.31
ATG13-216ENST00000530500 FBLN2P98095 1184 aa23.19■■□□□ 1.3
ATG13-216ENST00000530500 ARID3CA6NKF2 412 aa23.18■■□□□ 1.3
ATG13-216ENST00000530500 JPH4Q96JJ6 628 aa23.18■■□□□ 1.3
ATG13-216ENST00000530500 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
ATG13-216ENST00000530500 TONSLQ96HA7 1378 aa23.13■■□□□ 1.29
ATG13-216ENST00000530500 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
ATG13-216ENST00000530500 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.13■■□□□ 1.29
ATG13-216ENST00000530500 ROCK1Q13464 1354 aa23.12■■□□□ 1.29
ATG13-216ENST00000530500 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
ATG13-216ENST00000530500 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.11■■□□□ 1.29
ATG13-216ENST00000530500 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.1■■□□□ 1.29
ATG13-216ENST00000530500 DAPK1P53355 1430 aa23.09■■□□□ 1.29
ATG13-216ENST00000530500 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
ATG13-216ENST00000530500 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.07■■□□□ 1.28
ATG13-216ENST00000530500 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.07■■□□□ 1.28
ATG13-216ENST00000530500 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.06■■□□□ 1.28
ATG13-216ENST00000530500 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
ATG13-216ENST00000530500 ABCC5O15440 1437 aa23.04■■□□□ 1.28
ATG13-216ENST00000530500 TRIM52Q96A61 297 aa23.03■■□□□ 1.28
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