RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529673.5

SNX15-206, Transcript of sorting nexin 15, humanhuman

TSL 3

Gene SNX15, Length 573 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15-206ENST00000529673 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.97■■□□□ 1.43
SNX15-206ENST00000529673 TOP2BQ02880 1626 aa23.96■■□□□ 1.43
SNX15-206ENST00000529673 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.96■■□□□ 1.43
SNX15-206ENST00000529673 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.96■■□□□ 1.43
SNX15-206ENST00000529673 DIP2BQ9P265 1576 aa23.95■■□□□ 1.43
SNX15-206ENST00000529673 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.95■■□□□ 1.43
SNX15-206ENST00000529673 KDM6BO15054 1643 aa23.95■■□□□ 1.42
SNX15-206ENST00000529673 JPH4Q96JJ6 628 aa23.92■■□□□ 1.42
SNX15-206ENST00000529673 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.84■■□□□ 1.41
SNX15-206ENST00000529673 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.83■■□□□ 1.41
SNX15-206ENST00000529673 TSPOAP1O95153 1857 aa23.75■■□□□ 1.39
SNX15-206ENST00000529673 ADGRL1O94910 1474 aa23.66■■□□□ 1.38
SNX15-206ENST00000529673 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.64■■□□□ 1.38
SNX15-206ENST00000529673 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.57■■□□□ 1.36
SNX15-206ENST00000529673 GLI2P10070 1586 aa23.56■■□□□ 1.36
SNX15-206ENST00000529673 PTPRGP23470 1445 aa23.55■■□□□ 1.36
SNX15-206ENST00000529673 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.55■■□□□ 1.36
SNX15-206ENST00000529673 ABCC2Q92887 1545 aa23.54■■□□□ 1.36
SNX15-206ENST00000529673 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SNX15-206ENST00000529673 ASXL2Q76L83 1435 aa23.51■■□□□ 1.35
SNX15-206ENST00000529673 KIF27Q86VH2 1401 aa23.5■■□□□ 1.35
SNX15-206ENST00000529673 IGF1RP08069 1367 aa23.47■■□□□ 1.35
SNX15-206ENST00000529673 CUL7Q14999 1698 aa23.47■■□□□ 1.35
SNX15-206ENST00000529673 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.46■■□□□ 1.35
SNX15-206ENST00000529673 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.45■■□□□ 1.34
SNX15-206ENST00000529673 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.43■■□□□ 1.34
SNX15-206ENST00000529673 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.43■■□□□ 1.34
SNX15-206ENST00000529673 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SNX15-206ENST00000529673 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SNX15-206ENST00000529673 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.38■■□□□ 1.33
SNX15-206ENST00000529673 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SNX15-206ENST00000529673 UACAQ9BZF9 1416 aa23.36■■□□□ 1.33
SNX15-206ENST00000529673 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.33■■□□□ 1.33
SNX15-206ENST00000529673 FBXO41Q8TF61 875 aa23.31■■□□□ 1.32
SNX15-206ENST00000529673 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.31■■□□□ 1.32
SNX15-206ENST00000529673 IQGAP2Q13576 1575 aa23.31■■□□□ 1.32
SNX15-206ENST00000529673 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SNX15-206ENST00000529673 DISP1Q96F81 1524 aa23.23■■□□□ 1.31
SNX15-206ENST00000529673 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.19■■□□□ 1.3
SNX15-206ENST00000529673 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.15■■□□□ 1.3
SNX15-206ENST00000529673 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.13■■□□□ 1.29
SNX15-206ENST00000529673 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.13■■□□□ 1.29
SNX15-206ENST00000529673 CD109Q6YHK3 1445 aa23.11■■□□□ 1.29
SNX15-206ENST00000529673 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.1■■□□□ 1.29
SNX15-206ENST00000529673 KIAA0556O60303 1618 aa23.1■■□□□ 1.29
SNX15-206ENST00000529673 KIF21BO75037 1637 aa23.08■■□□□ 1.29
SNX15-206ENST00000529673 PTPRMP28827 1452 aa23■■□□□ 1.27
SNX15-206ENST00000529673 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.98■■□□□ 1.27
SNX15-206ENST00000529673 KCNH8Q96L42 1107 aa22.97■■□□□ 1.27
SNX15-206ENST00000529673 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.95■■□□□ 1.26
SNX15-206ENST00000529673 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.95■■□□□ 1.26
SNX15-206ENST00000529673 PRXQ9BXM0 1461 aa22.93■■□□□ 1.26
SNX15-206ENST00000529673 ABCA8O94911 1581 aa22.93■■□□□ 1.26
SNX15-206ENST00000529673 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SNX15-206ENST00000529673 GOLGA3Q08378 1498 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX15-206ENST00000529673 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.91■■□□□ 1.26
SNX15-206ENST00000529673 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.89■■□□□ 1.26
SNX15-206ENST00000529673 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.83■■□□□ 1.25
SNX15-206ENST00000529673 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.82■■□□□ 1.24
SNX15-206ENST00000529673 MADDQ8WXG6 1647 aa22.81■■□□□ 1.24
SNX15-206ENST00000529673 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
SNX15-206ENST00000529673 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.79■■□□□ 1.24
SNX15-206ENST00000529673 NEO1Q92859 1461 aa22.78■■□□□ 1.24
SNX15-206ENST00000529673 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SNX15-206ENST00000529673 RAPGEF3O95398 923 aa22.76■■□□□ 1.23
SNX15-206ENST00000529673 P3H3Q8IVL6 736 aa22.75■■□□□ 1.23
SNX15-206ENST00000529673 ATP10BO94823 1461 aa22.72■■□□□ 1.23
SNX15-206ENST00000529673 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.72■■□□□ 1.23
SNX15-206ENST00000529673 CERKQ8TCT0 537 aa22.7■■□□□ 1.22
SNX15-206ENST00000529673 EEA1Q15075 1411 aa22.7■■□□□ 1.22
SNX15-206ENST00000529673 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SNX15-206ENST00000529673 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.69■■□□□ 1.22
SNX15-206ENST00000529673 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SNX15-206ENST00000529673 ARID3CA6NKF2 412 aa22.67■■□□□ 1.22
SNX15-206ENST00000529673 HSPA2P54652 639 aa22.66■■□□□ 1.22
SNX15-206ENST00000529673 SOCS7O14512 581 aa22.65■■□□□ 1.22
SNX15-206ENST00000529673 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.63■■□□□ 1.21
SNX15-206ENST00000529673 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.63■■□□□ 1.21
SNX15-206ENST00000529673 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.62■■□□□ 1.21
SNX15-206ENST00000529673 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.62■■□□□ 1.21
SNX15-206ENST00000529673 SAMD9Q5K651 1589 aa22.62■■□□□ 1.21
SNX15-206ENST00000529673 FANCAO15360 1455 aa22.6■■□□□ 1.21
SNX15-206ENST00000529673 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SNX15-206ENST00000529673 ILDR2Q71H61 639 aa22.58■■□□□ 1.21
SNX15-206ENST00000529673 AKNAQ7Z591 1439 aa22.57■■□□□ 1.2
SNX15-206ENST00000529673 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.57■■□□□ 1.2
SNX15-206ENST00000529673 RICTORQ6R327 1708 aa22.56■■□□□ 1.2
SNX15-206ENST00000529673 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.54■■□□□ 1.2
SNX15-206ENST00000529673 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.53■■□□□ 1.2
SNX15-206ENST00000529673 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SNX15-206ENST00000529673 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SNX15-206ENST00000529673 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.53■■□□□ 1.2
SNX15-206ENST00000529673 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.52■■□□□ 1.2
SNX15-206ENST00000529673 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.52■■□□□ 1.19
SNX15-206ENST00000529673 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.51■■□□□ 1.19
SNX15-206ENST00000529673 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.5■■□□□ 1.19
SNX15-206ENST00000529673 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.48■■□□□ 1.19
SNX15-206ENST00000529673 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.47■■□□□ 1.19
SNX15-206ENST00000529673 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.46■■□□□ 1.19
SNX15-206ENST00000529673 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms