RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529667.1

SOX9-AS1-208, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 340 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TIAM1Q13009 1591 aa10.05□□□□□ -0.8
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa10.04□□□□□ -0.8
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MRC2Q9UBG0 1479 aa10.04□□□□□ -0.8
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CFAP43Q8NDM7 1665 aa10.02□□□□□ -0.8
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa10.02□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-208ENST00000529667 IFT140Q96RY7 1462 aa10.02□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CCNB3Q8WWL7 1395 aa10.01□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NESP48681 1621 aa10.01□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-208ENST00000529667 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SAMD9Q5K651 1589 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GRIN2BQ13224 1484 aa9.98□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CCDC18Q5T9S5 1454 aa9.98□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-208ENST00000529667 WDR62O43379 1518 aa9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PBRM1Q86U86 1689 aa9.96□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SOX9-AS1-208ENST00000529667 IQGAP2Q13576 1575 aa9.92□□□□□ -0.82
SOX9-AS1-208ENST00000529667 UGGT2Q9NYU1 1516 aa9.92□□□□□ -0.82
SOX9-AS1-208ENST00000529667 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ADAMTS12P58397 1594 aa9.91□□□□□ -0.82
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa9.9□□□□□ -0.82
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SETD5Q9C0A6 1442 aa9.9□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-208ENST00000529667 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa9.89□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa9.89□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-208ENST00000529667 HECW1Q76N89 1606 aa9.89□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MTUS2Q5JR59 1369 aa9.88□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MIA2Q96PC5 1412 aa9.87□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FHOD3Q2V2M9 1422 aa9.85□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-208ENST00000529667 AKNAQ7Z591 1439 aa9.85□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ERCC6Q03468 1493 aa9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MYOM3Q5VTT5 1437 aa9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FGD6Q6ZV73 1430 aa9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DNAJC5BQ9UF47 199 aa9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa9.82□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ARHGEF11O15085 1522 aa9.82□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SYNJ2O15056 1496 aa9.82□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GRIN2AQ12879 1464 aa9.81□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PHLDB1Q86UU1 1377 aa9.8□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-208ENST00000529667 HFM1A2PYH4 1435 aa9.8□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NCOA2Q15596 1464 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-208ENST00000529667 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-208ENST00000529667 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-208ENST00000529667 UACAQ9BZF9 1416 aa9.77□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ROCK1Q13464 1354 aa9.76□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KIAA0556O60303 1618 aa9.76□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PTPN23Q9H3S7 1636 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NUP160Q12769 1436 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-208ENST00000529667 P3H3Q8IVL6 736 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ITSN2Q9NZM3 1697 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DISP1Q96F81 1524 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GCC2Q8IWJ2 1684 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RSPH4AQ5TD94 716 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ADCY10Q96PN6 1610 aa9.71□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MAPKBP1O60336 1514 aa9.68□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NAIPQ13075 1403 aa9.68□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-208ENST00000529667 JPH4Q96JJ6 628 aa9.68□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PLEKHD1A6NEE1 506 aa9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ITGAEP38570 1179 aa9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CEP170Q5SW79 1584 aa9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TONSLQ96HA7 1378 aa9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ABCA8O94911 1581 aa9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ADGBQ8N7X0 1667 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ADGRL2O95490 1459 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SHANK2Q9UPX8 1470 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa9.61□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KIF14Q15058 1648 aa9.61□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DAPK1P53355 1430 aa9.61□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa9.6□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SHROOM2Q13796 1616 aa9.6□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa9.59□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PTPRGP23470 1445 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms