RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529566.1

TSPAN4-218, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 706 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-218ENST00000529566 JPH4Q96JJ6 628 aa27.2■■□□□ 1.94
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TSPAN4-218ENST00000529566 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.19■■□□□ 1.94
TSPAN4-218ENST00000529566 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
TSPAN4-218ENST00000529566 PRXQ9BXM0 1461 aa27.13■■□□□ 1.93
TSPAN4-218ENST00000529566 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.09■■□□□ 1.93
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TSPAN4-218ENST00000529566 KIAA0556O60303 1618 aa26.74■■□□□ 1.87
TSPAN4-218ENST00000529566 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.7■■□□□ 1.86
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TSPAN4-218ENST00000529566 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.61■■□□□ 1.85
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TSPAN4-218ENST00000529566 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.59■■□□□ 1.85
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TSPAN4-218ENST00000529566 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.43■■□□□ 1.82
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TSPAN4-218ENST00000529566 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.43■■□□□ 1.82
TSPAN4-218ENST00000529566 ASXL2Q76L83 1435 aa26.39■■□□□ 1.82
TSPAN4-218ENST00000529566 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.39■■□□□ 1.82
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TSPAN4-218ENST00000529566 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.35■■□□□ 1.81
TSPAN4-218ENST00000529566 ATP10BO94823 1461 aa26.3■■□□□ 1.8
TSPAN4-218ENST00000529566 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.29■■□□□ 1.8
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TSPAN4-218ENST00000529566 ARID3CA6NKF2 412 aa26.25■■□□□ 1.79
TSPAN4-218ENST00000529566 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
TSPAN4-218ENST00000529566 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.24■■□□□ 1.79
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TSPAN4-218ENST00000529566 FMN1Q68DA7 1419 aa26.2■■□□□ 1.78
TSPAN4-218ENST00000529566 CLIP1P30622 1438 aa26.16■■□□□ 1.78
TSPAN4-218ENST00000529566 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.15■■□□□ 1.78
TSPAN4-218ENST00000529566 KCNH8Q96L42 1107 aa26.13■■□□□ 1.77
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TSPAN4-218ENST00000529566 TSPOAP1O95153 1857 aa26.09■■□□□ 1.77
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TSPAN4-218ENST00000529566 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
TSPAN4-218ENST00000529566 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.02■■□□□ 1.76
TSPAN4-218ENST00000529566 CD109Q6YHK3 1445 aa26.01■■□□□ 1.75
TSPAN4-218ENST00000529566 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.99■■□□□ 1.75
TSPAN4-218ENST00000529566 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-218ENST00000529566 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-218ENST00000529566 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN4-218ENST00000529566 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN4-218ENST00000529566 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN4-218ENST00000529566 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPAN4-218ENST00000529566 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
TSPAN4-218ENST00000529566 KDM6BO15054 1643 aa25.89■■□□□ 1.74
TSPAN4-218ENST00000529566 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
TSPAN4-218ENST00000529566 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.87■■□□□ 1.73
TSPAN4-218ENST00000529566 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.86■■□□□ 1.73
TSPAN4-218ENST00000529566 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
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TSPAN4-218ENST00000529566 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.77■■□□□ 1.72
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TSPAN4-218ENST00000529566 NEO1Q92859 1461 aa25.76■■□□□ 1.71
TSPAN4-218ENST00000529566 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.76■■□□□ 1.71
TSPAN4-218ENST00000529566 PLCH2O75038 1416 aa25.73■■□□□ 1.71
TSPAN4-218ENST00000529566 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.72■■□□□ 1.71
TSPAN4-218ENST00000529566 FANCAO15360 1455 aa25.69■■□□□ 1.7
TSPAN4-218ENST00000529566 AKNAQ7Z591 1439 aa25.67■■□□□ 1.7
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TSPAN4-218ENST00000529566 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.62■■□□□ 1.69
TSPAN4-218ENST00000529566 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.62■■□□□ 1.69
TSPAN4-218ENST00000529566 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.61■■□□□ 1.69
TSPAN4-218ENST00000529566 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.61■■□□□ 1.69
TSPAN4-218ENST00000529566 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.58■■□□□ 1.69
TSPAN4-218ENST00000529566 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
TSPAN4-218ENST00000529566 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.56■■□□□ 1.68
TSPAN4-218ENST00000529566 TIAM1Q13009 1591 aa25.56■■□□□ 1.68
TSPAN4-218ENST00000529566 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.55■■□□□ 1.68
TSPAN4-218ENST00000529566 ADGRL1O94910 1474 aa25.54■■□□□ 1.68
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