RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525711.1

UBASH3B-202, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 572 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-202ENST00000525711 JPH4Q96JJ6 628 aa25.42■■□□□ 1.66
UBASH3B-202ENST00000525711 MAPKBP1O60336 1514 aa25.37■■□□□ 1.65
UBASH3B-202ENST00000525711 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.37■■□□□ 1.65
UBASH3B-202ENST00000525711 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.37■■□□□ 1.65
UBASH3B-202ENST00000525711 DIP2BQ9P265 1576 aa25.35■■□□□ 1.65
UBASH3B-202ENST00000525711 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.33■■□□□ 1.65
UBASH3B-202ENST00000525711 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.33■■□□□ 1.65
UBASH3B-202ENST00000525711 TSPOAP1O95153 1857 aa25.28■■□□□ 1.64
UBASH3B-202ENST00000525711 KDM6BO15054 1643 aa25.27■■□□□ 1.64
UBASH3B-202ENST00000525711 CUL7Q14999 1698 aa25.26■■□□□ 1.63
UBASH3B-202ENST00000525711 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.22■■□□□ 1.63
UBASH3B-202ENST00000525711 KIF27Q86VH2 1401 aa25.13■■□□□ 1.61
UBASH3B-202ENST00000525711 IGF1RP08069 1367 aa25.09■■□□□ 1.61
UBASH3B-202ENST00000525711 PTPRGP23470 1445 aa25.04■■□□□ 1.6
UBASH3B-202ENST00000525711 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.03■■□□□ 1.6
UBASH3B-202ENST00000525711 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.02■■□□□ 1.6
UBASH3B-202ENST00000525711 ABCC2Q92887 1545 aa25.01■■□□□ 1.59
UBASH3B-202ENST00000525711 IQGAP2Q13576 1575 aa24.99■■□□□ 1.59
UBASH3B-202ENST00000525711 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
UBASH3B-202ENST00000525711 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.98■■□□□ 1.59
UBASH3B-202ENST00000525711 GLI2P10070 1586 aa24.97■■□□□ 1.59
UBASH3B-202ENST00000525711 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
UBASH3B-202ENST00000525711 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.96■■□□□ 1.59
UBASH3B-202ENST00000525711 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.96■■□□□ 1.59
UBASH3B-202ENST00000525711 ASXL2Q76L83 1435 aa24.94■■□□□ 1.58
UBASH3B-202ENST00000525711 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.9■■□□□ 1.58
UBASH3B-202ENST00000525711 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.86■■□□□ 1.57
UBASH3B-202ENST00000525711 UACAQ9BZF9 1416 aa24.86■■□□□ 1.57
UBASH3B-202ENST00000525711 ADGRL1O94910 1474 aa24.83■■□□□ 1.56
UBASH3B-202ENST00000525711 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
UBASH3B-202ENST00000525711 DISP1Q96F81 1524 aa24.81■■□□□ 1.56
UBASH3B-202ENST00000525711 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.81■■□□□ 1.56
UBASH3B-202ENST00000525711 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
UBASH3B-202ENST00000525711 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.8■■□□□ 1.56
UBASH3B-202ENST00000525711 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.77■■□□□ 1.56
UBASH3B-202ENST00000525711 KIAA0556O60303 1618 aa24.76■■□□□ 1.55
UBASH3B-202ENST00000525711 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.73■■□□□ 1.55
UBASH3B-202ENST00000525711 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.72■■□□□ 1.55
UBASH3B-202ENST00000525711 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
UBASH3B-202ENST00000525711 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
UBASH3B-202ENST00000525711 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.66■■□□□ 1.54
UBASH3B-202ENST00000525711 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.66■■□□□ 1.54
UBASH3B-202ENST00000525711 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.65■■□□□ 1.54
UBASH3B-202ENST00000525711 GOLGA3Q08378 1498 aa24.57■■□□□ 1.52
UBASH3B-202ENST00000525711 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.55■■□□□ 1.52
UBASH3B-202ENST00000525711 CD109Q6YHK3 1445 aa24.53■■□□□ 1.52
UBASH3B-202ENST00000525711 ABCA8O94911 1581 aa24.53■■□□□ 1.52
UBASH3B-202ENST00000525711 KIF21BO75037 1637 aa24.48■■□□□ 1.51
UBASH3B-202ENST00000525711 KCNH8Q96L42 1107 aa24.45■■□□□ 1.5
UBASH3B-202ENST00000525711 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
UBASH3B-202ENST00000525711 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.37■■□□□ 1.49
UBASH3B-202ENST00000525711 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.34■■□□□ 1.49
UBASH3B-202ENST00000525711 PRXQ9BXM0 1461 aa24.32■■□□□ 1.48
UBASH3B-202ENST00000525711 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.29■■□□□ 1.48
UBASH3B-202ENST00000525711 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.28■■□□□ 1.48
UBASH3B-202ENST00000525711 ATP10BO94823 1461 aa24.26■■□□□ 1.47
UBASH3B-202ENST00000525711 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.24■■□□□ 1.47
UBASH3B-202ENST00000525711 ARID3CA6NKF2 412 aa24.23■■□□□ 1.47
UBASH3B-202ENST00000525711 SAMD9Q5K651 1589 aa24.22■■□□□ 1.47
UBASH3B-202ENST00000525711 PTPRMP28827 1452 aa24.22■■□□□ 1.47
UBASH3B-202ENST00000525711 NEO1Q92859 1461 aa24.22■■□□□ 1.47
UBASH3B-202ENST00000525711 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.21■■□□□ 1.47
UBASH3B-202ENST00000525711 P3H3Q8IVL6 736 aa24.19■■□□□ 1.46
UBASH3B-202ENST00000525711 FBXO41Q8TF61 875 aa24.17■■□□□ 1.46
UBASH3B-202ENST00000525711 MADDQ8WXG6 1647 aa24.17■■□□□ 1.46
UBASH3B-202ENST00000525711 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.16■■□□□ 1.46
UBASH3B-202ENST00000525711 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
UBASH3B-202ENST00000525711 RAPGEF3O95398 923 aa24.13■■□□□ 1.45
UBASH3B-202ENST00000525711 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
UBASH3B-202ENST00000525711 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
UBASH3B-202ENST00000525711 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.12■■□□□ 1.45
UBASH3B-202ENST00000525711 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
UBASH3B-202ENST00000525711 RICTORQ6R327 1708 aa24.1■■□□□ 1.45
UBASH3B-202ENST00000525711 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.1■■□□□ 1.45
UBASH3B-202ENST00000525711 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
UBASH3B-202ENST00000525711 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
UBASH3B-202ENST00000525711 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.03■■□□□ 1.44
UBASH3B-202ENST00000525711 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
UBASH3B-202ENST00000525711 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.01■■□□□ 1.43
UBASH3B-202ENST00000525711 FANCAO15360 1455 aa23.98■■□□□ 1.43
UBASH3B-202ENST00000525711 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.97■■□□□ 1.43
UBASH3B-202ENST00000525711 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.97■■□□□ 1.43
UBASH3B-202ENST00000525711 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.97■■□□□ 1.43
UBASH3B-202ENST00000525711 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.97■■□□□ 1.43
UBASH3B-202ENST00000525711 AKNAQ7Z591 1439 aa23.97■■□□□ 1.43
UBASH3B-202ENST00000525711 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.96■■□□□ 1.43
UBASH3B-202ENST00000525711 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.95■■□□□ 1.43
UBASH3B-202ENST00000525711 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.95■■□□□ 1.42
UBASH3B-202ENST00000525711 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.94■■□□□ 1.42
UBASH3B-202ENST00000525711 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.94■■□□□ 1.42
UBASH3B-202ENST00000525711 EEA1Q15075 1411 aa23.93■■□□□ 1.42
UBASH3B-202ENST00000525711 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
UBASH3B-202ENST00000525711 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.9■■□□□ 1.42
UBASH3B-202ENST00000525711 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.89■■□□□ 1.42
UBASH3B-202ENST00000525711 HECW1Q76N89 1606 aa23.86■■□□□ 1.41
UBASH3B-202ENST00000525711 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.85■■□□□ 1.41
UBASH3B-202ENST00000525711 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.84■■□□□ 1.41
UBASH3B-202ENST00000525711 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.84■■□□□ 1.41
UBASH3B-202ENST00000525711 HSPA2P54652 639 aa23.82■■□□□ 1.4
UBASH3B-202ENST00000525711 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.81■■□□□ 1.4
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