RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525257.1

USP47-205, Transcript of ubiquitin specific peptidase 47, humanhuman

TSL 4

Gene USP47, Length 548 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47-205ENST00000525257 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.25■■■■■ 4.35
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USP47-205ENST00000525257 CUL7Q14999 1698 aa42.12■■■■■ 4.33
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USP47-205ENST00000525257 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.04■■■■■ 4.32
USP47-205ENST00000525257 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.03■■■■■ 4.32
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USP47-205ENST00000525257 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa39.71■■■■□ 3.95
USP47-205ENST00000525257 LMTK3Q96Q04 1460 aa39.68■■■■□ 3.94
USP47-205ENST00000525257 POGZQ7Z3K3 1410 aa39.67■■■■□ 3.94
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