RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525151.5

TRAF3IP2-AS1-208, TRAF3IP2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAF3IP2-AS1, Length 609 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 KDM6BO15054 1643 aa31.42■■■□□ 2.62
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TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.33■■■□□ 2.61
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TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.28■■■□□ 2.44
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TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 P3H3Q8IVL6 736 aa29.53■■■□□ 2.32
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PRXQ9BXM0 1461 aa29.52■■■□□ 2.32
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.52■■■□□ 2.32
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.51■■■□□ 2.31
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TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SAMD9Q5K651 1589 aa29.48■■■□□ 2.31
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.48■■■□□ 2.31
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 FANCAO15360 1455 aa29.48■■■□□ 2.31
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.47■■■□□ 2.31
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 AKNAQ7Z591 1439 aa29.45■■■□□ 2.31
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.44■■■□□ 2.3
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TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 HECW1Q76N89 1606 aa29.38■■■□□ 2.29
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.38■■■□□ 2.29
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.36■■■□□ 2.29
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 MLECQ14165 292 aa29.36■■■□□ 2.29
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
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