RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525127.1

BRMS1-204, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

TSL 2

Gene BRMS1, Length 750 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-204ENST00000525127 CUL7Q14999 1698 aa24.89■■□□□ 1.58
BRMS1-204ENST00000525127 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
BRMS1-204ENST00000525127 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.83■■□□□ 1.57
BRMS1-204ENST00000525127 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.82■■□□□ 1.56
BRMS1-204ENST00000525127 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.81■■□□□ 1.56
BRMS1-204ENST00000525127 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.65■■□□□ 1.54
BRMS1-204ENST00000525127 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.63■■□□□ 1.53
BRMS1-204ENST00000525127 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.61■■□□□ 1.53
BRMS1-204ENST00000525127 EEA1Q15075 1411 aa24.58■■□□□ 1.53
BRMS1-204ENST00000525127 IQGAP2Q13576 1575 aa24.58■■□□□ 1.52
BRMS1-204ENST00000525127 PTPRGP23470 1445 aa24.55■■□□□ 1.52
BRMS1-204ENST00000525127 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.53■■□□□ 1.52
BRMS1-204ENST00000525127 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
BRMS1-204ENST00000525127 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.48■■□□□ 1.51
BRMS1-204ENST00000525127 MAPKBP1O60336 1514 aa24.45■■□□□ 1.51
BRMS1-204ENST00000525127 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.43■■□□□ 1.5
BRMS1-204ENST00000525127 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.43■■□□□ 1.5
BRMS1-204ENST00000525127 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.42■■□□□ 1.5
BRMS1-204ENST00000525127 DISP1Q96F81 1524 aa24.41■■□□□ 1.5
BRMS1-204ENST00000525127 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.41■■□□□ 1.5
BRMS1-204ENST00000525127 PRXQ9BXM0 1461 aa24.39■■□□□ 1.5
BRMS1-204ENST00000525127 UACAQ9BZF9 1416 aa24.35■■□□□ 1.49
BRMS1-204ENST00000525127 ABCC2Q92887 1545 aa24.35■■□□□ 1.49
BRMS1-204ENST00000525127 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.35■■□□□ 1.49
BRMS1-204ENST00000525127 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.33■■□□□ 1.49
BRMS1-204ENST00000525127 GOLGA3Q08378 1498 aa24.32■■□□□ 1.48
BRMS1-204ENST00000525127 KIAA0556O60303 1618 aa24.32■■□□□ 1.48
BRMS1-204ENST00000525127 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.32■■□□□ 1.48
BRMS1-204ENST00000525127 DIP2BQ9P265 1576 aa24.3■■□□□ 1.48
BRMS1-204ENST00000525127 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
BRMS1-204ENST00000525127 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.26■■□□□ 1.47
BRMS1-204ENST00000525127 KIF21BO75037 1637 aa24.25■■□□□ 1.47
BRMS1-204ENST00000525127 ASXL2Q76L83 1435 aa24.24■■□□□ 1.47
BRMS1-204ENST00000525127 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.2■■□□□ 1.47
BRMS1-204ENST00000525127 GLI2P10070 1586 aa24.12■■□□□ 1.45
BRMS1-204ENST00000525127 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
BRMS1-204ENST00000525127 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
BRMS1-204ENST00000525127 P3H3Q8IVL6 736 aa24.1■■□□□ 1.45
BRMS1-204ENST00000525127 TSPOAP1O95153 1857 aa24.09■■□□□ 1.45
BRMS1-204ENST00000525127 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
BRMS1-204ENST00000525127 ABCA8O94911 1581 aa24.08■■□□□ 1.44
BRMS1-204ENST00000525127 KDM6BO15054 1643 aa24.06■■□□□ 1.44
BRMS1-204ENST00000525127 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.05■■□□□ 1.44
BRMS1-204ENST00000525127 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
BRMS1-204ENST00000525127 SAMD9Q5K651 1589 aa24■■□□□ 1.43
BRMS1-204ENST00000525127 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.99■■□□□ 1.43
BRMS1-204ENST00000525127 KCNH8Q96L42 1107 aa23.98■■□□□ 1.43
BRMS1-204ENST00000525127 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
BRMS1-204ENST00000525127 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.95■■□□□ 1.43
BRMS1-204ENST00000525127 ARID3CA6NKF2 412 aa23.94■■□□□ 1.42
BRMS1-204ENST00000525127 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
BRMS1-204ENST00000525127 ATP10BO94823 1461 aa23.91■■□□□ 1.42
BRMS1-204ENST00000525127 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
BRMS1-204ENST00000525127 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
BRMS1-204ENST00000525127 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.9■■□□□ 1.42
BRMS1-204ENST00000525127 CD109Q6YHK3 1445 aa23.9■■□□□ 1.42
BRMS1-204ENST00000525127 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.89■■□□□ 1.41
BRMS1-204ENST00000525127 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.88■■□□□ 1.41
BRMS1-204ENST00000525127 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.88■■□□□ 1.41
BRMS1-204ENST00000525127 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.85■■□□□ 1.41
BRMS1-204ENST00000525127 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.84■■□□□ 1.41
BRMS1-204ENST00000525127 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.82■■□□□ 1.4
BRMS1-204ENST00000525127 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
BRMS1-204ENST00000525127 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
BRMS1-204ENST00000525127 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.76■■□□□ 1.39
BRMS1-204ENST00000525127 FMN1Q68DA7 1419 aa23.72■■□□□ 1.39
BRMS1-204ENST00000525127 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.71■■□□□ 1.39
BRMS1-204ENST00000525127 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.71■■□□□ 1.39
BRMS1-204ENST00000525127 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.71■■□□□ 1.39
BRMS1-204ENST00000525127 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.7■■□□□ 1.38
BRMS1-204ENST00000525127 CLIP1P30622 1438 aa23.68■■□□□ 1.38
BRMS1-204ENST00000525127 CEP162Q5TB80 1403 aa23.67■■□□□ 1.38
BRMS1-204ENST00000525127 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
BRMS1-204ENST00000525127 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.64■■□□□ 1.38
BRMS1-204ENST00000525127 NEO1Q92859 1461 aa23.62■■□□□ 1.37
BRMS1-204ENST00000525127 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
BRMS1-204ENST00000525127 HECW1Q76N89 1606 aa23.59■■□□□ 1.37
BRMS1-204ENST00000525127 ADGRL1O94910 1474 aa23.58■■□□□ 1.37
BRMS1-204ENST00000525127 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
BRMS1-204ENST00000525127 RAPGEF3O95398 923 aa23.53■■□□□ 1.36
BRMS1-204ENST00000525127 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.36
BRMS1-204ENST00000525127 FANCAO15360 1455 aa23.5■■□□□ 1.35
BRMS1-204ENST00000525127 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.49■■□□□ 1.35
BRMS1-204ENST00000525127 AKNAQ7Z591 1439 aa23.49■■□□□ 1.35
BRMS1-204ENST00000525127 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
BRMS1-204ENST00000525127 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.47■■□□□ 1.35
BRMS1-204ENST00000525127 PLCH2O75038 1416 aa23.44■■□□□ 1.34
BRMS1-204ENST00000525127 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.44■■□□□ 1.34
BRMS1-204ENST00000525127 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
BRMS1-204ENST00000525127 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.42■■□□□ 1.34
BRMS1-204ENST00000525127 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.41■■□□□ 1.34
BRMS1-204ENST00000525127 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.4■■□□□ 1.34
BRMS1-204ENST00000525127 KIF14Q15058 1648 aa23.4■■□□□ 1.34
BRMS1-204ENST00000525127 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.39■■□□□ 1.33
BRMS1-204ENST00000525127 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.39■■□□□ 1.33
BRMS1-204ENST00000525127 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
BRMS1-204ENST00000525127 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
BRMS1-204ENST00000525127 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.34■■□□□ 1.33
BRMS1-204ENST00000525127 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.33■■□□□ 1.33
BRMS1-204ENST00000525127 RICTORQ6R327 1708 aa23.33■■□□□ 1.32
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