RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524509.1

PACSIN3-202, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-202ENST00000524509 JPH4Q96JJ6 628 aa29.49■■■□□ 2.31
PACSIN3-202ENST00000524509 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.47■■■□□ 2.31
PACSIN3-202ENST00000524509 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.42■■■□□ 2.3
PACSIN3-202ENST00000524509 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.39■■■□□ 2.3
PACSIN3-202ENST00000524509 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.38■■■□□ 2.29
PACSIN3-202ENST00000524509 MAPKBP1O60336 1514 aa29.38■■■□□ 2.29
PACSIN3-202ENST00000524509 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.36■■■□□ 2.29
PACSIN3-202ENST00000524509 IGF1RP08069 1367 aa29.32■■■□□ 2.28
PACSIN3-202ENST00000524509 DIP2BQ9P265 1576 aa29.31■■■□□ 2.28
PACSIN3-202ENST00000524509 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.29■■■□□ 2.28
PACSIN3-202ENST00000524509 EEA1Q15075 1411 aa29.27■■■□□ 2.28
PACSIN3-202ENST00000524509 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.2■■■□□ 2.26
PACSIN3-202ENST00000524509 KDM6BO15054 1643 aa29.2■■■□□ 2.26
PACSIN3-202ENST00000524509 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.2■■■□□ 2.26
PACSIN3-202ENST00000524509 CUL7Q14999 1698 aa29.19■■■□□ 2.26
PACSIN3-202ENST00000524509 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.14■■■□□ 2.26
PACSIN3-202ENST00000524509 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.12■■■□□ 2.25
PACSIN3-202ENST00000524509 TSPOAP1O95153 1857 aa29.1■■■□□ 2.25
PACSIN3-202ENST00000524509 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.04■■■□□ 2.24
PACSIN3-202ENST00000524509 PTPRGP23470 1445 aa29.02■■■□□ 2.24
PACSIN3-202ENST00000524509 PRXQ9BXM0 1461 aa28.97■■■□□ 2.23
PACSIN3-202ENST00000524509 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
PACSIN3-202ENST00000524509 ABCC2Q92887 1545 aa28.94■■■□□ 2.22
PACSIN3-202ENST00000524509 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.92■■■□□ 2.22
PACSIN3-202ENST00000524509 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.92■■■□□ 2.22
PACSIN3-202ENST00000524509 GLI2P10070 1586 aa28.9■■■□□ 2.22
PACSIN3-202ENST00000524509 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.9■■■□□ 2.22
PACSIN3-202ENST00000524509 ASXL2Q76L83 1435 aa28.89■■■□□ 2.22
PACSIN3-202ENST00000524509 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
PACSIN3-202ENST00000524509 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
PACSIN3-202ENST00000524509 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.85■■■□□ 2.21
PACSIN3-202ENST00000524509 IQGAP2Q13576 1575 aa28.83■■■□□ 2.21
PACSIN3-202ENST00000524509 UACAQ9BZF9 1416 aa28.78■■■□□ 2.2
PACSIN3-202ENST00000524509 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
PACSIN3-202ENST00000524509 ADGRL1O94910 1474 aa28.78■■■□□ 2.2
PACSIN3-202ENST00000524509 KIF21BO75037 1637 aa28.75■■■□□ 2.19
PACSIN3-202ENST00000524509 DISP1Q96F81 1524 aa28.74■■■□□ 2.19
PACSIN3-202ENST00000524509 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
PACSIN3-202ENST00000524509 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.72■■■□□ 2.19
PACSIN3-202ENST00000524509 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.72■■■□□ 2.19
PACSIN3-202ENST00000524509 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
PACSIN3-202ENST00000524509 GOLGA3Q08378 1498 aa28.68■■■□□ 2.18
PACSIN3-202ENST00000524509 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.68■■■□□ 2.18
PACSIN3-202ENST00000524509 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
PACSIN3-202ENST00000524509 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.64■■■□□ 2.17
PACSIN3-202ENST00000524509 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
PACSIN3-202ENST00000524509 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.58■■■□□ 2.16
PACSIN3-202ENST00000524509 KIAA0556O60303 1618 aa28.57■■■□□ 2.16
PACSIN3-202ENST00000524509 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.55■■■□□ 2.16
PACSIN3-202ENST00000524509 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.53■■■□□ 2.16
PACSIN3-202ENST00000524509 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.47■■■□□ 2.15
PACSIN3-202ENST00000524509 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.43■■■□□ 2.14
PACSIN3-202ENST00000524509 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.42■■■□□ 2.14
PACSIN3-202ENST00000524509 CD109Q6YHK3 1445 aa28.41■■■□□ 2.14
PACSIN3-202ENST00000524509 ABCA8O94911 1581 aa28.35■■■□□ 2.13
PACSIN3-202ENST00000524509 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.33■■■□□ 2.13
PACSIN3-202ENST00000524509 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
PACSIN3-202ENST00000524509 KCNH8Q96L42 1107 aa28.32■■■□□ 2.12
PACSIN3-202ENST00000524509 SAMD9Q5K651 1589 aa28.28■■■□□ 2.12
PACSIN3-202ENST00000524509 P3H3Q8IVL6 736 aa28.26■■■□□ 2.11
PACSIN3-202ENST00000524509 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.23■■■□□ 2.11
PACSIN3-202ENST00000524509 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.2■■■□□ 2.1
PACSIN3-202ENST00000524509 CLIP1P30622 1438 aa28.17■■■□□ 2.1
PACSIN3-202ENST00000524509 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.15■■■□□ 2.1
PACSIN3-202ENST00000524509 FMN1Q68DA7 1419 aa28.15■■■□□ 2.1
PACSIN3-202ENST00000524509 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.15■■■□□ 2.1
PACSIN3-202ENST00000524509 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.14■■■□□ 2.1
PACSIN3-202ENST00000524509 ATP10BO94823 1461 aa28.11■■■□□ 2.09
PACSIN3-202ENST00000524509 FBXO41Q8TF61 875 aa28.11■■■□□ 2.09
PACSIN3-202ENST00000524509 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.1■■■□□ 2.09
PACSIN3-202ENST00000524509 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.09■■■□□ 2.09
PACSIN3-202ENST00000524509 CEP162Q5TB80 1403 aa28.08■■■□□ 2.09
PACSIN3-202ENST00000524509 PTPRMP28827 1452 aa28.08■■■□□ 2.09
PACSIN3-202ENST00000524509 ARID3CA6NKF2 412 aa28.03■■■□□ 2.08
PACSIN3-202ENST00000524509 NEO1Q92859 1461 aa28.02■■■□□ 2.08
PACSIN3-202ENST00000524509 RAPGEF3O95398 923 aa28■■■□□ 2.07
PACSIN3-202ENST00000524509 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.97■■■□□ 2.07
PACSIN3-202ENST00000524509 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.96■■■□□ 2.07
PACSIN3-202ENST00000524509 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.94■■■□□ 2.06
PACSIN3-202ENST00000524509 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
PACSIN3-202ENST00000524509 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
PACSIN3-202ENST00000524509 MADDQ8WXG6 1647 aa27.91■■■□□ 2.06
PACSIN3-202ENST00000524509 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
PACSIN3-202ENST00000524509 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
PACSIN3-202ENST00000524509 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.89■■■□□ 2.06
PACSIN3-202ENST00000524509 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
PACSIN3-202ENST00000524509 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
PACSIN3-202ENST00000524509 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.88■■■□□ 2.05
PACSIN3-202ENST00000524509 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
PACSIN3-202ENST00000524509 HECW1Q76N89 1606 aa27.85■■■□□ 2.05
PACSIN3-202ENST00000524509 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.83■■■□□ 2.05
PACSIN3-202ENST00000524509 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.83■■■□□ 2.05
PACSIN3-202ENST00000524509 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.83■■■□□ 2.04
PACSIN3-202ENST00000524509 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
PACSIN3-202ENST00000524509 RICTORQ6R327 1708 aa27.79■■■□□ 2.04
PACSIN3-202ENST00000524509 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
PACSIN3-202ENST00000524509 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.78■■■□□ 2.04
PACSIN3-202ENST00000524509 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.76■■■□□ 2.04
PACSIN3-202ENST00000524509 AKNAQ7Z591 1439 aa27.75■■■□□ 2.03
PACSIN3-202ENST00000524509 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.73■■■□□ 2.03
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