RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 NUP160Q12769 1436 aa36.85■■■■□ 3.49
TSNARE1-208ENST00000524325 OSCARQ8IYS5 282 aa36.82■■■■□ 3.49
TSNARE1-208ENST00000524325 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.77■■■■□ 3.48
TSNARE1-208ENST00000524325 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.72■■■■□ 3.47
TSNARE1-208ENST00000524325 JPH4Q96JJ6 628 aa36.64■■■■□ 3.46
TSNARE1-208ENST00000524325 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.62■■■■□ 3.45
TSNARE1-208ENST00000524325 IQGAP2Q13576 1575 aa36.62■■■■□ 3.45
TSNARE1-208ENST00000524325 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.6■■■■□ 3.45
TSNARE1-208ENST00000524325 P3H3Q8IVL6 736 aa36.58■■■■□ 3.45
TSNARE1-208ENST00000524325 CEP162Q5TB80 1403 aa36.56■■■■□ 3.44
TSNARE1-208ENST00000524325 CLIP1P30622 1438 aa36.49■■■■□ 3.43
TSNARE1-208ENST00000524325 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
TSNARE1-208ENST00000524325 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.44■■■■□ 3.42
TSNARE1-208ENST00000524325 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.43■■■■□ 3.42
TSNARE1-208ENST00000524325 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.41■■■■□ 3.42
TSNARE1-208ENST00000524325 DISP1Q96F81 1524 aa36.39■■■■□ 3.42
TSNARE1-208ENST00000524325 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.38■■■■□ 3.41
TSNARE1-208ENST00000524325 SHROOM2Q13796 1616 aa36.36■■■■□ 3.41
TSNARE1-208ENST00000524325 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.35■■■■□ 3.41
TSNARE1-208ENST00000524325 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.29■■■■□ 3.4
TSNARE1-208ENST00000524325 ARAP1Q96P48 1450 aa36.29■■■■□ 3.4
TSNARE1-208ENST00000524325 SAMD9Q5K651 1589 aa36.28■■■■□ 3.4
TSNARE1-208ENST00000524325 KIAA0556O60303 1618 aa36.27■■■■□ 3.4
TSNARE1-208ENST00000524325 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.25■■■■□ 3.39
TSNARE1-208ENST00000524325 ARHGEF11O15085 1522 aa36.16■■■■□ 3.38
TSNARE1-208ENST00000524325 PTPRGP23470 1445 aa36.12■■■■□ 3.37
TSNARE1-208ENST00000524325 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
TSNARE1-208ENST00000524325 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.02■■■■□ 3.36
TSNARE1-208ENST00000524325 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.02■■■■□ 3.36
TSNARE1-208ENST00000524325 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.02■■■■□ 3.36
TSNARE1-208ENST00000524325 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.02■■■■□ 3.36
TSNARE1-208ENST00000524325 PLB1Q6P1J6 1458 aa36■■■■□ 3.35
TSNARE1-208ENST00000524325 ARID3CA6NKF2 412 aa36■■■■□ 3.35
TSNARE1-208ENST00000524325 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.99■■■■□ 3.35
TSNARE1-208ENST00000524325 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.99■■■■□ 3.35
TSNARE1-208ENST00000524325 FMN1Q68DA7 1419 aa35.99■■■■□ 3.35
TSNARE1-208ENST00000524325 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.87■■■■□ 3.33
TSNARE1-208ENST00000524325 UACAQ9BZF9 1416 aa35.86■■■■□ 3.33
TSNARE1-208ENST00000524325 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.84■■■■□ 3.33
TSNARE1-208ENST00000524325 ABCA8O94911 1581 aa35.81■■■■□ 3.32
TSNARE1-208ENST00000524325 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.78■■■■□ 3.32
TSNARE1-208ENST00000524325 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
TSNARE1-208ENST00000524325 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.75■■■■□ 3.31
TSNARE1-208ENST00000524325 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
TSNARE1-208ENST00000524325 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
TSNARE1-208ENST00000524325 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
TSNARE1-208ENST00000524325 ABCC2Q92887 1545 aa35.71■■■■□ 3.31
TSNARE1-208ENST00000524325 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.69■■■■□ 3.3
TSNARE1-208ENST00000524325 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
TSNARE1-208ENST00000524325 HECW1Q76N89 1606 aa35.66■■■■□ 3.3
TSNARE1-208ENST00000524325 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.66■■■■□ 3.3
TSNARE1-208ENST00000524325 APLP2Q06481 763 aa35.65■■■■□ 3.3
TSNARE1-208ENST00000524325 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.65■■■■□ 3.3
TSNARE1-208ENST00000524325 ATP10BO94823 1461 aa35.64■■■■□ 3.3
TSNARE1-208ENST00000524325 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.6■■■■□ 3.29
TSNARE1-208ENST00000524325 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.59■■■■□ 3.29
TSNARE1-208ENST00000524325 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.55■■■■□ 3.28
TSNARE1-208ENST00000524325 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.54■■■■□ 3.28
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.51■■■■□ 3.28
TSNARE1-208ENST00000524325 TIAM1Q13009 1591 aa35.48■■■■□ 3.27
TSNARE1-208ENST00000524325 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
TSNARE1-208ENST00000524325 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.44■■■■□ 3.26
TSNARE1-208ENST00000524325 PLEKHD1A6NEE1 506 aa35.44■■■■□ 3.26
TSNARE1-208ENST00000524325 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP35.42■■■■□ 3.26
TSNARE1-208ENST00000524325 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.41■■■■□ 3.26
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNH8Q96L42 1107 aa35.4■■■■□ 3.26
TSNARE1-208ENST00000524325 MAP3K1Q13233 1512 aa35.39■■■■□ 3.26
TSNARE1-208ENST00000524325 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.39■■■■□ 3.26
TSNARE1-208ENST00000524325 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.38■■■■□ 3.25
TSNARE1-208ENST00000524325 ASXL2Q76L83 1435 aa35.36■■■■□ 3.25
TSNARE1-208ENST00000524325 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
TSNARE1-208ENST00000524325 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.26■■■■□ 3.24
TSNARE1-208ENST00000524325 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.22■■■■□ 3.23
TSNARE1-208ENST00000524325 MAPKBP1O60336 1514 aa35.19■■■■□ 3.22
TSNARE1-208ENST00000524325 KIF14Q15058 1648 aa35.18■■■■□ 3.22
TSNARE1-208ENST00000524325 NCOA2Q15596 1464 aa35.15■■■■□ 3.22
TSNARE1-208ENST00000524325 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.11■■■■□ 3.21
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM69CQ0P6D2 419 aa35.09■■■■□ 3.21
TSNARE1-208ENST00000524325 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.06■■■■□ 3.2
TSNARE1-208ENST00000524325 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.05■■■■□ 3.2
TSNARE1-208ENST00000524325 ABCC10Q5T3U5 1492 aa35.04■■■■□ 3.2
TSNARE1-208ENST00000524325 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.03■■■■□ 3.2
TSNARE1-208ENST00000524325 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.02■■■■□ 3.2
TSNARE1-208ENST00000524325 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
TSNARE1-208ENST00000524325 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
TSNARE1-208ENST00000524325 DIP2BQ9P265 1576 aa34.94■■■■□ 3.18
TSNARE1-208ENST00000524325 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP34.92■■■■□ 3.18
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP34.92■■■■□ 3.18
TSNARE1-208ENST00000524325 MYOM3Q5VTT5 1437 aa34.92■■■■□ 3.18
TSNARE1-208ENST00000524325 CD109Q6YHK3 1445 aa34.91■■■■□ 3.18
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP34.89■■■■□ 3.18
TSNARE1-208ENST00000524325 ABCA9Q8IUA7 1624 aa34.88■■■■□ 3.17
TSNARE1-208ENST00000524325 PLCH2O75038 1416 aa34.85■■■■□ 3.17
TSNARE1-208ENST00000524325 FGD6Q6ZV73 1430 aa34.84■■■■□ 3.17
TSNARE1-208ENST00000524325 GLI2P10070 1586 aa34.83■■■■□ 3.17
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP34.83■■■■□ 3.17
TSNARE1-208ENST00000524325 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa34.8■■■■□ 3.16
TSNARE1-208ENST00000524325 ARHGAP5Q13017 1502 aa34.8■■■■□ 3.16
TSNARE1-208ENST00000524325 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.76■■■■□ 3.16
TSNARE1-208ENST00000524325 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa34.76■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms