RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521962.1

HACE1-211, Transcript of HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 4

Gene HACE1, Length 561 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1-211ENST00000521962 SHROOM2Q13796 1616 aa27.95■■■□□ 2.06
HACE1-211ENST00000521962 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.93■■■□□ 2.06
HACE1-211ENST00000521962 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.79■■■□□ 2.04
HACE1-211ENST00000521962 PRXQ9BXM0 1461 aa27.78■■■□□ 2.04
HACE1-211ENST00000521962 EEA1Q15075 1411 aa27.75■■■□□ 2.03
HACE1-211ENST00000521962 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.74■■■□□ 2.03
HACE1-211ENST00000521962 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.71■■■□□ 2.03
HACE1-211ENST00000521962 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
HACE1-211ENST00000521962 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.67■■■□□ 2.02
HACE1-211ENST00000521962 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
HACE1-211ENST00000521962 IQGAP2Q13576 1575 aa27.62■■■□□ 2.01
HACE1-211ENST00000521962 JPH4Q96JJ6 628 aa27.62■■■□□ 2.01
HACE1-211ENST00000521962 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
HACE1-211ENST00000521962 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.55■■■□□ 2
HACE1-211ENST00000521962 KIF21BO75037 1637 aa27.52■■■□□ 2
HACE1-211ENST00000521962 MAPKBP1O60336 1514 aa27.51■■□□□ 1.99
HACE1-211ENST00000521962 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.49■■□□□ 1.99
HACE1-211ENST00000521962 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.49■■□□□ 1.99
HACE1-211ENST00000521962 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.48■■□□□ 1.99
HACE1-211ENST00000521962 DISP1Q96F81 1524 aa27.46■■□□□ 1.99
HACE1-211ENST00000521962 DIP2BQ9P265 1576 aa27.45■■□□□ 1.99
HACE1-211ENST00000521962 KIAA0556O60303 1618 aa27.38■■□□□ 1.97
HACE1-211ENST00000521962 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.37■■□□□ 1.97
HACE1-211ENST00000521962 GOLGA3Q08378 1498 aa27.34■■□□□ 1.97
HACE1-211ENST00000521962 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.34■■□□□ 1.97
HACE1-211ENST00000521962 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.31■■□□□ 1.96
HACE1-211ENST00000521962 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.28■■□□□ 1.96
HACE1-211ENST00000521962 PTPRGP23470 1445 aa27.27■■□□□ 1.96
HACE1-211ENST00000521962 SAMD9Q5K651 1589 aa27.26■■□□□ 1.95
HACE1-211ENST00000521962 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.24■■□□□ 1.95
HACE1-211ENST00000521962 KDM6BO15054 1643 aa27.23■■□□□ 1.95
HACE1-211ENST00000521962 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
HACE1-211ENST00000521962 TSPOAP1O95153 1857 aa27.17■■□□□ 1.94
HACE1-211ENST00000521962 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
HACE1-211ENST00000521962 ABCC2Q92887 1545 aa27.14■■□□□ 1.94
HACE1-211ENST00000521962 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.13■■□□□ 1.93
HACE1-211ENST00000521962 UACAQ9BZF9 1416 aa27.12■■□□□ 1.93
HACE1-211ENST00000521962 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.1■■□□□ 1.93
HACE1-211ENST00000521962 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
HACE1-211ENST00000521962 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.09■■□□□ 1.93
HACE1-211ENST00000521962 P3H3Q8IVL6 736 aa27.09■■□□□ 1.93
HACE1-211ENST00000521962 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.08■■□□□ 1.93
HACE1-211ENST00000521962 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
HACE1-211ENST00000521962 ABCA8O94911 1581 aa27.08■■□□□ 1.93
HACE1-211ENST00000521962 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.07■■□□□ 1.92
HACE1-211ENST00000521962 GLI2P10070 1586 aa27.07■■□□□ 1.92
HACE1-211ENST00000521962 ASXL2Q76L83 1435 aa27.05■■□□□ 1.92
HACE1-211ENST00000521962 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.02■■□□□ 1.92
HACE1-211ENST00000521962 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27■■□□□ 1.91
HACE1-211ENST00000521962 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
HACE1-211ENST00000521962 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.92■■□□□ 1.9
HACE1-211ENST00000521962 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.92■■□□□ 1.9
HACE1-211ENST00000521962 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
HACE1-211ENST00000521962 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
HACE1-211ENST00000521962 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
HACE1-211ENST00000521962 CLIP1P30622 1438 aa26.84■■□□□ 1.89
HACE1-211ENST00000521962 ATP10BO94823 1461 aa26.82■■□□□ 1.88
HACE1-211ENST00000521962 ADGRL1O94910 1474 aa26.82■■□□□ 1.88
HACE1-211ENST00000521962 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.82■■□□□ 1.88
HACE1-211ENST00000521962 FMN1Q68DA7 1419 aa26.8■■□□□ 1.88
HACE1-211ENST00000521962 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.79■■□□□ 1.88
HACE1-211ENST00000521962 ARID3CA6NKF2 412 aa26.78■■□□□ 1.88
HACE1-211ENST00000521962 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.77■■□□□ 1.88
HACE1-211ENST00000521962 CEP162Q5TB80 1403 aa26.77■■□□□ 1.88
HACE1-211ENST00000521962 HECW1Q76N89 1606 aa26.72■■□□□ 1.87
HACE1-211ENST00000521962 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
HACE1-211ENST00000521962 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
HACE1-211ENST00000521962 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.65■■□□□ 1.86
HACE1-211ENST00000521962 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.65■■□□□ 1.86
HACE1-211ENST00000521962 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.64■■□□□ 1.85
HACE1-211ENST00000521962 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.64■■□□□ 1.85
HACE1-211ENST00000521962 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.6■■□□□ 1.85
HACE1-211ENST00000521962 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.58■■□□□ 1.85
HACE1-211ENST00000521962 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
HACE1-211ENST00000521962 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
HACE1-211ENST00000521962 CD109Q6YHK3 1445 aa26.56■■□□□ 1.84
HACE1-211ENST00000521962 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
HACE1-211ENST00000521962 KCNH8Q96L42 1107 aa26.54■■□□□ 1.84
HACE1-211ENST00000521962 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
HACE1-211ENST00000521962 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.52■■□□□ 1.84
HACE1-211ENST00000521962 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.51■■□□□ 1.83
HACE1-211ENST00000521962 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.47■■□□□ 1.83
HACE1-211ENST00000521962 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.44■■□□□ 1.82
HACE1-211ENST00000521962 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.44■■□□□ 1.82
HACE1-211ENST00000521962 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.44■■□□□ 1.82
HACE1-211ENST00000521962 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.44■■□□□ 1.82
HACE1-211ENST00000521962 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
HACE1-211ENST00000521962 KIF14Q15058 1648 aa26.41■■□□□ 1.82
HACE1-211ENST00000521962 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
HACE1-211ENST00000521962 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.3■■□□□ 1.8
HACE1-211ENST00000521962 TIAM1Q13009 1591 aa26.28■■□□□ 1.8
HACE1-211ENST00000521962 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.28■■□□□ 1.8
HACE1-211ENST00000521962 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.26■■□□□ 1.79
HACE1-211ENST00000521962 NEO1Q92859 1461 aa26.26■■□□□ 1.79
HACE1-211ENST00000521962 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.24■■□□□ 1.79
HACE1-211ENST00000521962 PLCH2O75038 1416 aa26.24■■□□□ 1.79
HACE1-211ENST00000521962 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.22■■□□□ 1.79
HACE1-211ENST00000521962 FANCAO15360 1455 aa26.22■■□□□ 1.79
HACE1-211ENST00000521962 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.2■■□□□ 1.79
HACE1-211ENST00000521962 PTPRMP28827 1452 aa26.2■■□□□ 1.78
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