RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521404.5

MEG3-217, Transcript of maternally expressed 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MEG3, Length 1,426 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEG3-217ENST00000521404 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
MEG3-217ENST00000521404 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
MEG3-217ENST00000521404 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.92■■□□□ 1.9
MEG3-217ENST00000521404 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.92■■□□□ 1.9
MEG3-217ENST00000521404 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.72■■□□□ 1.87
MEG3-217ENST00000521404 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.68■■□□□ 1.86
MEG3-217ENST00000521404 IQGAP2Q13576 1575 aa26.65■■□□□ 1.86
MEG3-217ENST00000521404 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.65■■□□□ 1.86
MEG3-217ENST00000521404 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.61■■□□□ 1.85
MEG3-217ENST00000521404 PTPRGP23470 1445 aa26.59■■□□□ 1.85
MEG3-217ENST00000521404 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.57■■□□□ 1.84
MEG3-217ENST00000521404 PRXQ9BXM0 1461 aa26.53■■□□□ 1.84
MEG3-217ENST00000521404 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.53■■□□□ 1.84
MEG3-217ENST00000521404 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.52■■□□□ 1.84
MEG3-217ENST00000521404 MAPKBP1O60336 1514 aa26.51■■□□□ 1.83
MEG3-217ENST00000521404 DISP1Q96F81 1524 aa26.5■■□□□ 1.83
MEG3-217ENST00000521404 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.44■■□□□ 1.82
MEG3-217ENST00000521404 EEA1Q15075 1411 aa26.43■■□□□ 1.82
MEG3-217ENST00000521404 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.43■■□□□ 1.82
MEG3-217ENST00000521404 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.42■■□□□ 1.82
MEG3-217ENST00000521404 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.41■■□□□ 1.82
MEG3-217ENST00000521404 ABCC2Q92887 1545 aa26.4■■□□□ 1.82
MEG3-217ENST00000521404 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
MEG3-217ENST00000521404 UACAQ9BZF9 1416 aa26.39■■□□□ 1.82
MEG3-217ENST00000521404 KIAA0556O60303 1618 aa26.39■■□□□ 1.82
MEG3-217ENST00000521404 GOLGA3Q08378 1498 aa26.38■■□□□ 1.81
MEG3-217ENST00000521404 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.38■■□□□ 1.81
MEG3-217ENST00000521404 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.38■■□□□ 1.81
MEG3-217ENST00000521404 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
MEG3-217ENST00000521404 DIP2BQ9P265 1576 aa26.33■■□□□ 1.81
MEG3-217ENST00000521404 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.28■■□□□ 1.8
MEG3-217ENST00000521404 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.26■■□□□ 1.8
MEG3-217ENST00000521404 ASXL2Q76L83 1435 aa26.24■■□□□ 1.79
MEG3-217ENST00000521404 GLI2P10070 1586 aa26.17■■□□□ 1.78
MEG3-217ENST00000521404 ABCA8O94911 1581 aa26.14■■□□□ 1.78
MEG3-217ENST00000521404 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
MEG3-217ENST00000521404 KIF21BO75037 1637 aa26.11■■□□□ 1.77
MEG3-217ENST00000521404 SAMD9Q5K651 1589 aa26.09■■□□□ 1.77
MEG3-217ENST00000521404 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
MEG3-217ENST00000521404 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.06■■□□□ 1.76
MEG3-217ENST00000521404 P3H3Q8IVL6 736 aa26.05■■□□□ 1.76
MEG3-217ENST00000521404 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.05■■□□□ 1.76
MEG3-217ENST00000521404 TSPOAP1O95153 1857 aa26.02■■□□□ 1.76
MEG3-217ENST00000521404 KDM6BO15054 1643 aa26.01■■□□□ 1.75
MEG3-217ENST00000521404 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.98■■□□□ 1.75
MEG3-217ENST00000521404 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.96■■□□□ 1.75
MEG3-217ENST00000521404 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.95■■□□□ 1.74
MEG3-217ENST00000521404 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
MEG3-217ENST00000521404 ATP10BO94823 1461 aa25.93■■□□□ 1.74
MEG3-217ENST00000521404 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.91■■□□□ 1.74
MEG3-217ENST00000521404 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
MEG3-217ENST00000521404 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
MEG3-217ENST00000521404 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.9■■□□□ 1.74
MEG3-217ENST00000521404 KCNH8Q96L42 1107 aa25.89■■□□□ 1.74
MEG3-217ENST00000521404 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
MEG3-217ENST00000521404 CD109Q6YHK3 1445 aa25.87■■□□□ 1.73
MEG3-217ENST00000521404 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.86■■□□□ 1.73
MEG3-217ENST00000521404 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.85■■□□□ 1.73
MEG3-217ENST00000521404 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
MEG3-217ENST00000521404 ARID3CA6NKF2 412 aa25.83■■□□□ 1.73
MEG3-217ENST00000521404 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
MEG3-217ENST00000521404 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
MEG3-217ENST00000521404 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
MEG3-217ENST00000521404 FMN1Q68DA7 1419 aa25.74■■□□□ 1.71
MEG3-217ENST00000521404 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.73■■□□□ 1.71
MEG3-217ENST00000521404 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.73■■□□□ 1.71
MEG3-217ENST00000521404 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.72■■□□□ 1.71
MEG3-217ENST00000521404 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.71■■□□□ 1.71
MEG3-217ENST00000521404 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.67■■□□□ 1.7
MEG3-217ENST00000521404 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.65■■□□□ 1.7
MEG3-217ENST00000521404 NEO1Q92859 1461 aa25.62■■□□□ 1.69
MEG3-217ENST00000521404 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.61■■□□□ 1.69
MEG3-217ENST00000521404 HECW1Q76N89 1606 aa25.6■■□□□ 1.69
MEG3-217ENST00000521404 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
MEG3-217ENST00000521404 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
MEG3-217ENST00000521404 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
MEG3-217ENST00000521404 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.52■■□□□ 1.68
MEG3-217ENST00000521404 ADGRL1O94910 1474 aa25.48■■□□□ 1.67
MEG3-217ENST00000521404 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.47■■□□□ 1.67
MEG3-217ENST00000521404 FANCAO15360 1455 aa25.46■■□□□ 1.67
MEG3-217ENST00000521404 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.46■■□□□ 1.67
MEG3-217ENST00000521404 CLIP1P30622 1438 aa25.46■■□□□ 1.67
MEG3-217ENST00000521404 RAPGEF3O95398 923 aa25.45■■□□□ 1.66
MEG3-217ENST00000521404 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.45■■□□□ 1.66
MEG3-217ENST00000521404 AKNAQ7Z591 1439 aa25.44■■□□□ 1.66
MEG3-217ENST00000521404 PLCH2O75038 1416 aa25.43■■□□□ 1.66
MEG3-217ENST00000521404 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
MEG3-217ENST00000521404 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.42■■□□□ 1.66
MEG3-217ENST00000521404 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
MEG3-217ENST00000521404 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.38■■□□□ 1.65
MEG3-217ENST00000521404 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
MEG3-217ENST00000521404 KIF14Q15058 1648 aa25.37■■□□□ 1.65
MEG3-217ENST00000521404 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.37■■□□□ 1.65
MEG3-217ENST00000521404 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.35■■□□□ 1.65
MEG3-217ENST00000521404 CEP162Q5TB80 1403 aa25.34■■□□□ 1.65
MEG3-217ENST00000521404 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.34■■□□□ 1.65
MEG3-217ENST00000521404 RICTORQ6R327 1708 aa25.3■■□□□ 1.64
MEG3-217ENST00000521404 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.3■■□□□ 1.64
MEG3-217ENST00000521404 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.28■■□□□ 1.64
MEG3-217ENST00000521404 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms