RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518848.5

HOXA-AS3-201, HOXA cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4

Gene HOXA-AS3, Length 562 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA-AS3-201ENST00000518848 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.95■■■□□ 2.38
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.9■■■□□ 2.38
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CUL7Q14999 1698 aa29.87■■■□□ 2.37
HOXA-AS3-201ENST00000518848 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.79■■■□□ 2.36
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.75■■■□□ 2.35
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.74■■■□□ 2.35
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MAPKBP1O60336 1514 aa29.73■■■□□ 2.35
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.71■■■□□ 2.35
HOXA-AS3-201ENST00000518848 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.66■■■□□ 2.34
HOXA-AS3-201ENST00000518848 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.65■■■□□ 2.34
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PTPRGP23470 1445 aa29.61■■■□□ 2.33
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.61■■■□□ 2.33
HOXA-AS3-201ENST00000518848 DIP2BQ9P265 1576 aa29.56■■■□□ 2.32
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.55■■■□□ 2.32
HOXA-AS3-201ENST00000518848 IQGAP2Q13576 1575 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXA-AS3-201ENST00000518848 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.47■■■□□ 2.31
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ABCC2Q92887 1545 aa29.45■■■□□ 2.31
HOXA-AS3-201ENST00000518848 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.44■■■□□ 2.3
HOXA-AS3-201ENST00000518848 DISP1Q96F81 1524 aa29.4■■■□□ 2.3
HOXA-AS3-201ENST00000518848 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.39■■■□□ 2.3
HOXA-AS3-201ENST00000518848 UACAQ9BZF9 1416 aa29.37■■■□□ 2.29
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.37■■■□□ 2.29
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ASXL2Q76L83 1435 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXA-AS3-201ENST00000518848 GLI2P10070 1586 aa29.31■■■□□ 2.28
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KDM6BO15054 1643 aa29.31■■■□□ 2.28
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TSPOAP1O95153 1857 aa29.26■■■□□ 2.27
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KIAA0556O60303 1618 aa29.24■■■□□ 2.27
HOXA-AS3-201ENST00000518848 GOLGA3Q08378 1498 aa29.17■■■□□ 2.26
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PRXQ9BXM0 1461 aa29.17■■■□□ 2.26
HOXA-AS3-201ENST00000518848 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.15■■■□□ 2.26
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.07■■■□□ 2.24
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.07■■■□□ 2.24
HOXA-AS3-201ENST00000518848 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ABCA8O94911 1581 aa29.01■■■□□ 2.23
HOXA-AS3-201ENST00000518848 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
HOXA-AS3-201ENST00000518848 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.93■■■□□ 2.22
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.9■■■□□ 2.22
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CD109Q6YHK3 1445 aa28.89■■■□□ 2.22
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.87■■■□□ 2.21
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KCNH8Q96L42 1107 aa28.85■■■□□ 2.21
HOXA-AS3-201ENST00000518848 EEA1Q15075 1411 aa28.85■■■□□ 2.21
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ADGRL1O94910 1474 aa28.79■■■□□ 2.2
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ATP10BO94823 1461 aa28.78■■■□□ 2.2
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SAMD9Q5K651 1589 aa28.78■■■□□ 2.2
HOXA-AS3-201ENST00000518848 P3H3Q8IVL6 736 aa28.75■■■□□ 2.19
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.72■■■□□ 2.19
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.69■■■□□ 2.18
HOXA-AS3-201ENST00000518848 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ARID3CA6NKF2 412 aa28.62■■■□□ 2.17
HOXA-AS3-201ENST00000518848 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
HOXA-AS3-201ENST00000518848 NEO1Q92859 1461 aa28.56■■■□□ 2.16
HOXA-AS3-201ENST00000518848 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
HOXA-AS3-201ENST00000518848 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KIF21BO75037 1637 aa28.54■■■□□ 2.16
HOXA-AS3-201ENST00000518848 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXA-AS3-201ENST00000518848 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.52■■■□□ 2.16
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.5■■■□□ 2.15
HOXA-AS3-201ENST00000518848 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
HOXA-AS3-201ENST00000518848 RAPGEF3O95398 923 aa28.43■■■□□ 2.14
HOXA-AS3-201ENST00000518848 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.4■■■□□ 2.14
HOXA-AS3-201ENST00000518848 AKNAQ7Z591 1439 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXA-AS3-201ENST00000518848 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
HOXA-AS3-201ENST00000518848 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.32■■■□□ 2.12
HOXA-AS3-201ENST00000518848 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXA-AS3-201ENST00000518848 FANCAO15360 1455 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXA-AS3-201ENST00000518848 FMN1Q68DA7 1419 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXA-AS3-201ENST00000518848 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PTPRMP28827 1452 aa28.25■■■□□ 2.11
HOXA-AS3-201ENST00000518848 RICTORQ6R327 1708 aa28.23■■■□□ 2.11
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.22■■■□□ 2.11
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.22■■■□□ 2.11
HOXA-AS3-201ENST00000518848 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PLCH2O75038 1416 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.11
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.19■■■□□ 2.1
HOXA-AS3-201ENST00000518848 HECW1Q76N89 1606 aa28.18■■■□□ 2.1
HOXA-AS3-201ENST00000518848 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.13■■■□□ 2.09
HOXA-AS3-201ENST00000518848 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.12■■■□□ 2.09
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MADDQ8WXG6 1647 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXA-AS3-201ENST00000518848 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms