RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517979.1

CCDC25-202, Transcript of coiled-coil domain containing 25, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCDC25, Length 877 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CCDC25-202ENST00000517979 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.64■■□□□ 1.21
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CCDC25-202ENST00000517979 KCNH8Q96L42 1107 aa22.59■■□□□ 1.21
CCDC25-202ENST00000517979 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.59■■□□□ 1.21
CCDC25-202ENST00000517979 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
CCDC25-202ENST00000517979 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.55■■□□□ 1.2
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CCDC25-202ENST00000517979 CD109Q6YHK3 1445 aa22.53■■□□□ 1.2
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CCDC25-202ENST00000517979 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.38■■□□□ 1.17
CCDC25-202ENST00000517979 HECW1Q76N89 1606 aa22.38■■□□□ 1.17
CCDC25-202ENST00000517979 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CCDC25-202ENST00000517979 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.3■■□□□ 1.16
CCDC25-202ENST00000517979 NEO1Q92859 1461 aa22.28■■□□□ 1.16
CCDC25-202ENST00000517979 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.28■■□□□ 1.16
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CCDC25-202ENST00000517979 CLIP1P30622 1438 aa22.25■■□□□ 1.15
CCDC25-202ENST00000517979 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CCDC25-202ENST00000517979 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CCDC25-202ENST00000517979 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.22■■□□□ 1.15
CCDC25-202ENST00000517979 ADGRL1O94910 1474 aa22.22■■□□□ 1.15
CCDC25-202ENST00000517979 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.21■■□□□ 1.15
CCDC25-202ENST00000517979 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.21■■□□□ 1.15
CCDC25-202ENST00000517979 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.21■■□□□ 1.15
CCDC25-202ENST00000517979 FANCAO15360 1455 aa22.2■■□□□ 1.14
CCDC25-202ENST00000517979 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.18■■□□□ 1.14
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