RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514834.1

ITGA3-214, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ITGA3, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-214ENST00000514834 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.81■■□□□ 1.4
ITGA3-214ENST00000514834 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
ITGA3-214ENST00000514834 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.73■■□□□ 1.39
ITGA3-214ENST00000514834 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
ITGA3-214ENST00000514834 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.62■■□□□ 1.37
ITGA3-214ENST00000514834 IQGAP2Q13576 1575 aa23.56■■□□□ 1.36
ITGA3-214ENST00000514834 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
ITGA3-214ENST00000514834 PRXQ9BXM0 1461 aa23.49■■□□□ 1.35
ITGA3-214ENST00000514834 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.48■■□□□ 1.35
ITGA3-214ENST00000514834 DISP1Q96F81 1524 aa23.46■■□□□ 1.35
ITGA3-214ENST00000514834 PTPRGP23470 1445 aa23.45■■□□□ 1.34
ITGA3-214ENST00000514834 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.44■■□□□ 1.34
ITGA3-214ENST00000514834 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.43■■□□□ 1.34
ITGA3-214ENST00000514834 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.42■■□□□ 1.34
ITGA3-214ENST00000514834 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.41■■□□□ 1.34
ITGA3-214ENST00000514834 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.41■■□□□ 1.34
ITGA3-214ENST00000514834 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.37■■□□□ 1.33
ITGA3-214ENST00000514834 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.36■■□□□ 1.33
ITGA3-214ENST00000514834 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.33
ITGA3-214ENST00000514834 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
ITGA3-214ENST00000514834 KIAA0556O60303 1618 aa23.35■■□□□ 1.33
ITGA3-214ENST00000514834 MAPKBP1O60336 1514 aa23.32■■□□□ 1.32
ITGA3-214ENST00000514834 EEA1Q15075 1411 aa23.29■■□□□ 1.32
ITGA3-214ENST00000514834 UACAQ9BZF9 1416 aa23.27■■□□□ 1.32
ITGA3-214ENST00000514834 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.27■■□□□ 1.32
ITGA3-214ENST00000514834 ABCC2Q92887 1545 aa23.27■■□□□ 1.32
ITGA3-214ENST00000514834 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.26■■□□□ 1.31
ITGA3-214ENST00000514834 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.25■■□□□ 1.31
ITGA3-214ENST00000514834 DIP2BQ9P265 1576 aa23.24■■□□□ 1.31
ITGA3-214ENST00000514834 GOLGA3Q08378 1498 aa23.21■■□□□ 1.31
ITGA3-214ENST00000514834 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
ITGA3-214ENST00000514834 P3H3Q8IVL6 736 aa23.2■■□□□ 1.3
ITGA3-214ENST00000514834 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.19■■□□□ 1.3
ITGA3-214ENST00000514834 ASXL2Q76L83 1435 aa23.17■■□□□ 1.3
ITGA3-214ENST00000514834 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.17■■□□□ 1.3
ITGA3-214ENST00000514834 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.14■■□□□ 1.29
ITGA3-214ENST00000514834 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
ITGA3-214ENST00000514834 KIF21BO75037 1637 aa23.13■■□□□ 1.29
ITGA3-214ENST00000514834 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
ITGA3-214ENST00000514834 ABCA8O94911 1581 aa23.13■■□□□ 1.29
ITGA3-214ENST00000514834 TSPOAP1O95153 1857 aa23.11■■□□□ 1.29
ITGA3-214ENST00000514834 SAMD9Q5K651 1589 aa23.11■■□□□ 1.29
ITGA3-214ENST00000514834 ARID3CA6NKF2 412 aa23.03■■□□□ 1.28
ITGA3-214ENST00000514834 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
ITGA3-214ENST00000514834 GLI2P10070 1586 aa23.02■■□□□ 1.28
ITGA3-214ENST00000514834 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23■■□□□ 1.27
ITGA3-214ENST00000514834 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
ITGA3-214ENST00000514834 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
ITGA3-214ENST00000514834 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.98■■□□□ 1.27
ITGA3-214ENST00000514834 ATP10BO94823 1461 aa22.97■■□□□ 1.27
ITGA3-214ENST00000514834 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.94■■□□□ 1.26
ITGA3-214ENST00000514834 KCNH8Q96L42 1107 aa22.94■■□□□ 1.26
ITGA3-214ENST00000514834 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.93■■□□□ 1.26
ITGA3-214ENST00000514834 KDM6BO15054 1643 aa22.92■■□□□ 1.26
ITGA3-214ENST00000514834 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.89■■□□□ 1.26
ITGA3-214ENST00000514834 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
ITGA3-214ENST00000514834 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
ITGA3-214ENST00000514834 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.83■■□□□ 1.25
ITGA3-214ENST00000514834 CD109Q6YHK3 1445 aa22.82■■□□□ 1.24
ITGA3-214ENST00000514834 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
ITGA3-214ENST00000514834 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
ITGA3-214ENST00000514834 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.8■■□□□ 1.24
ITGA3-214ENST00000514834 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.78■■□□□ 1.24
ITGA3-214ENST00000514834 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.76■■□□□ 1.23
ITGA3-214ENST00000514834 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
ITGA3-214ENST00000514834 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.72■■□□□ 1.23
ITGA3-214ENST00000514834 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
ITGA3-214ENST00000514834 FMN1Q68DA7 1419 aa22.68■■□□□ 1.22
ITGA3-214ENST00000514834 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.68■■□□□ 1.22
ITGA3-214ENST00000514834 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.62■■□□□ 1.21
ITGA3-214ENST00000514834 HECW1Q76N89 1606 aa22.62■■□□□ 1.21
ITGA3-214ENST00000514834 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.62■■□□□ 1.21
ITGA3-214ENST00000514834 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.6■■□□□ 1.21
ITGA3-214ENST00000514834 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.58■■□□□ 1.21
ITGA3-214ENST00000514834 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.58■■□□□ 1.2
ITGA3-214ENST00000514834 CLIP1P30622 1438 aa22.57■■□□□ 1.2
ITGA3-214ENST00000514834 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
ITGA3-214ENST00000514834 RAPGEF3O95398 923 aa22.53■■□□□ 1.2
ITGA3-214ENST00000514834 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.53■■□□□ 1.2
ITGA3-214ENST00000514834 NEO1Q92859 1461 aa22.53■■□□□ 1.2
ITGA3-214ENST00000514834 KIF14Q15058 1648 aa22.5■■□□□ 1.19
ITGA3-214ENST00000514834 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.5■■□□□ 1.19
ITGA3-214ENST00000514834 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.49■■□□□ 1.19
ITGA3-214ENST00000514834 FANCAO15360 1455 aa22.47■■□□□ 1.19
ITGA3-214ENST00000514834 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.47■■□□□ 1.19
ITGA3-214ENST00000514834 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
ITGA3-214ENST00000514834 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
ITGA3-214ENST00000514834 ADGRL1O94910 1474 aa22.47■■□□□ 1.19
ITGA3-214ENST00000514834 AKNAQ7Z591 1439 aa22.46■■□□□ 1.19
ITGA3-214ENST00000514834 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.43■■□□□ 1.18
ITGA3-214ENST00000514834 PLCH2O75038 1416 aa22.43■■□□□ 1.18
ITGA3-214ENST00000514834 CEP162Q5TB80 1403 aa22.42■■□□□ 1.18
ITGA3-214ENST00000514834 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.41■■□□□ 1.18
ITGA3-214ENST00000514834 RICTORQ6R327 1708 aa22.4■■□□□ 1.18
ITGA3-214ENST00000514834 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.4■■□□□ 1.18
ITGA3-214ENST00000514834 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.39■■□□□ 1.18
ITGA3-214ENST00000514834 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
ITGA3-214ENST00000514834 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.34■■□□□ 1.17
ITGA3-214ENST00000514834 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.34■■□□□ 1.17
ITGA3-214ENST00000514834 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms