RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512131.5

SH3BP2-223, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGF1R	P08069	1367 aa		29.41	■■■□□ 2.3
SH3BP2-223	ENST00000512131	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		29.37	■■■□□ 2.29
SH3BP2-223	ENST00000512131	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		29.34	■■■□□ 2.29
SH3BP2-223	ENST00000512131	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		29.28	■■■□□ 2.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		29.28	■■■□□ 2.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	29.27	■■■□□ 2.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	CUL7	Q14999	1698 aa		29.26	■■■□□ 2.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	MAPKBP1	O60336	1514 aa		29.24	■■■□□ 2.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		29.23	■■■□□ 2.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		29.21	■■■□□ 2.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		29.2	■■■□□ 2.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		29.18	■■■□□ 2.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	DIP2B	Q9P265	1576 aa		29.15	■■■□□ 2.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	PTPRG	P23470	1445 aa		29.03	■■■□□ 2.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		29.03	■■■□□ 2.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	PRX	Q9BXM0	1461 aa		28.99	■■■□□ 2.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	EEA1	Q15075	1411 aa		28.99	■■■□□ 2.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	KDM6B	O15054	1643 aa		28.96	■■■□□ 2.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		28.95	■■■□□ 2.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		28.95	■■■□□ 2.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	28.94	■■■□□ 2.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		28.94	■■■□□ 2.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	ABCC2	Q92887	1545 aa		28.9	■■■□□ 2.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		28.9	■■■□□ 2.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	TSPOAP1	O95153	1857 aa		28.89	■■■□□ 2.21
SH3BP2-223	ENST00000512131	IQGAP2	Q13576	1575 aa		28.86	■■■□□ 2.21
SH3BP2-223	ENST00000512131	ASXL2	Q76L83	1435 aa		28.85	■■■□□ 2.21
SH3BP2-223	ENST00000512131	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		28.83	■■■□□ 2.21
SH3BP2-223	ENST00000512131	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	DISP1	Q96F81	1524 aa		28.79	■■■□□ 2.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	UACA	Q9BZF9	1416 aa		28.79	■■■□□ 2.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	GLI2	P10070	1586 aa		28.77	■■■□□ 2.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	28.7	■■■□□ 2.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		28.7	■■■□□ 2.18
SH3BP2-223	ENST00000512131	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		28.69	■■■□□ 2.18
SH3BP2-223	ENST00000512131	KIF21B	O75037	1637 aa		28.67	■■■□□ 2.18
SH3BP2-223	ENST00000512131	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	28.67	■■■□□ 2.18
SH3BP2-223	ENST00000512131	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	28.63	■■■□□ 2.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	KIAA0556	O60303	1618 aa		28.6	■■■□□ 2.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		28.58	■■■□□ 2.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	28.57	■■■□□ 2.16
SH3BP2-223	ENST00000512131	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		28.56	■■■□□ 2.16
SH3BP2-223	ENST00000512131	ADGRL1	O94910	1474 aa		28.55	■■■□□ 2.16
SH3BP2-223	ENST00000512131	GOLGA3	Q08378	1498 aa		28.52	■■■□□ 2.16
SH3BP2-223	ENST00000512131	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		28.5	■■■□□ 2.15
SH3BP2-223	ENST00000512131	SAMD9	Q5K651	1589 aa		28.4	■■■□□ 2.14
SH3BP2-223	ENST00000512131	ABCA8	O94911	1581 aa		28.38	■■■□□ 2.13
SH3BP2-223	ENST00000512131	CD109	Q6YHK3	1445 aa		28.38	■■■□□ 2.13
SH3BP2-223	ENST00000512131	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	28.37	■■■□□ 2.13
SH3BP2-223	ENST00000512131	KCNH8	Q96L42	1107 aa		28.37	■■■□□ 2.13
SH3BP2-223	ENST00000512131	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		28.37	■■■□□ 2.13
SH3BP2-223	ENST00000512131	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	28.33	■■■□□ 2.13
SH3BP2-223	ENST00000512131	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		28.33	■■■□□ 2.13
SH3BP2-223	ENST00000512131	P3H3	Q8IVL6	736 aa		28.29	■■■□□ 2.12
SH3BP2-223	ENST00000512131	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		28.29	■■■□□ 2.12
SH3BP2-223	ENST00000512131	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		28.27	■■■□□ 2.12
SH3BP2-223	ENST00000512131	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		28.24	■■■□□ 2.11
SH3BP2-223	ENST00000512131	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	28.24	■■■□□ 2.11
SH3BP2-223	ENST00000512131	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		28.19	■■■□□ 2.1
SH3BP2-223	ENST00000512131	ARID3C	A6NKF2	412 aa		28.19	■■■□□ 2.1
SH3BP2-223	ENST00000512131	ATP10B	O94823	1461 aa		28.18	■■■□□ 2.1
SH3BP2-223	ENST00000512131	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		28.16	■■■□□ 2.1
SH3BP2-223	ENST00000512131	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		28.15	■■■□□ 2.1
SH3BP2-223	ENST00000512131	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		28.07	■■■□□ 2.08
SH3BP2-223	ENST00000512131	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		28.07	■■■□□ 2.08
SH3BP2-223	ENST00000512131	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		28.05	■■■□□ 2.08
SH3BP2-223	ENST00000512131	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	28.02	■■■□□ 2.08
SH3BP2-223	ENST00000512131	FMN1	Q68DA7	1419 aa		28.01	■■■□□ 2.07
SH3BP2-223	ENST00000512131	RAPGEF3	O95398	923 aa		28	■■■□□ 2.07
SH3BP2-223	ENST00000512131	CLIP1	P30622	1438 aa		27.99	■■■□□ 2.07
SH3BP2-223	ENST00000512131	NEO1	Q92859	1461 aa		27.97	■■■□□ 2.07
SH3BP2-223	ENST00000512131	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
SH3BP2-223	ENST00000512131	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
SH3BP2-223	ENST00000512131	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		27.95	■■■□□ 2.06
SH3BP2-223	ENST00000512131	PTPRM	P28827	1452 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SH3BP2-223	ENST00000512131	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		27.9	■■■□□ 2.06
SH3BP2-223	ENST00000512131	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SH3BP2-223	ENST00000512131	CEP162	Q5TB80	1403 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SH3BP2-223	ENST00000512131	HECW1	Q76N89	1606 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SH3BP2-223	ENST00000512131	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SH3BP2-223	ENST00000512131	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
SH3BP2-223	ENST00000512131	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SH3BP2-223	ENST00000512131	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SH3BP2-223	ENST00000512131	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
SH3BP2-223	ENST00000512131	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
SH3BP2-223	ENST00000512131	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
SH3BP2-223	ENST00000512131	AKNA	Q7Z591	1439 aa		27.76	■■■□□ 2.04
SH3BP2-223	ENST00000512131	MADD	Q8WXG6	1647 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SH3BP2-223	ENST00000512131	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
SH3BP2-223	ENST00000512131	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SH3BP2-223	ENST00000512131	FBXO41	Q8TF61	875 aa		27.74	■■■□□ 2.03
SH3BP2-223	ENST00000512131	FANCA	O15360	1455 aa		27.74	■■■□□ 2.03
SH3BP2-223	ENST00000512131	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SH3BP2-223	ENST00000512131	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	27.72	■■■□□ 2.03
SH3BP2-223	ENST00000512131	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		27.7	■■■□□ 2.03
SH3BP2-223	ENST00000512131	RICTOR	Q6R327	1708 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SH3BP2-223	ENST00000512131	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		27.69	■■■□□ 2.02
SH3BP2-223	ENST00000512131	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		27.67	■■■□□ 2.02

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