RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511347.5

SPATA20-217, Transcript of spermatogenesis associated 20, humanhuman

TSL 5

Gene SPATA20, Length 1,035 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA20-217ENST00000511347 SHROOM2Q13796 1616 aa27■■□□□ 1.91
SPATA20-217ENST00000511347 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27■■□□□ 1.91
SPATA20-217ENST00000511347 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.99■■□□□ 1.91
SPATA20-217ENST00000511347 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.99■■□□□ 1.91
SPATA20-217ENST00000511347 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
SPATA20-217ENST00000511347 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.9■■□□□ 1.9
SPATA20-217ENST00000511347 PRXQ9BXM0 1461 aa26.87■■□□□ 1.89
SPATA20-217ENST00000511347 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
SPATA20-217ENST00000511347 EEA1Q15075 1411 aa26.84■■□□□ 1.89
SPATA20-217ENST00000511347 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
SPATA20-217ENST00000511347 IQGAP2Q13576 1575 aa26.78■■□□□ 1.88
SPATA20-217ENST00000511347 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.72■■□□□ 1.87
SPATA20-217ENST00000511347 PTPRGP23470 1445 aa26.66■■□□□ 1.86
SPATA20-217ENST00000511347 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.66■■□□□ 1.86
SPATA20-217ENST00000511347 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.66■■□□□ 1.86
SPATA20-217ENST00000511347 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
SPATA20-217ENST00000511347 DISP1Q96F81 1524 aa26.64■■□□□ 1.85
SPATA20-217ENST00000511347 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.6■■□□□ 1.85
SPATA20-217ENST00000511347 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.55■■□□□ 1.84
SPATA20-217ENST00000511347 KIAA0556O60303 1618 aa26.52■■□□□ 1.84
SPATA20-217ENST00000511347 GOLGA3Q08378 1498 aa26.52■■□□□ 1.84
SPATA20-217ENST00000511347 KIF21BO75037 1637 aa26.51■■□□□ 1.83
SPATA20-217ENST00000511347 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.5■■□□□ 1.83
SPATA20-217ENST00000511347 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.48■■□□□ 1.83
SPATA20-217ENST00000511347 UACAQ9BZF9 1416 aa26.46■■□□□ 1.83
SPATA20-217ENST00000511347 P3H3Q8IVL6 736 aa26.44■■□□□ 1.82
SPATA20-217ENST00000511347 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
SPATA20-217ENST00000511347 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
SPATA20-217ENST00000511347 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.41■■□□□ 1.82
SPATA20-217ENST00000511347 ABCC2Q92887 1545 aa26.38■■□□□ 1.81
SPATA20-217ENST00000511347 MAPKBP1O60336 1514 aa26.35■■□□□ 1.81
SPATA20-217ENST00000511347 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.33■■□□□ 1.81
SPATA20-217ENST00000511347 SAMD9Q5K651 1589 aa26.32■■□□□ 1.8
SPATA20-217ENST00000511347 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.3■■□□□ 1.8
SPATA20-217ENST00000511347 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.28■■□□□ 1.8
SPATA20-217ENST00000511347 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.28■■□□□ 1.8
SPATA20-217ENST00000511347 ABCA8O94911 1581 aa26.27■■□□□ 1.8
SPATA20-217ENST00000511347 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.24■■□□□ 1.79
SPATA20-217ENST00000511347 ASXL2Q76L83 1435 aa26.23■■□□□ 1.79
SPATA20-217ENST00000511347 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.2■■□□□ 1.79
SPATA20-217ENST00000511347 DIP2BQ9P265 1576 aa26.17■■□□□ 1.78
SPATA20-217ENST00000511347 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.17■■□□□ 1.78
SPATA20-217ENST00000511347 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
SPATA20-217ENST00000511347 ARID3CA6NKF2 412 aa26.16■■□□□ 1.78
SPATA20-217ENST00000511347 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.11■■□□□ 1.77
SPATA20-217ENST00000511347 ATP10BO94823 1461 aa26.11■■□□□ 1.77
SPATA20-217ENST00000511347 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.09■■□□□ 1.77
SPATA20-217ENST00000511347 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
SPATA20-217ENST00000511347 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.07■■□□□ 1.76
SPATA20-217ENST00000511347 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
SPATA20-217ENST00000511347 GLI2P10070 1586 aa26.04■■□□□ 1.76
SPATA20-217ENST00000511347 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
SPATA20-217ENST00000511347 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
SPATA20-217ENST00000511347 KCNH8Q96L42 1107 aa26.04■■□□□ 1.76
SPATA20-217ENST00000511347 FMN1Q68DA7 1419 aa26.01■■□□□ 1.75
SPATA20-217ENST00000511347 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
SPATA20-217ENST00000511347 CLIP1P30622 1438 aa25.96■■□□□ 1.75
SPATA20-217ENST00000511347 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.93■■□□□ 1.74
SPATA20-217ENST00000511347 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
SPATA20-217ENST00000511347 TSPOAP1O95153 1857 aa25.93■■□□□ 1.74
SPATA20-217ENST00000511347 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.92■■□□□ 1.74
SPATA20-217ENST00000511347 CD109Q6YHK3 1445 aa25.88■■□□□ 1.73
SPATA20-217ENST00000511347 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.88■■□□□ 1.73
SPATA20-217ENST00000511347 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
SPATA20-217ENST00000511347 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
SPATA20-217ENST00000511347 HECW1Q76N89 1606 aa25.83■■□□□ 1.73
SPATA20-217ENST00000511347 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.83■■□□□ 1.73
SPATA20-217ENST00000511347 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.81■■□□□ 1.72
SPATA20-217ENST00000511347 CEP162Q5TB80 1403 aa25.8■■□□□ 1.72
SPATA20-217ENST00000511347 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.8■■□□□ 1.72
SPATA20-217ENST00000511347 KDM6BO15054 1643 aa25.79■■□□□ 1.72
SPATA20-217ENST00000511347 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.79■■□□□ 1.72
SPATA20-217ENST00000511347 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
SPATA20-217ENST00000511347 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.74■■□□□ 1.71
SPATA20-217ENST00000511347 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
SPATA20-217ENST00000511347 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
SPATA20-217ENST00000511347 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.7■■□□□ 1.7
SPATA20-217ENST00000511347 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.68■■□□□ 1.7
SPATA20-217ENST00000511347 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
SPATA20-217ENST00000511347 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.66■■□□□ 1.7
SPATA20-217ENST00000511347 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.65■■□□□ 1.7
SPATA20-217ENST00000511347 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.62■■□□□ 1.69
SPATA20-217ENST00000511347 NEO1Q92859 1461 aa25.6■■□□□ 1.69
SPATA20-217ENST00000511347 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.59■■□□□ 1.69
SPATA20-217ENST00000511347 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.58■■□□□ 1.68
SPATA20-217ENST00000511347 PLCH2O75038 1416 aa25.55■■□□□ 1.68
SPATA20-217ENST00000511347 KIF14Q15058 1648 aa25.54■■□□□ 1.68
SPATA20-217ENST00000511347 FANCAO15360 1455 aa25.53■■□□□ 1.68
SPATA20-217ENST00000511347 AKNAQ7Z591 1439 aa25.52■■□□□ 1.68
SPATA20-217ENST00000511347 RAPGEF3O95398 923 aa25.51■■□□□ 1.67
SPATA20-217ENST00000511347 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.5■■□□□ 1.67
SPATA20-217ENST00000511347 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.5■■□□□ 1.67
SPATA20-217ENST00000511347 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.46■■□□□ 1.67
SPATA20-217ENST00000511347 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.44■■□□□ 1.66
SPATA20-217ENST00000511347 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
SPATA20-217ENST00000511347 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.42■■□□□ 1.66
SPATA20-217ENST00000511347 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.41■■□□□ 1.66
SPATA20-217ENST00000511347 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.4■■□□□ 1.66
SPATA20-217ENST00000511347 ADGRL1O94910 1474 aa25.4■■□□□ 1.66
SPATA20-217ENST00000511347 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms