RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511347.5

SPATA20-217, Transcript of spermatogenesis associated 20, humanhuman

TSL 5

Gene SPATA20, Length 1,035 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA20-217ENST00000511347 SHROOM2Q13796 1616 aa27■■□□□ 1.91
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SPATA20-217ENST00000511347 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.99■■□□□ 1.91
SPATA20-217ENST00000511347 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
SPATA20-217ENST00000511347 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.9■■□□□ 1.9
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SPATA20-217ENST00000511347 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
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SPATA20-217ENST00000511347 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
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SPATA20-217ENST00000511347 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.17■■□□□ 1.78
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SPATA20-217ENST00000511347 ATP10BO94823 1461 aa26.11■■□□□ 1.77
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SPATA20-217ENST00000511347 KDM6BO15054 1643 aa25.79■■□□□ 1.72
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SPATA20-217ENST00000511347 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.68■■□□□ 1.7
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SPATA20-217ENST00000511347 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.46■■□□□ 1.67
SPATA20-217ENST00000511347 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.44■■□□□ 1.66
SPATA20-217ENST00000511347 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
SPATA20-217ENST00000511347 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.42■■□□□ 1.66
SPATA20-217ENST00000511347 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.41■■□□□ 1.66
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SPATA20-217ENST00000511347 ADGRL1O94910 1474 aa25.4■■□□□ 1.66
SPATA20-217ENST00000511347 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.39■■□□□ 1.66
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