RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508707.5

APBB2-216, Transcript of amyloid beta precursor protein binding family B member 2, human

TSL 2

Gene APBB2, Length 639 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APBB2-216	ENST00000508707	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		33.2	■■■□□ 2.91
APBB2-216	ENST00000508707	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		33.2	■■■□□ 2.91
APBB2-216	ENST00000508707	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		33.2	■■■□□ 2.91
APBB2-216	ENST00000508707	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
APBB2-216	ENST00000508707	SHROOM2	Q13796	1616 aa		33.17	■■■□□ 2.9
APBB2-216	ENST00000508707	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		33.15	■■■□□ 2.9
APBB2-216	ENST00000508707	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	33.11	■■■□□ 2.89
APBB2-216	ENST00000508707	PRX	Q9BXM0	1461 aa		33.05	■■■□□ 2.88
APBB2-216	ENST00000508707	EEA1	Q15075	1411 aa		33.02	■■■□□ 2.88
APBB2-216	ENST00000508707	IQGAP2	Q13576	1575 aa		32.94	■■■□□ 2.86
APBB2-216	ENST00000508707	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	32.89	■■■□□ 2.86
APBB2-216	ENST00000508707	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		32.88	■■■□□ 2.85
APBB2-216	ENST00000508707	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	32.84	■■■□□ 2.85
APBB2-216	ENST00000508707	PTPRG	P23470	1445 aa		32.81	■■■□□ 2.84
APBB2-216	ENST00000508707	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		32.79	■■■□□ 2.84
APBB2-216	ENST00000508707	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		32.78	■■■□□ 2.84
APBB2-216	ENST00000508707	DISP1	Q96F81	1524 aa		32.77	■■■□□ 2.84
APBB2-216	ENST00000508707	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		32.74	■■■□□ 2.83
APBB2-216	ENST00000508707	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		32.71	■■■□□ 2.83
APBB2-216	ENST00000508707	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	32.7	■■■□□ 2.83
APBB2-216	ENST00000508707	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	32.64	■■■□□ 2.82
APBB2-216	ENST00000508707	GOLGA3	Q08378	1498 aa		32.62	■■■□□ 2.81
APBB2-216	ENST00000508707	KIAA0556	O60303	1618 aa		32.62	■■■□□ 2.81
APBB2-216	ENST00000508707	P3H3	Q8IVL6	736 aa		32.61	■■■□□ 2.81
APBB2-216	ENST00000508707	KIF21B	O75037	1637 aa		32.61	■■■□□ 2.81
APBB2-216	ENST00000508707	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	32.6	■■■□□ 2.81
APBB2-216	ENST00000508707	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		32.58	■■■□□ 2.81
APBB2-216	ENST00000508707	UACA	Q9BZF9	1416 aa		32.55	■■■□□ 2.8
APBB2-216	ENST00000508707	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		32.46	■■■□□ 2.79
APBB2-216	ENST00000508707	ABCC2	Q92887	1545 aa		32.43	■■■□□ 2.78
APBB2-216	ENST00000508707	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		32.41	■■■□□ 2.78
APBB2-216	ENST00000508707	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		32.38	■■■□□ 2.77
APBB2-216	ENST00000508707	MAPKBP1	O60336	1514 aa		32.37	■■■□□ 2.77
APBB2-216	ENST00000508707	SAMD9	Q5K651	1589 aa		32.36	■■■□□ 2.77
APBB2-216	ENST00000508707	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		32.31	■■■□□ 2.76
APBB2-216	ENST00000508707	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		32.31	■■■□□ 2.76
APBB2-216	ENST00000508707	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		32.3	■■■□□ 2.76
APBB2-216	ENST00000508707	ABCA8	O94911	1581 aa		32.29	■■■□□ 2.76
APBB2-216	ENST00000508707	ASXL2	Q76L83	1435 aa		32.28	■■■□□ 2.76
APBB2-216	ENST00000508707	ARID3C	A6NKF2	412 aa		32.27	■■■□□ 2.76
APBB2-216	ENST00000508707	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		32.22	■■■□□ 2.75
APBB2-216	ENST00000508707	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
APBB2-216	ENST00000508707	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		32.17	■■■□□ 2.74
APBB2-216	ENST00000508707	DIP2B	Q9P265	1576 aa		32.17	■■■□□ 2.74
APBB2-216	ENST00000508707	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		32.14	■■■□□ 2.74
APBB2-216	ENST00000508707	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	32.12	■■■□□ 2.73
APBB2-216	ENST00000508707	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
APBB2-216	ENST00000508707	ATP10B	O94823	1461 aa		32.11	■■■□□ 2.73
APBB2-216	ENST00000508707	KCNH8	Q96L42	1107 aa		32.11	■■■□□ 2.73
APBB2-216	ENST00000508707	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		32.09	■■■□□ 2.73
APBB2-216	ENST00000508707	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	32.06	■■■□□ 2.72
APBB2-216	ENST00000508707	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		32.06	■■■□□ 2.72
APBB2-216	ENST00000508707	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	32.04	■■■□□ 2.72
APBB2-216	ENST00000508707	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
APBB2-216	ENST00000508707	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		32.02	■■■□□ 2.72
APBB2-216	ENST00000508707	FMN1	Q68DA7	1419 aa		32	■■■□□ 2.71
APBB2-216	ENST00000508707	GLI2	P10070	1586 aa		32	■■■□□ 2.71
APBB2-216	ENST00000508707	CLIP1	P30622	1438 aa		31.96	■■■□□ 2.71
APBB2-216	ENST00000508707	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		31.93	■■■□□ 2.7
APBB2-216	ENST00000508707	TSPOAP1	O95153	1857 aa		31.92	■■■□□ 2.7
APBB2-216	ENST00000508707	CD109	Q6YHK3	1445 aa		31.85	■■■□□ 2.69
APBB2-216	ENST00000508707	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		31.82	■■■□□ 2.68
APBB2-216	ENST00000508707	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
APBB2-216	ENST00000508707	CEP162	Q5TB80	1403 aa		31.79	■■■□□ 2.68
APBB2-216	ENST00000508707	HECW1	Q76N89	1606 aa		31.77	■■■□□ 2.68
APBB2-216	ENST00000508707	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	31.76	■■■□□ 2.68
APBB2-216	ENST00000508707	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	31.76	■■■□□ 2.67
APBB2-216	ENST00000508707	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		31.75	■■■□□ 2.67
APBB2-216	ENST00000508707	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		31.75	■■■□□ 2.67
APBB2-216	ENST00000508707	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		31.71	■■■□□ 2.67
APBB2-216	ENST00000508707	KDM6B	O15054	1643 aa		31.7	■■■□□ 2.66
APBB2-216	ENST00000508707	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		31.7	■■■□□ 2.66
APBB2-216	ENST00000508707	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	31.67	■■■□□ 2.66
APBB2-216	ENST00000508707	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		31.65	■■■□□ 2.66
APBB2-216	ENST00000508707	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	31.64	■■■□□ 2.66
APBB2-216	ENST00000508707	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		31.62	■■■□□ 2.65
APBB2-216	ENST00000508707	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		31.59	■■■□□ 2.65
APBB2-216	ENST00000508707	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	31.57	■■■□□ 2.64
APBB2-216	ENST00000508707	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	31.57	■■■□□ 2.64
APBB2-216	ENST00000508707	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		31.55	■■■□□ 2.64
APBB2-216	ENST00000508707	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		31.5	■■■□□ 2.63
APBB2-216	ENST00000508707	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		31.48	■■■□□ 2.63
APBB2-216	ENST00000508707	NEO1	Q92859	1461 aa		31.46	■■■□□ 2.63
APBB2-216	ENST00000508707	PLCH2	O75038	1416 aa		31.44	■■■□□ 2.62
APBB2-216	ENST00000508707	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		31.44	■■■□□ 2.62
APBB2-216	ENST00000508707	KIF14	Q15058	1648 aa		31.43	■■■□□ 2.62
APBB2-216	ENST00000508707	RAPGEF3	O95398	923 aa		31.43	■■■□□ 2.62
APBB2-216	ENST00000508707	FANCA	O15360	1455 aa		31.42	■■■□□ 2.62
APBB2-216	ENST00000508707	AKNA	Q7Z591	1439 aa		31.41	■■■□□ 2.62
APBB2-216	ENST00000508707	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		31.4	■■■□□ 2.62
APBB2-216	ENST00000508707	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		31.39	■■■□□ 2.62
APBB2-216	ENST00000508707	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		31.36	■■■□□ 2.61
APBB2-216	ENST00000508707	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	31.29	■■■□□ 2.6
APBB2-216	ENST00000508707	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		31.27	■■■□□ 2.6
APBB2-216	ENST00000508707	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		31.26	■■■□□ 2.6
APBB2-216	ENST00000508707	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		31.26	■■■□□ 2.6
APBB2-216	ENST00000508707	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		31.26	■■■□□ 2.59
APBB2-216	ENST00000508707	ADGRL1	O94910	1474 aa		31.25	■■■□□ 2.59
APBB2-216	ENST00000508707	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	31.21	■■■□□ 2.59
APBB2-216	ENST00000508707	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	31.21	■■■□□ 2.59

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